DCAR_028276

Cds

>DCAR_028276cds ATGGAGTCGTACTGCATAGGTGGCCGGAACTTCACAACAATGGCGGTGTT CTCGACGTGTCCGACGTGGAGGCGACCGAGGAGGAAGAGGCTGAGAAGGA GTAATGTGAAGGTGAGTTGTGGAAGGAAGAGTGAGATGAGGTGTGTGAAG GAGGTTAGTAGTTGTGTTGCTGTTGTTGAAGATGAGGAGTTTGCTGATAA GGAGGATTTTGTTAAAGCCGGTGGCTCGGAGCTTTTGTTTGTTCAAATGC AGCGGAATAAGGCTATGGATACTCAGTCTAAACTTGCCCATAAATTGCCG CGAATACCTATTAGAGATAGTGTATTGGATTTGGTGGTTATTGGTTGTGG TCCTGCTGGTCTTGCTCTTGCTGCAGAATCAGCTAAGCTTGGTCTGAGAG TTGGGCTTATTGGTCCTGATCTTCCCTTTACTAATAATTATGGTGTATGG GAGGATGAATTTATAGATCTTGGACTTGAAGGGTGTATTGAGCATGTTTG GCGGGATACTATTGTATATCTTGATGATGGTGATCCTATTATGATTGGCC GTGCTTACGGAAGAGTTAGTCGCCATTTGCTTCATGAAGAATTGCTTAAA AGGTGTGTCGAGTCAGGTGTTTCGTATCTTAGCTCAAAAGTTGAAAAGAT TATTGAAGCTGGAGATGGCCACAGCCTGGTTGAGTGTGAAAATAATATTG TCATTCCATGCAGGCTTGCTACTGTTGCATCTGGAGCAGCTTCTGGGAAA CTTTTGCAGTATGAGGTTGGGGGTCCCAGAGTTTCTGTCCAAACAGCTTA TGGTGTCGAGGTTGAGGTGGAAAACAATCCATATGATCCCAGTCTAATGG TTTTCATGGATTACAGAGATTATACCAAACAAAAAGTTCCAGGCGTGGAG GCAGAATATCCAACATTTCTTTATGTGATGCCCATGTCCCCAACAAGGAT TTTCTTTGAGGAGACATGTTTGGCTTCAAAAGATGCGATGCCATTCGATC TACTGAAGAAAAAACTCATGTCAAGATTACAGACGATGGGAATTCGAGTT GCCAAGACATATGAAGAGGAATGGTCTTATATACCTGTTGGGGGATCTTT ACCTAATACTGAGCAAAAAAACCTTGCATTTGGTGCAGCTGCAAGCATGG TGCATCCAGCCACTGGCTATTCAGTTGTCAGATCATTGTCAGAGGCCCCA AATTACGCTGCTGTTATTGCAAACATCTTGAAAAGTAGTCAAATGAACGG GATGATTAATTATGGAAGATATACAGAGAACATCTCAATGCAAGCTTGGA AGACCCTGTGGCCTCAAGAAAGGAAACGCCAGAGAGCATTCTTTCTATTT GGACTAGCACTCATTTTACAGCTGGATATCGACGGCATAAGAACATTCTT CCAAACTTTTTTCCGCTTACCCACCTGGATGTGGCAGGGATTTCTTGGTT CTTCTCTATCCTCAGTCGACCTTGTACTATTTGCCTTTTATATGTTTATC ATAGCCCCACACCACTTGAGAATGTCCCTTGTAAGACATCTCCTTTCTGA TCCAACAGGAGCTACAATGCTTAATCAGTGTGCAAAAGAACAGCAACAAG CTGAGCATTCTAAAGCCTCCGTTCCATTGTCATCTGGTATACTTGCAAGC TGA

Gene

LCYE

Locus_tag

DCAR_028276

Name

DCAR_028276

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_028276pep MESYCIGGRNFTTMAVFSTCPTWRRPRRKRLRRSNVKVSCGRKSEMRCVK EVSSCVAVVEDEEFADKEDFVKAGGSELLFVQMQRNKAMDTQSKLAHKLP RIPIRDSVLDLVVIGCGPAGLALAAESAKLGLRVGLIGPDLPFTNNYGVW EDEFIDLGLEGCIEHVWRDTIVYLDDGDPIMIGRAYGRVSRHLLHEELLK RCVESGVSYLSSKVEKIIEAGDGHSLVECENNIVIPCRLATVASGAASGK LLQYEVGGPRVSVQTAYGVEVEVENNPYDPSLMVFMDYRDYTKQKVPGVE AEYPTFLYVMPMSPTRIFFEETCLASKDAMPFDLLKKKLMSRLQTMGIRV AKTYEEEWSYIPVGGSLPNTEQKNLAFGAAASMVHPATGYSVVRSLSEAP NYAAVIANILKSSQMNGMINYGRYTENISMQAWKTLWPQERKRQRAFFLF GLALILQLDIDGIRTFFQTFFRLPTWMWQGFLGSSLSSVDLVLFAFYMFI IAPHHLRMSLVRHLLSDPTGATMLNQCAKEQQQAEHSKASVPLSSGILAS *

