DCAR_003216

Cds

>DCAR_003216cds ATGGTGAAGGGGAAGGAAGAAGAGAAGGGAGCGGAGAGAAATGAAGGGGA AGTAGTAGTGGTAACTCCAAAGCCCAACAAAGGATTAACATCAAAAGCCA TTGACTGGCTTGAAACTTTGATCATCAAGTGCATGTATGACCCTTCTGCA CCTCATCACTGGCTTTCTGGTAACTTTGCTCCCATTCTCGACGAGACTCC TCCTTGTACTAATCTCCCTGTCATTGGTCATCTTCCGGAGTGTCTGAATG GCGAGTTTGTCAGGGTTGGTCCGAATCCGAAGTTCCCCCCTGTGGCTGGT TATCACTGGTTTGATGGAGATGGCATGATTCATGGACTACGCATTAAAGA TGGAAAAGCTACTTACGTCTCTCGCTATGTGAAAACATCTCGTATGAAAC AAGAAGAGACTTTTGGAGGAGCTAAATTTATGAAGGAGATTGATTATGCT GTTTATCTAGAGTTCTTTACACTTTTCATATCTCTATACCAAAAATTTAA ATCTGCTAATACGGCTATGATTTATCATCATGGTAAACTAATGGCTCTTA ATGAGGGCGACAAACCATATGCCATTAAAGTGTTCGAAGATGGAGATTTG CAAACCCTTGGTTTGCTGGATTATGACAAGCGGCTAACACATTCATTTAC TGCCCATCCAAAGGTTGACCCATTTACCGGTGAAATGTTTACCTTTGGCT ACTCACAAACACCTCCATATATGACATACAGAGTGATTTCCAGGACTGGT GTTATGGATGATCCTGTGCCAATAACATTAGCAGACCCCGTGATGATGCA TGACTTTGCCATTACTGAAAATTACGCAATAGTCATGGATCTACCCTTAT TCATCAAACCCAAGGAAATGGTGAAGGAAAAGAAGCTGATAATCACTTTT GATGCAACTAAAAAGGCCCGCTTTGGTATCCTTCCACGATATGCTAAGAA TGAGCTGCTAATAAAATGGTTTGAGCTCCCAAATTGCTTTATATTTCACA ATGGTGAGGCACCAAATTCTTTATCCATCCCAGTTACCAATGCTTGGGAG GAAGGAGATGAAGTTGTCTTAATCACCTGTCGTCTTGAGAATCCAGACTT TATTATAAATAATGGGGATATGAAAGAGAAGCCCGAGAATATTCATAATG AATTGTTCGAGATGAGATTTAACATGAAGAGTGGTCTAGCTTCCCAGAAG AAACTCTCAGCATCTGCTGTTGATTTTCCTCGGATAAATGAGAGCTATAC TGGCAGAAGATCAGCAGTCAATGTGATTGATGCGAAAACAATGTCACCTG ATCCCGTTGCAGTTGTTGAATTACCGAACAGAGTTCCTTATGGATTCCAT GCCTTCTTTCTGACGGAGTCAATGAAGTGGAGCAACTTTTATTTGGACTC CAGATTATCAGCAAGAATGGTGTCTTCTTCAACTAATCAGAAGATGAATA TCGTTACTAATGAGTTGGTTGAGCAGCATGAGGAAACTACTAATGATCTT ATGCTTAGTAACCGGAAAAATACAGGCTTTCTATACACGAGACGAAAGAC GGTGATGGGAAAGCAAAATGTGAAGGAAGTGAAGAGAAATGAAGCGGAAG