DCAR_007438

Cds

>DCAR_007438cds ATGATCTTCTCAAGAATTGGGCGTTCTTTATCACGCTCCCCGCGTTCCAC AAAGAGTTTGTTGACTAATGGGAGAGCAGCTCTTGTGGGTGAATCAATTT TACAAGGTCCTGGTAGTGTTGATGGGAAATTAGGGCTTGTGAGGAAGTAT TTAGCTGCTAATGGAAACCTGGCTGTTTCCAAAGCTTATTTGTCTGATTT CAGATATCTTCTTGCAAACCCTAGATTGCATAGATATTTCTCCACTGAAG AGGGGCCTAAAAAGAAGAATTATGAGAACTTCTATCCCAAAGACAAGAAG GAGATTCCGAAAGGGGATGAACAGAAGTCACAGTCGAAAGAGGATTCAAA CACAGATGATGGTGGTGACTTTCAGTCAGCTTTTATGAAGCAAATCCAGA ATCTAATTATCCCCTTGTTGGTGATTGGAATGTTTTTCTCATCATTTCCT TTTGGTGGCCGTGAAGAGAAACAGATTAGTTTCCAAGAGTTCAAAAATAA GCTTCTGGAACCAGGTTTAGTGGATCATATAGTGGTTACTAATAAAACAG TTGCTAAAGTGTATGTAAGAAGCACACCCTTAAATCGGTCCAGAGGTGAT GGACCGGTTGCTCAAGGTCCTGATACTGATAATGACACAAGAGGTAAGAA AGGCCAGTATAAGTATTATTTCAATATTGGAAGCATAGAATCATTTGAAG AGAAATTAGAGGAAGCCCAGGAAGCCTTAGGTATTGACCCCCATGATCAT GTTCCCGTTACCTACAATTCTGAAATTGGGTGGTATCAAGAAGTGATGAG GTTTGCGCCAACACTTTTGTTATTGGGAACTCTTATGTACATGGGACGGA AAATGCAGGGTGGATTAGGTGTTGGAGGTGGTGGTGGAAAAGGTGCTCGT GGGATATTTAACATAGGGAAAGCTCACATTACCAAGGTGGACAAAAATGC AAAAAACAAGGTTTATTTTAAAGATGTTGCTGGCTGTGATGAAGCAAAGC AAGAAATCATGGAGTTTGTACACTTTCTCAAGAACCCTAAGAAATATGAG GAACTAGGTGCAAAAATTCCAAAAGGTGCTTTATTGGTTGGACCTCCTGG AACAGGTAAAACTCTTTTAGCCAAGGCAACTGCTGGAGAATCCGCTGTGC CTTTCCTGTCTATATCTGGTTCAGATTTTATGGAAATGTTTGTCGGGGTT GGACCATCTAGGGTGAGAAACTTGTTTCAAGAAGCAAGACAATGTGCACC TAGTATTATATTTATTGATGAGATCGATGCTATTGGTCGAGCAAGAGGAC GGGGGGGTTTCTCAGGTTCTAATGATGAGCGTGAAAGCACACTCAATCAG TTGCTTGTAGAAATGGATGGATTTGGTACCACTTCTGGAGTAGTTGTCCT TGCTGGTACTAATAGGCCTGATATATTAGACAAAGCCCTTTTAAGGCCTG GCAGATTTGATAGGCAGATCTCTATAGATAAGCCTGATATTAAAGGGAGG GACCAGATATTCCAGATTTATTTGAAGAAGTTAAAACTTGATAATGAGCC ATCGTACTTCTCCCAGAGACTTGCGGCCCTTACTCCTGGATTTGCTGGAG CAGATATTGCAAATGTTGTTAATGAAGCTGCTTTAATTGCTGCGAGGAGT GACCAAACAACAGTGACAATGGAGCATTTTGAGGGGGCTATTGATAGAGT AATTGGTGGCTTGGAAAAGAAGAACAAGGTTATAAGCAAACTTGAGCGTC GGACTGTAGCTTATCATGAAGCAGGTCATGCCATTGTAGGATGGTTTTTG GAACACACAGAACCTTTGCTAAAAGTTACTATCGTTCCTCGCGGTACAGC TGCACTTGGTTTTGCACAATATGTACCAAATGAAAACCTTCTCATGACCA AGGAGCAGCTTTTTGATATGACATGCATGACACTTGGTGGTCGTGCATCT GAGCAGGTTATGTTGGGTAAAATCTCGACTGGAGCACAAAATGACTTGGA GAAAGTGACAAAAATGACATATGCACAAGTAGCAGTCTATGGCTTTAGTG AGAAGGTGGGTCTCCTTTCTTTCCCTCAGAGAGAGGATGGTGGCTTTGAG ATGACTAAGCCCTACAGCAACAAGACAGGAGATATTATTGACACTGAAGT GCGAGAATGGGTGGCCAAGGCTTATGAAAAGACAATTGAACTTGTAGAGA AACATAAAGAGCATGTCGCTCAAATTGCAGAGCTTTTGCTTGAAAAGGAA GTACTCCACCAGGAAGACTTGCTCCGGGTTTTAGGTGAACGGCCTTACAA ACCTGCTGAGATGACGAACTATGATAAATTTAAGCAAGGGTTTATGGAGG AGGATGACAAGAGCAAACCTGCCACAGAGAGTGTGAGTGAAGAAGATGAT GACTCAGCACCTCTTGTACCAGATGTGGTTCCAACTTAA