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr8:9726067..9732165-

Type

gene

Unique Name

DCAR_028276.gene

Sequence Residues

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TAGGGTAAACTAATGTATCATTCATTATTTTTTTTATCAATAAGACTTCA
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AGTTTGTATTAATTTTTCTAGGTGTGTCGAGTCAGGTGTTTCGTATCTTA
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GAGTGTGAAAATAATATTGTCATTCCATGCAGGTAGAACCCAAACTCTTC
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TGTGTGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ATATATAAGCTTATTTGATAATATGGACTAATGCATCAGTTTCTATATAT
GGATGAGTGTCACTGCTGAACACAAATCACTATGTGCTCCTATGGTGTTA
GAATATTTAACGTCTCCCAGTTGCAACTCATAGGTATTATACCATTATCG
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TGTGGTATTACTAAATTGCTAAACTATAACTTCTTCTTGCAGGTGGAAAA
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CCAAACAAAAAGTTCCAGGCGTGGAGGCAGAATATCCAACATTTCTTTAT
GTGATGCCCATGTCCCCAACAAGGATTTTCTTTGAGGTTCAATATGTTTT
TCTGTCATCTTCTGAATAGACAAGTCCAGTTATCTCAATCATATCCAAAT
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GCCATTCGATCTACTGAAGAAAAAACTCATGTCAAGATTACAGACGATGG
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ACTTATTTACTCAATATTCACGGTTATTTATGCAGGAATGGTCTTATATA
CCTGTTGGGGGATCTTTACCTAATACTGAGCAAAAAAACCTTGCATTTGG
TGCAGCTGCAAGCATGGTGCATCCAGCCACTGGTAAGAAAAGAACTAGAG
TATCAGGATTCTGTCTTATCTCAGATTCTTGACATTCAATATATGAGCTG
CAGGCTATTCAGTTGTCAGATCATTGTCAGAGGCCCCAAATTACGCTGCT
GTTATTGCAAACATCTTGAAAAGTAGTCAAATGAACGGGATGATTAATTA
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TAAATCATTTTGTTTCTGTACTGTCCACTGAATCATTCACAAATCATAAC
TAGAAATTGTGTCTATGAATGCTTACCATGTAAAAGATCAGAATTTTGTC
TAACATGTAGATGTACAACCTGCCAGATTTGGCAGCTGCGATAGGCGACC
TTATGCAACACAGTTTTGTGATGTTTGTATATTACAATAAAGCTGCAGTT
TGGGTGTAGATTGACAACTAGGAGCAATGGTGTGTCTAAGACTCTTAGTC
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AGTGCAAAAGCAAAATGCTATACCTTTCGATGACCTAAAAGTAAGCCTTC
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GTAATTGATAGGTGCTAGTCCTGCTTGAAAAGGGAAATGCGAAACGTATA
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TGGAGAACCACTGTTGCAGTAAGTTATCATGTAATACCAGTTGTGTAGAA
TTGCTGGACTGCTGGTTGAATCAGAAAGCTGCTTGAACCAAGGGACCAAC
ATTTACTAGTCATATATGCATCATAACTTCATGATCATTCGCATAAGTTT
TTTGTAGTTAAGTGCTGCATTGTTATATATGTTATTTTCTGACTTAAAAT
CTGATCATTTACTTTTAGCTTGGAAGACCCTGTGGCCTCAAGAAAGGAAA
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CCACACCACTTGAGAATGTCCCTTGTAAGACATCTCCTTTCTGATCCAAC
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TTTACATTTTCTCCTTCGGTCTATGTTCATCAGCTTGGTACTTTTTTGCA
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TTGGATTTGCTAATGTGCTATACCTAGGAGAGGGGGAAGAGAGGGATCTC
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Sequence Length

6098

Sequence MD5 Checksum

5a3d0266c280895123d307328d28effa

Relationship

The mRNA DCAR_028276 is a part of Gene DCAR_028276
The Genetic Marker MK018786 8_9727455 is located in Gene DCAR_028276
The Genetic Marker MK000041 LCYE is located in Gene DCAR_028276

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False