DCAR_006616

Cds

>DCAR_006616cds ATGGCCGCCGCGGCTTCGTCTTTGTATTTTCCGGCCACTTTCACCGCTGA TTCTCCCGCTTTCTCGTTCTCCGCTCGGCGACCCTTTAAGCCCAAGAGGA TGATGATGCTTGTTCGCTCCGATTTGGATCAAAATGTTTCCGACATGAGC TCCAATGCTCCGAAAGGGTTATTTCCACCGGAACCTCAACTTTATCGAGG ACCGAAGCTAAAAGTGGCTATTATAGGAGCTGGGCTTGCGGGAATGTCTA CTGCTGTTGAGCTTCTAGATCAGGGCCACGAGGTGGATATATATGAATCA AGGCCTTTTATTGGTGGGAAAGTGGGTTCTTTCACTGATAAACGCGGAAA TCATATAGAAATGGGTCTTCATGTATTCTTCGGTTGCTACAATAATCTTT TCCGTCTCTTGAAAAAGGTTGGGGCTGATAAAAATCTTCTTGTGAAGGAG CATACTCACACTTTTGTAAACAAAGGGGGTGAAATTGGTGAGCTTGATTT TCGTTTCCCAGTTGGAGCACCATTACACGGAATAAATGCATTTCTGACTA CCAATCAGCTCAAGACTTATGATAAAGCAAGAAATGCTGTAGCCCTTGCC CTTAGTCCAGTTGTGCGGGCACTTGTTGATCCAGATGGCGCAATGAAGGA CATACGAAATCTGGATAACATAAGCTTTTCTGAATGGTTCTTGTCTAAAG GGGGAACGCGAAAGAGTATTCAGAGAATGTGGGATCCTGTTGCTTATGCT CTCGGGTTTATTGACTGTGATAACATGAGTGCTCGTTGTATGCTCACGAT TTTCTCATTGTTTGCCACTAAAACAGAAGCATCCCTTTTGCGCATGCTTA AAGGTTCTCCAGATACTTATTTAAGTGGGCCCATTCGAGACTACATTACA CAGAAGGGGGGCAGGTTCCATCTCAGGTGGGGATGCCGAGAGATTCTTTA TGAAAAATCTAGTGATGGACAGACATACATTTCAGGCATTGCCATGTCCA AGGCAACTCAAAAGAAAATCGTAAAAGCAGATGCCTACGTCGCAGCATGC GATGTCCCTGGAATCAAAAGATTATTACCCCCACAGTGGAGAGAGTCGGA GTTCTTCGACAATATCTACAAACTAGTTGGTGTTCCTGTTGTCACAGTAC AACTTAGATACAACGGCTGGGTTACAGAGATGCAGGATCTAGAAAAGTCA AGGCAACTGAGGCAAGCAGCGGGATTGGATAATCTCCTTTATACCCCAGA TGCAGATTTCTCTTGTTTTGCTGACTTAGCACTTGCATCTCCAGAAGATT ACTATCTTGAGGGTCAAGGCTCGTTACTCCAATGTGTGCTCACCCCCGGC GATCCCTACATGCCTTTACCAAATGATCAAATCATAGAGAGAGTTACCAA GCAGGTTTTGACTTTGTTCCCATCCTCTCAAGGCCTGGAAGTTACATGGT CATCAGTTGTGAAGATTGCGCAGTCATTATACCGTGAGGGGCCTGGTAAA GATCCTTTTAGACCTGATCAGAAGACCCCTGTGGGAAACTTTTTCCTTGC TGGCTCATATACGAAGCAGGATTATATAGACAGTATGGAAGGTGCAACTC TTTCAGGTAGGCAAGCTTCTGCCTACATTTGTGATGCTGGAGAAGAATTG GCGACCTTGCGAAAAACAATTGCTTCAATCGACTCCAACACACCTACAGA AGCTGAGTTAACCCTTGTCTGA