Locus_tag

DCAR_007438

Name

DCAR_007438

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_007438pep MIFSRIGRSLSRSPRSTKSLLTNGRAALVGESILQGPGSVDGKLGLVRKY LAANGNLAVSKAYLSDFRYLLANPRLHRYFSTEEGPKKKNYENFYPKDKK EIPKGDEQKSQSKEDSNTDDGGDFQSAFMKQIQNLIIPLLVIGMFFSSFP FGGREEKQISFQEFKNKLLEPGLVDHIVVTNKTVAKVYVRSTPLNRSRGD GPVAQGPDTDNDTRGKKGQYKYYFNIGSIESFEEKLEEAQEALGIDPHDH VPVTYNSEIGWYQEVMRFAPTLLLLGTLMYMGRKMQGGLGVGGGGGKGAR GIFNIGKAHITKVDKNAKNKVYFKDVAGCDEAKQEIMEFVHFLKNPKKYE ELGAKIPKGALLVGPPGTGKTLLAKATAGESAVPFLSISGSDFMEMFVGV GPSRVRNLFQEARQCAPSIIFIDEIDAIGRARGRGGFSGSNDERESTLNQ LLVEMDGFGTTSGVVVLAGTNRPDILDKALLRPGRFDRQISIDKPDIKGR DQIFQIYLKKLKLDNEPSYFSQRLAALTPGFAGADIANVVNEAALIAARS DQTTVTMEHFEGAIDRVIGGLEKKNKVISKLERRTVAYHEAGHAIVGWFL EHTEPLLKVTIVPRGTAALGFAQYVPNENLLMTKEQLFDMTCMTLGGRAS EQVMLGKISTGAQNDLEKVTKMTYAQVAVYGFSEKVGLLSFPQREDGGFE MTKPYSNKTGDIIDTEVREWVAKAYEKTIELVEKHKEHVAQIAELLLEKE VLHQEDLLRVLGERPYKPAEMTNYDKFKQGFMEEDDKSKPATESVSEEDD DSAPLVPDVVPT*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr2:34270833..34275364+

