DCAR_010440

Cds

>DCAR_010440cds ATGGCAGCAGCAGCAGCGAGGGCCTGGTTTAGCAGCAGCTGCATTCACAA TACATATATATGTATGCATCCACATGACGCTCTCGTCCTCGCCGCCAACA ACAATTTTAAACTGCAAACACGACGTCGTTCCTCCACCTCATCCATCAAT TCCACCAACACCTTCACTTGGGATGACGTCACCCGCATTTCTCAGTCTCA ACCTCTTAATCTCCACGCTTTTCTCCACAAAGTCAAGCTCTGCAATCGCG GCGCTGAGAATATCGATGATTTTATTCCCTTTGTCATCCAGAATAATGTT GTTGGTTATGTTCACGAGGGTTTTGCAGGCCATCTAAGGAAGTTCCCAGA TGTGTTTATATTCCCTGAGGATGATTCTCAGGCTATCCATTTTGGGGATC ACGTCAGGCTACACCCCGCGCTGACAACTCCTGAGGATAGAACTTACGCT GTTGGAGATGTAATAGAATGCTTAGGTGAAGAAATGATTCCAGGAATACG GAATGAGCTCTACCCAGTTATGTCGTCTTTTGGTACACAAGCATTTTTCT CGCTGGAACGTGCTGCAGCACCTTACTTTGGGATAAAGGCCTATGGAGTT CACATGAATGGCTTTGTTGAAAAGGATGGGCAAAAATATCTGTGGATAGG GAAGAGAGATGAATCCAAATCCACTTACCCAGGAATGCTTGATCATCTAG TTGCTGGAGGACTGCCTTATGGTATATCATGTGGAGACAATATTGTGAAG GAATGTGAAGAGGAGGCAGGGATAGTGAAATCTATTGCTAGTCAAGCAAT CCCAGTTGGAGTCGTCTCCTATATGGATATTGATGCATACAGATACAAAC GAGATGTTCTGTTCTGTTATGATCTAAAACTTCCAGAAAGTTTTGTTCCC AAAAATCAGGATGGAGAGGTGGGGAGCTTCAGATTGATCCCTGTACAACT TGTAGCAAATGTCATACAGAAGACAGAGTTCTTTAAACCAAATTGCAATC TTGTCATCATTGATTTCCTGTTTCGACATGGGTACCTAAAACCGGAAGAT TCTGGTTACTTGGAACTCTTGCATAGTCTGAGGAAGGTGGCTTGA

Locus_tag

DCAR_010440

Name

DCAR_010440

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_010440pep MAAAAARAWFSSSCIHNTYICMHPHDALVLAANNNFKLQTRRRSSTSSIN STNTFTWDDVTRISQSQPLNLHAFLHKVKLCNRGAENIDDFIPFVIQNNV VGYVHEGFAGHLRKFPDVFIFPEDDSQAIHFGDHVRLHPALTTPEDRTYA VGDVIECLGEEMIPGIRNELYPVMSSFGTQAFFSLERAAAPYFGIKAYGV HMNGFVEKDGQKYLWIGKRDESKSTYPGMLDHLVAGGLPYGISCGDNIVK ECEEEAGIVKSIASQAIPVGVVSYMDIDAYRYKRDVLFCYDLKLPESFVP KNQDGEVGSFRLIPVQLVANVIQKTEFFKPNCNLVIIDFLFRHGYLKPED SGYLELLHSLRKVA*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr3:23156900..23161885+

