DCAR_001287

Cds

>DCAR_001287cds ATGGCGCGGAGTGTTGAGCTGACCGGAAAAGACTCGCCGGCCGGCGACCT CGAGGACGTGCGGCTACTCGACTCGTACGAAGACGAAGAAGCGGAATTGA GTAAGGTAGAGCAAGGAATGAGCAGAATTCAGGTGAGAATCACCGGAATG ACGTGTGCGGCGTGCTCGAATGCTGTGGAAACTGCTCTGATCAGCTTGAA CGGCGTTGTTAGCGCTTCTGTTGCGCTTCTTCAGAACAAAGCCGACGTCG TTTTTCATCCTTCTGTCGTCAATGACGATGATATTAAGAATGCAATTGAA GATGCTGGTTTTGAGGCAGAGATTATACCTGAAACTAGTTCATCTCAAAC AAAATCACATGGAAATGTGGTGGGACAGTTTACTATTGGAGGCATGACGT GTGCAGCTTGTGTAAATTCTGTTGAAGGAATTTTGAGAAAGCTTCCTGGT GTGAAGAGGGCAGTTGTGGCATTGTCGACCTCTTTAGGTGAGGTCGAATA TGACCCTACTATTATTAGTAAGGATGACATAGTGGATGCTATTGAAGATG CTGGCTTTGAGGGTTCACTTGTACAGAGCAGCCAGCAGGATAAAATTATA TTAGTAGTTAATGGGATAACAAGTGATTTTGATGTACAGCTGTTAGAAGG AATACTATGCAACTTGAAGGGTGTGCGACAGTCCTGTTTCAACAGGTTAT CAAGAGAACTAGAAGTACTCTTTGATCCCATAATTCTTGGTTCTAGATTG CTCGTTGATGAGATTCAAGGACGAAGCTCCGGAAAATTTAATCTACAAGT CAGAAATCCTTACACAAGAATGACTTCCAAGGATCTTGAAGAATCCTCAA AAATGTTTCGACTTTTCACGACCAGTCTCATTCTTAGTATTCCAGTCATA TTCATGCGATTTGTTTGTCCAAGCATCCCTATACTGTATGCCTTATTGCT TCGGCAATGTGGGCCATTCCAAATGGGTGATTGGTTAAAGTGGGCCTTAG TGAGTGTCGTGCAGTTTGTTGTTGGGAAGCGATTTTATGTTGCTGCGTGG AGAGCACTTAGAAATGGTTCGACAAACATGGATGTTCTTGTAGCATTGGG AACTTCAGCTTCATACTTTTATTCTGTCTATGCACTATTATATGGTGCAG TAACTGGTTTCTGGTCGCCTACGTACTTTGAAACCAGTGCAATGCTGATA ACATTTGTGCTACTGGGGAAGTACTTGGAAACTCTTGCAAAAGGAAAAAC TTCAGATGCTATAAAGAAGTTGGTAGAACTAACACCAGCAACAGCTTTAC TGCTTCTCAAAGACAAAGGTGGCAAGGTTGTTGGAGAAAGGGAGATAGAT TCTCTACTGATTCAACCTGGTGACATGCTTAAAGTTCTGCCTGGCACAAA AGTTCCTGTTGATGGCATGGTTGTATGGGGTTCAAGTTACGTCAATGAGA GTATGGTTACCGGTGAATCTGAACCGGTTTCAAAGGCAGCTAATGCTGCA GTAATTGGTGGTACTATAAATTTAAATGGTTCCCTTCACATACAGGCAAC TAAAATAGGTTCCGACACAGTTTTAAGCCAGATTATTTCTCTGGTTGAGA CAGCACAGATGTCAAAAGCTCCAATTCAGAAATTTGCTGATTATGTGGCA AGTATTTTTGTCCCTACTGTCGTTGCTTTCTCATTGTTGACACTAATTGG GTGGTATATCGGTGGAGTTTTTGGTTTCTACCCAGTAGAATGGCTGCCTG AAAATAGCAATAACTTTGTTTTTGCCCTCATGTTTGCGATATCCGTGGTA GTAATTGCTTGTCCATGTGCACTTGGGTTGGCCACCCCAACAGCTGTCAT GGTTGCAACAGGGGTTGGAGCTAATCATGGGGTGCTAATTAAGGGAGGGG ATGCATTGGAGAGGGCACAGATGGTTAATTATGTGGTGTTTGATAAAACA GGAACTTTAACCCAAGGAAAAGCAACAGTCACAACAGCGAAAGTTTATAC AGAAATGGATCGTGGAGAATTTCTCACATTGGTAGCTTCAGCGGAGGCCA GCAGTGAACATCCTTTAGCTAAAGCAATAGTGGAATATGCTCACCATTTC CACTTCTTCGAGGACCCTTCAGCTACCACAGATATTCAATACCTTGAGAA GGAGCACAAGTACTCAGGATGGCTTCTCGAAGCATTTGATTTTACTGCGC TTCCCGGAAGAGGCGTCCAATGTCTCATTAATGGAAAACAGATATTGGTT GGTAATCGTAGTTTGCTTACAGAAAACGGTGTTGCTATTCCGACTGATAC TGAGAATTTTATGGTAGAACTGGAAGAAAGTGCGAAAACTGGCATACTAG TGGCATACAATGGTGTCTTAATTGGCATTCTGGGAGTAGCTGATCCATTG AAGAGAGAAGCTGCTGTAGTAGTGGAAGGCCTCATGAAAATGGGTGTCAA ACCTGTCATGGTTACTGGGGATAACTGGAGGACAGCTCATGCTGTGGCTA AGGAGCTTGGTATTCATGACGTACGAGCAGAGGTGATGCCAGCTGGTAAA GCTGATGTCATTCGTTCATTTCAAAAAGATGGAAGCACAGTTGCTATGGT GGGTGACGGTATCAATGATTCACCAGCTTTAGCAGCAGCAGATGTTGGTA TGGCTATCGGGGCAGGAACAGATATTGCAATTGAAGCAGCTGATTATGTG CTGATGAGAAATAATCTAGAAGATGTAATAACGGCCATTGATCTCTCAAG AAAGACGTTCAGTCGAATCCGATTAAATTATGTGTTTGCCATGGCTTACA ATGTCATTGCAATTCCTATAGCTGCTGGAGTTTTTTTCCCTCTCGTAAAG CTCAAATTGCCTCCATGGGCAGCCGGTACATGCATGGCTCTGTCATCTGT AAGTGTCGTGTGCTCTTCTTTACTTCTTAGGAGATACAAAAGACCCAGAC TTACCACAATTCTGGAAATAACTATAGAGTAG

