DCAR_000204 | CarrotOmics Tripal4

Cds

>DCAR_000204cds ATGGCGACGAGCTCCGACCCGAATAACTCAAATCCCCCCGACGACCCGAA CCCCAGCTCCGAAATCTACACCTACGAAGCCCCATGGCACGTCTACGCCA TCAACTGGTCCGTCCGGCGCGACAAGCCTTACCGTCTCGCCATCTCTAGC CTCGTCGAACACTACCATAACCAAGTTCAAATCGTCCATCTTAACGATGT TGTTGGCGAGATTAAACCCGAACCGGGTCTCACTTTCACTCATCCTTACC CACCCACCAAAACTGTTTTTATACCCGACCCGGAATGTCAGAAGCCCGAT CTTTTCGCCACTTCTAGTGATTTCCTGCGTATCTGGGAGGTTAAGGGTGA TTCGGATTCAGGTCGGGTCGAGCTGAAATCGGTGCTGGATGGGAATAGGA GTAGTGGGTTTTGTGGGGCCTTGACTTCTTTTGATTGGAATGAGGCGGAC CCGGGTCGGGTCGGGTCGAGTAGTATTGACACTACTTGTACTATTTGGGA TGTGGAGAGGGAATGTGTGGATACTCAGTTAATTGCTCATGATAAGGAGG TGTATGATATTGCTTGGGGTGGTGTGGGTGTTTTCGCTTCGGTTTCGGCT GATGGGTCAGTTAGGGTTTTTGATTTGAGGGATAGGGATCATTCTACTAT CATATATGAGAGCCCGGAACCCGATACGCCTTTGGTTAGATTGGGTTGGA ACAAGCAGGACCCTAGGTATATGGCTACTGTTGTAATGGATAGTACTAAG GTTGTGATTCTTGATATCAGGTATCCTACATTGCCTGTTGTGGAGTTGGA AGGGCATTTGAATAATGCTAATGCCATTGCATGGGCTCCACATAGTGCTA GTCATATCTGTTCTGCTGGGGATGATATGCAGGCGTTGATTTGGGATATT TCGAATATGGGGAAAGCTGTGGAAGGTGGATTGGATCCAATTTTGGCCTA TACGGCAGCTGCTGAGATTGAGCAGTTGCAGTGGTCTTCATCACAGCCGG ATTGGGTTGCTATTGCGTTTTCAAATAAGCTTCAGATTCTCAGGGTATGA

Locus_tag

DCAR_000204

Name

DCAR_000204

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_000204pep MATSSDPNNSNPPDDPNPSSEIYTYEAPWHVYAINWSVRRDKPYRLAISS LVEHYHNQVQIVHLNDVVGEIKPEPGLTFTHPYPPTKTVFIPDPECQKPD LFATSSDFLRIWEVKGDSDSGRVELKSVLDGNRSSGFCGALTSFDWNEAD PGRVGSSSIDTTCTIWDVERECVDTQLIAHDKEVYDIAWGGVGVFASVSA DGSVRVFDLRDRDHSTIIYESPEPDTPLVRLGWNKQDPRYMATVVMDSTK VVILDIRYPTLPVVELEGHLNNANAIAWAPHSASHICSAGDDMQALIWDI SNMGKAVEGGLDPILAYTAAAEIEQLQWSSSQPDWVAIAFSNKLQILRV*

Sequence Coordinates

DCARv2_C10692027:677..2333-

Type

gene

Unique Name

DCAR_000204.gene

Sequence Residues

GTTATTGTGCTGCATTAAAAAGCTAAAAAATTCCGTTTTTCTTTTTTGCA
AAACACTCTGAAACAACATTTGTTGTTCCTTTAAAATGATAAATAATATA
TCTGACAAAAATAAAAATAAAACAATAACAAATAATATAATTATACTTAG
CAATTCCCCGTAAAACCAACAAAGTCTGGTATGGCTTAGAGTTAACACAA
GAAAGAACCGATACAAAAACCTTAACTGTCGAACAAGTACAAAGCAGGAC
AGTGCAGTCCAGTGTGCAAAACTTGCTGGCAGACATACAAAATGGCGACG
AGCTCCGACCCGAATAACTCAAATCCCCCCGACGACCCGAACCCCAGCTC
CGAAATCTACACCTACGAAGCCCCATGGCACGTCTACGCCATCAACTGGT
CCGTCCGGCGCGACAAGCCTTACCGTCTCGCCATCTCTAGCCTCGTCGAA
CACTACCATAACCAAGTTCAAATCGTCCATCTTAACGATGTTGTTGGCGA
GATTAAACCCGAACCGGGTCTCACTTTCACTCATCCTTACCCACCCACCA
AAACTGTTTTTATACCCGACCCGGAATGTCAGAAGCCCGATCTTTTCGCC
ACTTCTAGTGATTTCCTGCGTATCTGGGAGGTTAAGGGTGATTCGGATTC
AGGTCGGGTCGAGCTGAAATCGGTGCTGGATGGGAATAGGAGTAGTGGGT
TTTGTGGGGCCTTGACTTCTTTTGATTGGAATGAGGCGGACCCGGGTCGG
GTCGGGTCGAGTAGTATTGACACTACTTGTACTATTTGGGATGTGGAGAG
GGAATGTGTGGATACTCAGTTAATTGCTCATGATAAGGAGGTGTATGATA
TTGCTTGGGGTGGTGTGGGTGTTTTCGCTTCGGTTTCGGCTGATGGGTCA
GTTAGGGTTTTTGATTTGAGGGATAGGGATCATTCTACTATCATATATGA
GAGCCCGGAACCCGATACGCCTTTGGTTAGATTGGGTTGGAACAAGCAGG
ACCCTAGGTATATGGCTACTGTTGTAATGGATAGTACTAAGGTTGTGATT
CTTGATATCAGGTATCCTACATTGCCTGTTGTGGAGTTGGAAGGGCATTT
GAATAATGCTAATGCCATTGCATGGGCTCCACATAGTGCTAGTCATATCT
GTTCTGCTGGGGATGATATGCAGGCGTTGATTTGGGATATTTCGAATATG
GGGAAAGCTGTGGAAGGTGGATTGGATCCAATTTTGGCCTATACGGCAGC
TGCTGAGATTGAGCAGTTGCAGTGGTCTTCATCACAGCCGGATTGGGTTG
CTATTGCGTTTTCAAATAAGCTTCAGATTCTCAGGGTATGAATTGTGTTC
ACATTATACCATGTAGGTCACATGTAAGACTTGTCATATATCTTGTTTTC
ATGTTTTGTTGACTGTAGATTGTTTTTCATATTTTGTTGACTGTAGATTT
TTTCATGTTTTGTTGACTGTAGATTGTTGGGGATCAACTGTTATTCTTTT
CCTTTAGATTTGTGCTTGAAAATATGGTAATTGACGATAGATTGATGGGA
ATTCTCTGTTTGTTAATAGTTTATCTGCGACTTGCCTTGCTCGATTGTGG
CCTTGTGATTTGTCTATTGATTGTGCATTTGCACATTATGTAATACTTCT
TTTTAC

Sequence Length

1656

Sequence MD5 Checksum

2bd9710544fb612bc6d2b0dd13579d0b

Relationship

The mRNA DCAR_000204 is a part of Gene DCAR_000204

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False