TAGTGGTGGTAAATCCAAAAGTGAGGAAAGGGTTAACATCAATGGCTATT GACTGGATTGAAAGTTTGATCGTTAGGTACATGTATGACTCCTCTGTAGA TCATCATTGGCTTTCTGGTAACTTTGCTCCGGTGCTTGACGAGGCTCCTC CTTGTACTAATCTCCCTGTCATTGGACATCTTCCGGATTGTCTGAATGGT GCGTTTCTTCGGGTTGGTCCAAATCCTAAATACCCCCCTGTGGCTGGTTA TCACTGGTTTGACGGAGATGGCATGATTCATGGATTACGCATTAAAGATG GAAATGCTACTTATGTTTCTCGTTATGTGAAAACATCTCGTCTGAAACAA GAAGAGACTTATGGAGGAGCCAAATTTATAAAGGTCGGAGATCTTAAGGG ACTATTTGGGCTACTTATGCTTAACATGCAAATTCTCAGAGAAAAATTGG AAGTATTGGATATGTCATATGGATATGGAACAGCTAATACGGCTATGATT TATCATCATGGTAAACTTATGGCTCTTTCTGAGGGTGATAAACCGTATGT CATTGGAGTGAAGGAAGATGGAGATTTGCAAACCCTGGGTTTGCTGGATT TTGACAAGCGGCTAACACATTCATTCACTGCCCATCCAAAGGTCGACCCA TGTACCGGTGAAATGTTTACCTTCGGCTATTCACAAACACATCCATACTT AACATACAGGGTGATCTCGAAAGATGGTTTTATAAATGATCCAGTGACAA TAACATTACCACGCCCTGTATTGATGCATGACTTTGCCATTACTGAAAAT TACGTGATTATTATGGACCTACCGCTGTACATAAAACCCAAGGAAATGGT GAAGGAAAAGAAGCTGATATTCACATTTGATGCAACTAAAAAGGCCCGGT TTGGTGTCCTTCCACGATATGCTAAGAATGACTCGCTGATTAAATGGTTT GAGCTCCCAAATTGCTTTATATTCCATAACGCCAATGCGTGGGAGGAAGG AGATGATGTTGTTTTAATCACTTGCCGTGTAGAGAATCCAGACTTTACCA TGAATAATGAGAGTATGAATGGGAAGCTCGAGGATTCTAATAATGAATTG TTTGAGATGAGATTTAACATGAAGAGCGGTCGAGCTTCCCAGAAGAAACT CTCTGCATCTGCTGTTGAATTTCCTCGGATAAATGAGAGCTATACTGGAC GGAAACAACGGTATGTATATGGAACTGTATCGAATCACTTTGCAAAGGTC AGTGGGATCGTCAAATTTGATTTGCACATGAACCCCGAAATGGGAAAAAG AAAGATTAAAGTTGGAGGAAACATTCAGGGAATTTTTGACCTGGGACCTG GTATATTTGGTTCAGAGGCCATCTTCATTCCTCGTAAGCCCAACATTACT TCTGAAGAAGATGATGGCTACTTGATTCATTTTCTACATAATGAGAACAC TGGAAAATCAGCCATAAATGTGATTGATGCAAGAACAATGTCACCTGATC CCGTTGCAGTTGTTGAATTACCATACAGAGTTCCTTACGGATTTCATGCC TTATTTATGAGCGAGGAACAACTTCAAGAACAAGCTGAACTGTAA

