DCAR_000177 | CarrotOmics Tripal4

Cds

>DCAR_000177cds ATGGTTTCTCCTTCACAAGCTGCTCAATTGGCTTCAAACTATGGCAAAAA TGGATTCAAAACCTTGAAGCTCAAGGTGGGTAAGAATTTGAAAGGAGACA TAGAAGTGCTCCAAGCGATAAGAGCAGCCCACCCTGATTGCTTGTTCATT TTAGATGCTAATGAAGGTTACACCTCTACAGAAGCTATCCAAGTTCTCGA GACACTGCATGAAATGAAGGTTACTCCAGTTCTCTTTGAACAGCCTGTTC GTCGGGATGACTGGGAAGGTCTTGGTCGTGTTACTCGGATCGCTAAAGAA AAATATGGGGTATCTGTGGCCGCGGATGAAAGTTGCCGTGTTCTAGCTGA TGTAGAGAAGATAGTTAAAGGAAATTTAGCTGATGTCCTTAATGTCAAGT TTGCCAAACATGGGGTTATTGGAGCCCTTAAAATCATCGAGTTGGCACAG GCATATGGATTGCATCTGATGATCGGTGGTATGATTGAGACTAGGCTTTC TATGGGTTTCGCAGGTCACCTTGTCGCAGGGCTTGGATGCTTCAAATTCA TTGACCTAGATGGACCACTACATCTATCTGAGGATCCAGTTGTTAACGGT TATGAAGTTTCTGGTCCGGTGTATAAATTCACAAATGACAGCGGGAACGG AGGTTTCTTTGATTGGGATGACATGGAGTAG

Locus_tag

DCAR_000177

Name

DCAR_000177

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_000177pep MVSPSQAAQLASNYGKNGFKTLKLKVGKNLKGDIEVLQAIRAAHPDCLFI LDANEGYTSTEAIQVLETLHEMKVTPVLFEQPVRRDDWEGLGRVTRIAKE KYGVSVAADESCRVLADVEKIVKGNLADVLNVKFAKHGVIGALKIIELAQ AYGLHLMIGGMIETRLSMGFAGHLVAGLGCFKFIDLDGPLHLSEDPVVNG YEVSGPVYKFTNDSGNGGFFDWDDME*

Sequence Coordinates

DCARv2_C10676900:6..1877-

Type

gene

Unique Name

DCAR_000177.gene

Sequence Residues

CTCAGTTTATATATTCAAACAGTACATAGACTTAAGCTTATCCATCTCTA
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TAACCTTGACCAGCCATCTTCTTATCCTCTTGTATATGCAAATCTTCATC
CAGATTTCATGAACTTTGTCTCCAGGCAATTATCTCCCGCCCTCATATTT
AATTTTCAGGATCATTTATTCAATCCAGACATCAGCCCTTTTATATATCC
ATCTATCCATGGAACATGTGGATGTAAAAACACTAGCTGCATATAAGCAT
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TCGAGACACTGCATGGTGAAGATCCTTATACCTTGTTATTAGAACTTGAC
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TGATCGGTGGTATGATTGAGACTAGGCTTTCTATGGGTTTCGCAGGTCAC
CTTGTCGCAGGGCTTGGATGCTTCAAGTAAGCAGTATATAGCTTAGTTGC
ATTTTAGAAAATTAAATTCATATGTATGCTGATATATATACTACTCTATT
ACCTCTCCTCGATAAAATTGTGTGTTCACAACAACTTCTATTAGTTTAGT
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TATGAAGGTAAAATTGTCTTAATTTACAGAGCTTCTTTTAATTCCTTAGA
ATACTTCAGTTTTGTTTTTTTGTACTTTTTAGTTTCGAATACAGGCGTTT
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CAAATGACAGCGGGAACGGAGGTTTCTTTGATTGGGATGACATGGAGTAG
TAGGTAATCATTTAGACTTTTTATTAAAAATCTACATTTTATGTCACAAT
CAGCTCAAGTCAAATGAGGTTTTTTCAAAAAGGCCAATTCTATCTCATTT
CAGAGGTTAACATAATAATATTGTTTTATTTGCCATGTTAGGACCCTTTT
ATGGGCCTACTCTTTGTGTATGATAGTCATAAAACATCATTTTTAAGCTT
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AAAATACTTTTTCGCACAAAACAGTCAGCGTTCGGGGTTCTCACCTCTTT
AGACAGGCAATTCAAGTACTTGCGATGCTGAATACATGTATGTTCATGAT
GGTGCCGATCAGACATTTTTG

Sequence Length

1871

Sequence MD5 Checksum

7da40b0d5c0b2069e059ff14ec970829

Relationship

The mRNA DCAR_000177 is a part of Gene DCAR_000177

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False