Type

gene

Unique Name

DCAR_010440.gene

Sequence Residues

ATGGCAGCAGCAGCAGCGAGGGCCTGGTTTAGCAGCAGCTGCATTCACAA
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ACCTCTTAATCTCCACGCTTTTCTCCACAAAGTCAAGCTCTGCAATCGCG
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GTTTTGGGCACAATTTTATAAAAAGCGCAAGGCCTAATTTGAAGCGCGAC
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GGTATGGATTGTCGTGTTGAATATTTGAATTTAGTTGGAATGTTGTCTTT
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CCTAAGATTCCCAATGTTGAAGCCATGGAGGAATATCTTAGATGGAAATA
TGATATATAGTTGAGATGCGACTCATGCCTATAAATGAAAATACTCCCTG
GTCTGATAATAATTAAATATGGAACTCAAGCTTTACCATTTATGCGAGAA
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TAACCGACTAAATGCTTGACCAAATTTCTTTACTACAGAAAATGTAAAAT
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TGTTTATATTCCCTGAGGATGATTCTCAGGCTATCCATTTTGGGGATCAC
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CACTGGATTTCTGTTTATAGTTGCATGTTGTTTGACTATAAGCAGCTCTA
CCCAGTTATGTCGTCTTTTGGTACACAAGCATTTTTCTCGCTGGAACGTG
CTGCAGCACCTTACTTTGGGATAAAGGTGCGTTAAGCCCTTTGTTGAAAT
GTTATTTTCACTAAATAAGTATATATGGCCAATTAACAGTTAGTTTTTGT
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ACCTCAAGTTTTAAGGAGGAGACCTTAATTGGATCGGACCTGATGCGGAG
CAAATAATAAAGGATTTAGATTTAGTTGTTACTTATCTTATATGTAATTG
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TTAAGGCTTTAGGAGAATACCTTAATATGGACTTTACATTGAAATTATCC
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TCTCTTATTTTCGTCATTATTATGACAGCCTTATGGTATATCATGTGGAG
ACAATATTGTGAAGGAATGTGAAGAGGAGGCAGGGATAGTGAAATCTATT
GCTAGTCAGTAAGTTCTCCCTGACTGTTGATCTGTCATAATAGAGCTTAT
ATAGCTAGGATGTTTTAACTGTATAGGTTTTGATTCATATAAACTTCATA
TTGTTTCAACATCTTAGTCTTAGCATGTTATTTGAACAGAGCAATCCCAG
TTGGAGTCGTCTCCTATATGGATATTGATGCATACAGATACAAACGAGAT
GTTCTGTTCTGTTATGATCTAAAACTTCCAGAAAGTTTTGTTCCCAAAAA
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ATTCTGAAATGATAGGAGGAGAAGTTTGCATTCCCTGGTTGAAGTTCTTT
GCTTATTTGTTGTTGGTGTAAAAAATGCACCTCCTTAGTGAAATACACAA
TTATTATGGTTATAATACTTTCTATGGGCTGGTGTATCTGTTATTGTTTA
TTGTGTTTCTCGTCAAGCACAAGCATAAACATAGAAAAGCTGGATCCATT
TTTCTAAACAGGGATGTGTACTTTTTTTATGGTTATAATACTTTCTATAG
GCTGGTTATCTATAATTGTTTATTGTGTTTCTCGTTAAGCACAAGCATAA
ACATAAAAAAGCTGGATCCATTTTTCTAAACAGGAATGTGTACTTAACAT
CTTGATATCAAAGTGTAAATTTGTATGAACTGTTTTTTTATGTTAAATAT
GAAGGGATTTGAAGTTAGCACATTAACAACTTCACAAGATCCAGTTATTC
TTGTCCCTTTCCTATATAATAGCTTTTTTTGTTAAGTGCTCGTGTTGTAA
ACAGCACCCCACTATCAAAAAAACAAACAAATGTTTTTTTTTTTTTNCAC
CCCACTATCAAAAAAACAAACAAATGTTTTTTTTTTTTTGTATTATGTGT
TCGACATATATATAATCATCTACCAGATAATAGTTATAATTGTGCTGAGC
ATACGTTATATACGATAAAAATATAACTATGGTTTGACATAATTAAAAGT
TCTCTTTCTGTCCCACTTTTGTTTATATTTGGGTTAGGCACAAAGTTAAT
GAAAAGTGTAAAATATAGTGGAGAAGAGTAAGAAAAGTGGGTACAGTGAT
TGGACCCATCAATATTAACTCGATAGATTTTGCAATCTTAAAAATATATT
TTAGCAAATGTTTGATTTCATGTTTCAGATGGAGAGGTGGGGAGCTTCAG
ATTGATCCCTGTACAACTTGTAGCAAATGTCATACAGAAGACAGAGTTCT
TTAAACCAAATTGCAATCTTGTCATCATTGATTTCCTGTTTCGACATGGG
TATGCAGTTTACTTTGCAGCATTTCCATATGTAATAGATGAATGGGTCTA
CTGCGTGCAAAATGTTGATTTAATAAATTTGATTTCTTAGAGAAGGGGAC
GTGAAACTAAGATCATACGATGTTGATATAAACAGGTGACAACATGATTA
CACGTTTTATACCAAACTGTTATAGCTTAAAAACCAGTTACTTACACAAG
ACCTTGTGGCCTTCTTAGTAGTTCTACCATAAAGTGTTCTTGCAACTGAG
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GTTTCAAGCAACTCTTAAGTCTTAAGGGGAAAAAGAAGTCATTACTGTTG
TTTAATGGTGCAAAGTCTTTTTCGGGTTTTTTAAGGCGCAGTAGTGCTTT
AAGGTTGATTAAAAGTATATATTAAGTTTACCTAATGAAAGACGAGTACA
TATATTCTGCAACACTAATTATTCTTGGATGCATACTTTGCTTTGACTAA
AATTTGGTTTGTGTGTGAATCATCTATGCATAGCTGTAACAAGTACATTT
CATTTGGCTTCAGTAAAGTTACTTTACAGGCTAAAAGTAAGTTTGTATAT
TACTGTTGATAATATTGGCAGGTACCTAAAACCGGAAGATTCTGGTTACT
TGGAACTCTTGCATAGTCTGAGGAAGGTGGCTTGA

Sequence Length

4985

Sequence MD5 Checksum

3852652c13b937e05641832c7da36919

Relationship

The mRNA DCAR_010440 is a part of Gene DCAR_010440
The Genetic Marker MK002210 ESSR-105 is adjacent to Gene DCAR_010440

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False