Gene

CCD1-1

Locus_tag

DCAR_003216

Name

DCAR_003216

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_003216pep MVKGKEEEKGAERNEGEVVVVTPKPNKGLTSKAIDWLETLIIKCMYDPSA PHHWLSGNFAPILDETPPCTNLPVIGHLPECLNGEFVRVGPNPKFPPVAG YHWFDGDGMIHGLRIKDGKATYVSRYVKTSRMKQEETFGGAKFMKEIDYA VYLEFFTLFISLYQKFKSANTAMIYHHGKLMALNEGDKPYAIKVFEDGDL QTLGLLDYDKRLTHSFTAHPKVDPFTGEMFTFGYSQTPPYMTYRVISRTG VMDDPVPITLADPVMMHDFAITENYAIVMDLPLFIKPKEMVKEKKLIITF DATKKARFGILPRYAKNELLIKWFELPNCFIFHNGEAPNSLSIPVTNAWE EGDEVVLITCRLENPDFIINNGDMKEKPENIHNELFEMRFNMKSGLASQK KLSASAVDFPRINESYTGRRSAVNVIDAKTMSPDPVAVVELPNRVPYGFH AFFLTESMKWSNFYLDSRLSARMVSSSTNQKMNIVTNELVEQHEETTNDL MLSNRKNTGFLYTRRKTVMGKQNVKEVKRNEAEVVVVNPKVRKGLTSMAI DWIESLIVRYMYDSSVDHHWLSGNFAPVLDEAPPCTNLPVIGHLPDCLNG AFLRVGPNPKYPPVAGYHWFDGDGMIHGLRIKDGNATYVSRYVKTSRLKQ EETYGGAKFIKVGDLKGLFGLLMLNMQILREKLEVLDMSYGYGTANTAMI YHHGKLMALSEGDKPYVIGVKEDGDLQTLGLLDFDKRLTHSFTAHPKVDP CTGEMFTFGYSQTHPYLTYRVISKDGFINDPVTITLPRPVLMHDFAITEN YVIIMDLPLYIKPKEMVKEKKLIFTFDATKKARFGVLPRYAKNDSLIKWF ELPNCFIFHNANAWEEGDDVVLITCRVENPDFTMNNESMNGKLEDSNNEL FEMRFNMKSGRASQKKLSASAVEFPRINESYTGRKQRYVYGTVSNHFAKV SGIVKFDLHMNPEMGKRKIKVGGNIQGIFDLGPGIFGSEAIFIPRKPNIT SEEDDGYLIHFLHNENTGKSAINVIDARTMSPDPVAVVELPYRVPYGFHA LFMSEEQLQEQAEL*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr1:37029986..37043523-