Locus_tag

DCAR_001287

Name

DCAR_001287

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_001287pep MARSVELTGKDSPAGDLEDVRLLDSYEDEEAELSKVEQGMSRIQVRITGM TCAACSNAVETALISLNGVVSASVALLQNKADVVFHPSVVNDDDIKNAIE DAGFEAEIIPETSSSQTKSHGNVVGQFTIGGMTCAACVNSVEGILRKLPG VKRAVVALSTSLGEVEYDPTIISKDDIVDAIEDAGFEGSLVQSSQQDKII LVVNGITSDFDVQLLEGILCNLKGVRQSCFNRLSRELEVLFDPIILGSRL LVDEIQGRSSGKFNLQVRNPYTRMTSKDLEESSKMFRLFTTSLILSIPVI FMRFVCPSIPILYALLLRQCGPFQMGDWLKWALVSVVQFVVGKRFYVAAW RALRNGSTNMDVLVALGTSASYFYSVYALLYGAVTGFWSPTYFETSAMLI TFVLLGKYLETLAKGKTSDAIKKLVELTPATALLLLKDKGGKVVGEREID SLLIQPGDMLKVLPGTKVPVDGMVVWGSSYVNESMVTGESEPVSKAANAA VIGGTINLNGSLHIQATKIGSDTVLSQIISLVETAQMSKAPIQKFADYVA SIFVPTVVAFSLLTLIGWYIGGVFGFYPVEWLPENSNNFVFALMFAISVV VIACPCALGLATPTAVMVATGVGANHGVLIKGGDALERAQMVNYVVFDKT GTLTQGKATVTTAKVYTEMDRGEFLTLVASAEASSEHPLAKAIVEYAHHF HFFEDPSATTDIQYLEKEHKYSGWLLEAFDFTALPGRGVQCLINGKQILV GNRSLLTENGVAIPTDTENFMVELEESAKTGILVAYNGVLIGILGVADPL KREAAVVVEGLMKMGVKPVMVTGDNWRTAHAVAKELGIHDVRAEVMPAGK ADVIRSFQKDGSTVAMVGDGINDSPALAAADVGMAIGAGTDIAIEAADYV LMRNNLEDVITAIDLSRKTFSRIRLNYVFAMAYNVIAIPIAAGVFFPLVK LKLPPWAAGTCMALSSVSVVCSSLLLRRYKRPRLTTILEITIE*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr1:4086332..4093186-

Type

gene

Unique Name

DCAR_001287.gene

Sequence Residues

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ATACAAGTCAAGAACTCATGTATCTGTCCCAGTTCTCACCTGGGTATCTT
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ATTGTTGACACTAATTGGGTGGTAAGTTCGCAACTATCTTTTGGACAGTT
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ATCATGCACATCTTGTGGATACAATGGTTTTCAAATTAATCCAATATTAC
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ATATAGCTACATCATGTGTCAGTCATGCCTCAATACTGGGTGCATTCTTA
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CTCAAATTTTTTTAACTGACAACCCACCCATGTATTGTGTGAGAATTTTT
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TGGACCATAAATAGGGTAGATAGCAAAATTTCGGATAAATTGTTGCATAA
GTACTTTTCTTGATAACATTAAACTTTGTGTGTAGCTTGGTATTCATGAC
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CACCAGCTTTAGCAGCAGCAGATGTTGGTATGGCTATCGGGGCAGGAACA
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AGATGTAATAACGGCCATTGATCTCTCAAGAAAGACGTTCAGTCGAATCC
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ACTATAGAGTAGGAACTTAACTGTTAAAAATCAAAAATCAAAGAAACAAC
AGGA

Sequence Length

6854

Sequence MD5 Checksum

be1d09754a1132ebef2dd3b0d60438a8

Relationship

The mRNA DCAR_001287 is a part of Gene DCAR_001287
The Genetic Marker MK016724 SSR0375 is located in Gene DCAR_001287

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False