Type

gene

Unique Name

DCAR_007438.gene

Sequence Residues

ATGATCTTCTCAAGAATTGGGCGTTCTTTATCACGCTCCCCGCGTTCCAC
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CTTAACATCCATGTGTTCATTTTTTGGTGAACAAGGTTGACATTTTTAAT
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ATCATATAGTGGTTACTAATAAAACAGTTGCTAAAGTGTATGTAAGAAGC
ACACCCTTAAATCGGTCCAGAGGTGATGGACCGGTTGCTCAAGGTCCTGA
TACTGATAATGACACAAGAGGTAAGAAAGGCCAGTATAAGTATTATTTCA
ATATTGGAAGCATAGAATCATTTGAAGAGAAATTAGAGGAAGCCCAGGAA
GCCTTAGGTATTGACCCCCATGATCATGTTCCCGTTACCTACAATTCTGA
AATTGGGTGGTATCAAGAAGTGATGAGGTTTGCGCCAACACTTTTGTTAT
TGGGAACTCTTATGTACATGGGACGGAAAATGCAGGGTGGATTAGGTGTT
GGAGGTGGTGGTGGAAAAGGTGCTCGTGGGATATTTAACATAGGGAAAGC
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AATATGAGGAACTAGGTGCAAAAATTCCAAAAGGTGCTTTATTGGTTGGA
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CGCTGTGCCTTTCCTGTCTATATCTGGTTCAGATTTTATGGAAATGTTTG
TCGGGGTTGGACCATCTAGGGTGAGAAACTTGTTTCAAGAAGCAAGACAA
TGTGCACCTAGTATTATATTTATTGATGAGATCGATGCTATTGGTCGAGC
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AAGGCCTGGCAGATTTGATAGGCAGATCTCTATAGATAAGCCTGATATTA
AAGGGAGGGACCAGATATTCCAGATTTATTTGAAGAAGTTAAAACTTGAT
AATGAGCCATCGTACTTCTCCCAGAGACTTGCGGCCCTTACTCCTGGATT
TGCTGGAGCAGATATTGCAAATGTTGTTAATGAAGCTGCTTTAATTGCTG
CGAGGAGTGACCAAACAACAGTGACAATGGAGCATTTTGAGGGGGCTATT
GATAGAGTAATTGGTGGCTTGGAAAAGAAGAACAAGGTTAGTTGTAACCA
GATGATTTCATATATGTGTTGTGCTAGTTAAATATATTTATTCATTAGTC
AATGTCCAGTAAAAGTTCACCTGTCAAAACCTAACATGTTAACATTAAGT
TTCTTTGATCTGTAGAAATATAAAGAAAAAATATCCTTGTGGATCTGCCA
TATATTAATTTATGGTTATTTATCATATATGGCCAATATTAGGATCAAGG
TAGCCCCATGAAAATATAGAGAACTTCAATTTTGCTGCTCTGTACCTCTG
TTGTTTGTCAATTACGAATAGATTGAACTATTACAGGGCTGTAACTTATA
ACCATAGTTAGCTGGAAATTTTCTTCATTCATATATATAGTATTAAAATT
AAGTGATTAAATGTGAAGCACAGTCCTTCCACGTATATGGTGTTATAAAT
GAGACATATTTTTCGATACTTTAGTTAAGTGTGTATGTTTGTCTTGGTGA
TTTGCTTATATGTTGTATATCCGTAAACAGGTTATAAGCAAACTTGAGCG
TCGGACTGTAGCTTATCATGAAGCAGGTCATGCCATTGTAGGATGGTTTT
TGGAACACACAGAACCTTTGCTAAAAGTTACTATCGTTCCTCGCGGTACA
GCTGCACTTGGTTTTGCACAATATGTACCAAATGAAAACCTTCTCATGAC
CAAGGAGCAGCTTTTTGATATGACATGCATGACACTTGGTGGTCGTGCAT
CTGAGCAGGTTAGTTGATGCATGTTTTTACTATTTGAGTTGCATTGCCAA
TAATTTTTTGTTAAATCACGGGAAAGTCACTGTTAATACATTTTTGACTT
AAGGATATAACAAAAAGTTCTATGAAAATAGAAAGAACCTTCCTGCCACA
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TATGTTGGGTAAAATCTCGACTGGAGCACAAAATGACTTGGAGAAAGTGA
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GGTCTCCTTTCTTTCCCTCAGAGAGAGGATGGTGGCTTTGAGATGACTAA
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GGGTGGCCAAGGCTTATGAAAAGACAATTGAACTTGTAGAGAAACATAAA
GAGCATGTCGCTCAAATTGCAGAGCTTTTGCTTGAAAAGGAAGTACTCCA
CCAGGAAGACTTGCTCCGGGTTTTAGGTGAACGGCCTTACAAACCTGCTG
AGATGACGAACTATGATAAATTTAAGCAAGGGTTTATGGAGGAGGATGAC
AAGAGCAAACCTGCCACAGAGAGTGTGAGTGAAGAAGATGATGACTCAGC
ACCTCTTGTACCAGATGTGGTTCCAACTTAA

Sequence Length

4531

Sequence MD5 Checksum

d76952bf8a141013d2ff9cb137262f2a

Relationship

The mRNA DCAR_007438 is a part of Gene DCAR_007438
The Genetic Marker MK016701 SSR0183 is adjacent to Gene DCAR_007438

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False