Type

gene

Unique Name

DCAR_003216.gene

Sequence Residues

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ATGGAAACAGCCTCTCTCTAGCGAAAAATTAAGGTCTGCGTATATGCTCC
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CTATGATTTATCATCATGGTAAACTAATGGCTCTTAATGAGGGCGACAAA
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TACATTTCAAGTCCACCTAATAAATGAGAAACCACCTCTAGCCCTTTCAG
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ATTGTTAAGATGTCCAGATCTCGGTTCACCTTGGTTTTTTCATCTTCATA
CTTTATTGTATAGCACATGATTAATGCATTATGCATAGAACCTATGCCAG
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ATTAAAGTGTTCGAAGATGGAGATTTGCAAACCCTTGGTTTGCTGGATTA
TGACAAGCGGCTAACACATTCATTTACTGCCCATCCAAAGGTTGACCCAT
TTACCGGTAAAAGCCACTGTCCCTGATATGTTTAAAAGAGTTTTTGGAAT
TACTCATTTAATAACATTATTTATTCATTTAGGTGAAATGTTTACCTTTG
GCTACTCACAAACACCTCCATATATGACATACAGAGTGATTTCCAGGACT
GGTGTTATGGATGATCCTGTGCCAATAACATTAGCAGACCCCGTGATGAT
GCATGACTTTGCCATTACTGAAAATTACGCAATAGTCATGGATCTACCCT
TATTCATCAAACCCAAGGTACAAGTATATTCTATCAACATATCTGCATTG
GCCGTGTGATAATTATGAATATTAATCTTAAGATTATGTGTATGATATTT
CACCATCCGCGTTACACATTTCTGTAATCTTTAAGGGTGACTCCCAAATT
GATTTTACTATTTAGGAAATGGTGAAGGAAAAGAAGCTGATAATCACTTT
TGATGCAACTAAAAAGGCCCGCTTTGGTATCCTTCCACGATATGCTAAGA
ATGAGCTGCTAATAAAATGGTTTGAGCTCCCAAATTGCTTTATATTTCAC
AATGGTGAGGCACCAAATTCTTTATCCATCCCAGTTAGTAAGTAGATTTA
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TTTTCCAGTGTAATTCAAATTACATCACGTTCTGTTGAATGTATTTAGTA
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AAGTTTTAAGTTTTTTTATTGCTTTTTGAGGATGTAACTGCTAGCGTTTG
TTGTTTTTTCTTCAATTGTTCCCCTGAATTGTTGTCAAACTTTTTTATCA
GCCAATGCTTGGGAGGAAGGAGATGAAGTTGTCTTAATCACCTGTCGTCT
TGAGAATCCAGACTTTATTATAAATAATGGGGATATGAAAGAGAAGCCCG
AGAATATTCATAATGAATTGTAGGTCTCATCTACTAATGTATTTTTTTTA
GCACCGCATTCGATACTAAGCTATCCGCTCTTGACTACAAAACAATTTTC
AGGTTCGAGATGAGATTTAACATGAAGAGTGGTCTAGCTTCCCAGAAGAA
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GCAGGTACATGAAGCTACATTGTTAATGTTCCATTTCATTAACGAACATA
ATCAGAGATGACTATATGAGGGATATGTTTCTATATTTGGAAAAAGAATT
TTTTTTAAAGCTCAATCTGAAATCCTGTAGCGGAAAAACTTATGTATATA
TTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTTTCAGATCTTTTCATAAAGTA
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TATACTGGACCAATCTGCAAAGATCACTGGGATTGTCAAATTTGATTTGC
ACATGAACCCAGAAGCGGGGAAAAGAAAGCTTGAAGTTGGAGGAAACATT
CAAGGTATCTTTGACCTGGGAGTTGGTGGATTTGGTTCAGAGGCCATCTT
TGTCCCTCGTCAGCCTGGAGTTACTTCTGAAGAAGATGATGGCTACTTAA
TTCATTTTGTACACAATGAGAACACTGGGTAAAGTTGTCTTCCCCTCTCT
TGAATTTGAGGATATATCTGCTAGCTTCTTTTTTTTGCTAGACTGAAGTA
CATACTGACTGCATCCAAATATATCAACTAACATGAATATGAATTTAGTT
GTTGAAGTCCAAAGTATGGATTCAAAAAGTTGTTACATAGATGACTTGAT
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GGTTTACACGGTATGTTATCATTGCCCCTTCTCCCTAGTGGCTATAGTAG
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GTAGAAAAAATCTCCAAAAATTATTTGGTACGGGAGTTTTACAAGTCAAC
CATTATACTCAAGCCACTCTTCAGCAAAAAAGAGCTATTGTAACAAGATG
ATGAGACTTTATTTTATTTTTTAGAGGTATTATAAAATAGAAGATATTCC
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TGTAATATGTCAGTTGAACATTTTCATAACTTTCTAGGCAGTAGTGTCAT
CCCTCAATGTTATTACTGTCAACCCCATTTACTGAAAAAACAGCAGGTGC
TTCTCACTAACATTTGCCTGATACATTGCCGCTTGCTTATCCTTTCTTTT
GCTACATGTGCAGAAGATCAGCAGTCAATGTGATTGATGCGAAAACAATG
TCACCTGATCCCGTTGCAGTTGTTGAATTACCGAACAGAGTTCCTTATGG
ATTCCATGCCTTCTTTCTGACGGAGGTCAGTAGCTTTTTTGTGTCTCTCA
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TCTTTATATCTAAATTGTACTAGAGGCTTCTTTGTGTCTTTCATTATGAA
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AATTTGTACAGGAACAACTTCAAGAACAAGCCAAACGGTAGAAAGCCTGA
GCCTTGCAGAACCAGATAAGTAGCAAGGGCTCTGTGACTTGCATACCTGT