Gene

ZDS-1

Locus_tag

DCAR_006616

Name

DCAR_006616

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_006616pep MAAAASSLYFPATFTADSPAFSFSARRPFKPKRMMMLVRSDLDQNVSDMS SNAPKGLFPPEPQLYRGPKLKVAIIGAGLAGMSTAVELLDQGHEVDIYES RPFIGGKVGSFTDKRGNHIEMGLHVFFGCYNNLFRLLKKVGADKNLLVKE HTHTFVNKGGEIGELDFRFPVGAPLHGINAFLTTNQLKTYDKARNAVALA LSPVVRALVDPDGAMKDIRNLDNISFSEWFLSKGGTRKSIQRMWDPVAYA LGFIDCDNMSARCMLTIFSLFATKTEASLLRMLKGSPDTYLSGPIRDYIT QKGGRFHLRWGCREILYEKSSDGQTYISGIAMSKATQKKIVKADAYVAAC DVPGIKRLLPPQWRESEFFDNIYKLVGVPVVTVQLRYNGWVTEMQDLEKS RQLRQAAGLDNLLYTPDADFSCFADLALASPEDYYLEGQGSLLQCVLTPG DPYMPLPNDQIIERVTKQVLTLFPSSQGLEVTWSSVVKIAQSLYREGPGK DPFRPDQKTPVGNFFLAGSYTKQDYIDSMEGATLSGRQASAYICDAGEEL ATLRKTIASIDSNTPTEAELTLV*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr2:27154136..27160803-

Type

gene

Unique Name

DCAR_006616.gene

Sequence Residues

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TGTATTGTGGCTATCCAATTTCCTGAAGAACCTTGCACATATATATGGAA
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TCCAGTTGTGCGGGCACTTGTTGATCCAGATGGCGCAATGAAGGACATAC
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CACTTCATCAGTTGTCTGTTTTTTGTTTTTTTTGGCTATCTCAATTATGT
TCCTTTTTACAGATAAGCTTTTCTGAATGGTTCTTGTCTAAAGGGGGAAC
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GGGGCAGGTAAAATTGAATTCGGAATCTGGTAAAGACATCCTGCTATACT
CAAAATTATGTAGTGGTTTATATCTTTATTTGGTACTAATATCTCTTCTT
GAGCAGGTTCCATCTCAGGTGGGGATGCCGAGAGATTCTTTATGAAAAAT
CTAGTGATGGACAGACATACATTTCAGGCATTGCCATGTCCAAGGTAAAG
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GTTGAAGGAACTAACAAAAATTCCTAATGTAAAATACAGTAGCGGCATGA
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GACATGTGAATCTGTGATATATTCACTGTTAGTTTACAGGGAAACAATAA
ATCCGATCTCTTAGTGACAGAACCTGGGACTTCTGTGATTGATGGATTGA
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TGAGGAAATTTGAGAGAACAGATGAAAATAAGCGAGGGCACGCTGTATAG
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GAAGAATGGCAATAATACAGGGAGCTATATGCTATAGACAGAAGTTACAA
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GATTCTGTTGACAATAGTAACTATATTTTAAGATAATAAACTCAGAGAAA
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TATCTTTTTTTCAGGCAACTCAAAAGAAAATCGTAAAAGCAGATGCCTAC
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ATCTTGAGGGTCAAGGCTCGTTACTCCAGTATAATTTCCATTTTCAATCT
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GCTTTTATTAAAGATATAAAACCATCTGTTCAGAATATGCATGCCTGACA
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GGAAGCATGCCCTGTATGGAGATACCGAAATTTGGCAAAATTAAAATATG
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GGTAGTTAACTTAGCCTTGTCGAGTATATAGTTTCTCAAATCTGCATTTT
CCTCCAAATATTGAAAAATGCAAATTGTTTCTCAGGTTTTGACTTTGTTC
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GCAGTCATTATACCGTGAGGGGCCTGGTAAAGATCCTTTTAGACCTGATC
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GGTTATATATAAAGATA

Sequence Length

6667

Sequence MD5 Checksum

250c0d0f5b4891532fdf73f9cafc3e0c

Relationship

The mRNA DCAR_006616 is a part of Gene DCAR_006616
The Genetic Marker MK000037 ZDS1 is adjacent to Gene DCAR_006616

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False