AATCTCAAAATTTGTGTGATATCTCTTTGTACGGACAAGAGAGTTGCAGA
ACCACATGAGTAACGAGGTCTCTTTGACTTGCATACCTTTAATCTTAACA
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GCTACCTAACCTGTTATTGTGATAGGAATGATGCATTGTTCCACCGATGA
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TGCTAAACAATGTGCAATGCCAAATGTTTAGGATTCCAAGAGGAAGTGTC
TGTGTGGCAAATAAGTGCTGCTTTCGCTTTTGTTTCATCATTTCCAACTA
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TTGTGATCCAAGAATTCCACGCTTCTACATTTCACTCTCGTTTTCAAAAT
CTGTTGACAGTGCTGAAACCCTTCATTTTCTCCAGTGACGTTGCACAGTG
CTTCTCTTCGCCTTTGATTCCTGGCGCTTCACATTCTGATTGAAACATGT
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GTAACTTTTTTTTTTCTTGAATAACAATTTAACATCTAAATTTTTATTCA
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TCAAACTATTTAAAATTGTGCGGCAAAATTCAAAATATAAAATAAATCTT
GCTTATCGATAAAATAAAATAAAACAGGGAGTATGATTTACGTTGACTGA
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AAAACAGCATAATTCAATACAATGCTGCAATCAAATTTACAGTCAATGAA
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CTTCAACTAATCAGAAGATGAATATCGTTACTAATGAGTTGGTTGAGCAG
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TTTTTTTTTTTATCTGTGCAGGTTTGACGGAGATGGGTGTGTTTTCTTCC
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TTCATGGATTACGCATTAAAGATGGAAATGCTACTTATGTTTCTCGTTAT
GTGAAAACATCTCGTCTGAAACAAGAAGAGACTTATGGAGGAGCCAAATT
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CTGTTTAGGGCTTGAAACGACTTTTTCATTCACTTTCTTGCAGCTAATAC
GGCTATGATTTATCATCATGGTAAACTTATGGCTCTTTCTGAGGGTGATA
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GCATCTTATCAAATTGTACTAAATTTAGTGTTGAGTAACGAAGCTTATAT
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ACTTTCTTATTTGCGCAGATGTCATTGGAGTGAAGGAAGATGGAGATTTG
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AATGATTCTATTATTTAGGAAATGGTGAAGGAAAAGAAGCTGATATTCAC
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CATAACGGTGAGGCACCAAGTTCTTGATTCATCCCAAATTTACAAGAAAT
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GCATAATTTTGCCAATGTTGCCAATGTACTTCAATGCACATCATTTACTA
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TTCAGTGTTTCATTAAAAAAATTGATACTTAAAAACGCAAAAAGTTATTG
TCATGCTTTATGATATTTACTCTGAAATAGATGCATGAAATCACCACATT
TACGTTAATATGTCATGCCCACACTCTAGTAAAAGGTTTTATAACATCTA
AGGTTTTTGGATGTGGACGGATAGTTTTTGCTGCTTTATCTTGAATGTTA
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AATAATGAGAGTATGAATGGGAAGCTCGAGGATTCTAATAATGAATTGTA
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TTTTATGTTCTATTCGTTAACGAAGATAATAAGAGAGGATTATTCGGGGT
GTGTTTCTGGATTTAGATAAAGAAAAATTGAGGGCTTGTACTAAAAGTTA
CTGCATCTTATTACTCATATTCTTGTGTTTAGTTGTACTAACATGTTGTC
GATGCTTATTTGCTACAAGCTCAATCTGATATCTGATACTGTGAAAATCC
TAAATATCTCTTTTTATAAAAAAATCTTAATCAATTTTATGACTATCATA
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TTACATAGTCAAGTTCACTTGTGCTACCAAAACATAGGGAAATAAAATAC
AAACAAGAATATGTTACTCTTCCATAATAGGAGTCCAGTGTGTTTTTTTT
TACAATGTTAGCGTATAGTAGTAAACTTTAAATTTCACCACTATCAATAC
AACGTAAATGAGATTTTATAGTTGAGGTTAAATCCATATATGTTAATTCC
AACTTAACAAACTTAAATTGGTGAAAGAGCCCGGTTAAGGAGCATACCGG
GTGTGCCAGTGTCCATAGCCAGTTGTAATATGCAGATTTTCACTATATAT
CAATAATAATGTTCTGATATGATTATATACGAATACAACCAAGTTGCTAC
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TAAACAGGAACAACTTCAAGAACAAGCTGAACTGTAA

Sequence Length

13537

Sequence MD5 Checksum

19c46f2dfac8721198b083bd3a73165d

Relationship

The mRNA DCAR_003216 is a part of Gene DCAR_003216
The Genetic Marker MK000052 CCD2 is located in Gene DCAR_003216
The Genetic Marker MK016770 1_37041227 is located in Gene DCAR_003216

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False