DCAR_014819 | CarrotOmics Tripal4

Cds

>DCAR_014819cds ATGGAAAATAACAATTGTAACTCAATTCTGTCTCTGCGTTGCTCTATGGG GAAGGTGATAAAGCTGTACAATGCACAGTTTGTAGTTAATCTTAGCGAGC TTGGCCAGGATGATCCGTTCTTGCAGAATGCTACTCATCACCTTCAGTCG CTAAAAGTTCCATGGTACACAACTAGCATTCTAAAAGGAGAAGGAGAAGA GCTTGGTTACGTAGTTAAACAGATTAAAATCCCAGACCAAAATGTGCTAG ATGTAATATTTTACCACGCCGACTTCAAACAGGATAATTCTACTGGCAGT GGCAATCATCGAATACATCGGCTTACTAACCTGCTCAAAGCCAGCACTAG TGACTGGCGCATTGTTGTTGGGTCCCAGTCGTTGGAAGGTTGCGATGATG GTCCGCAGAAATCAGACCTGTACCGTGAGTTTTTGAAATATGGAGTGGCA AGTGAACTGAGCTGTGATATATGTTTCTTCGAAGAGTCGTACTTAACATA TATAATATCACTAAATCTTAAAGCTAAACTAGTTCAGACTGATGCATACC TTAGTGCGCAGTCATGTAATGGTAACGTCCAGAAAGAAGGTATGACTCAC ATCCACAACATTACTGAAATGAGGAGAGGACCTTATTTCACGAGCATAAA TGAGAAACGTATACTTCACAGCGATGTTGGAAATGGATTCCTTCTTCACC GAGTTGGCTCTATAGAGATTGTGACATACTTGGTTACTTTGAAAGGAGAA GTTGTACATCAAACTTCACTGAAACAAGGAGGAAGACATTTCATATGA

Locus_tag

DCAR_014819

Name

DCAR_014819

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_014819pep MENNNCNSILSLRCSMGKVIKLYNAQFVVNLSELGQDDPFLQNATHHLQS LKVPWYTTSILKGEGEELGYVVKQIKIPDQNVLDVIFYHADFKQDNSTGS GNHRIHRLTNLLKASTSDWRIVVGSQSLEGCDDGPQKSDLYREFLKYGVA SELSCDICFFEESYLTYIISLNLKAKLVQTDAYLSAQSCNGNVQKEGMTH IHNITEMRRGPYFTSINEKRILHSDVGNGFLLHRVGSIEIVTYLVTLKGE VVHQTSLKQGGRHFI*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr4:18101502..18105355-

Type

gene

Unique Name

DCAR_014819.gene

Sequence Residues

ATGGAAAATAACAATTGTAACTCAATTCTGTCTCTGCGTTGCTCTGTTTG
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CCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCCCTCTCGCTCTCCCTCTCGC
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TCATCACCTTCAGTCGCTAAAAGTTCCATGGTAAATCTTTTCAAGTAGTT
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TCTTCCCTGTAATTATCTATGCTTGACCATTTGTTCGCACCAACAATGTC
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TCTACTTCTAATGAATATCTCGACATTTTGACTTAGGATAATTCTACTGG
CAGTGGCAATCATCGAATACATCGGCTTACTAACCTGCTCAAAGCCAGCA
CTAGTGACTGGTAAGATCACACTATGCTTTCTTTATTATTGTGGACTCTG
GTGATTTATGAAACAGCATCACGCAGGCATACTTGAATGTGCAAACTACC
TTCTGTTCATCATAGTGAAACTAGGTGCAAAGACTAAAAACTGAACTAGT
CCGCATCACATGGCATGCTTGAATCTGCAGATTACCTGCTGTTCCCCATA
GTAAAACTAGGTGTAAAGACTTAAGCTAAACTTGTCTGCATCGGAGGGGT
TTTGATTTGTGCGCCTATCATTCTGGAAAATTCAACATAGCAATGGAAGT
CAGAATGTCCAAATTCCACTGACCCACTTCAGTATGACCATAATTTACTT
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TCTGAAATTACAATTATATTCATATGCTTTGATATTTAATTCCTATTTTC
ATACAGATTACCCTGATTCCTTTTCCTAGGTTAAATATTGGCACTAGTTT
GTCGCATTTTTACCTTTCTCCCTTCCTTTTACTACAGGCGCATTGTTGTT
GGGTCCCAGTCGTTGGAAGGTTGCGATGATGGTCCGCAGAAATCAGACCT
GTACCGTGAGTTTTTGAAATATGGAGTGGCAAGTGAACTGAGCTGTGATA
TATGTTTCTTCGAAGAGTCGTACTTAACATATATAATATCACTAAATCTT
AAAGCTAAACTAGTTCAGACTGTACATAATGTCCCTTTCCCATATCTCTA
TTTCAAGATAAATAATGTCCTTCTGTCAAATGAAAAACAGATTGATGCTT
AATGTGAGGACTCTGTAAAGCGAATCCTAATCTCTGTTAAATTCTCTTTA
GGATGCATACCTTAGTGCGCAGTCATGTAATGGTAACGTCCAGAAAGAAG
GTATGACTCACATCCACAACATTACTGAAATGAGGAGAGGACCTTATTTC
ACGAGCATAAATGAGAAACGTATACTTCACAGGTATAACAAACAAAAGAA
TCGCCATTTTTAGAAGTGCAAGTGTATCGGTTGTTCTCTAATAGTTCTTT
CCCTCTTTTCGGATTGTGCAGCGATGTTGGAAATGGATTCCTTCTTCACC
GAGTTGGCTCTATAGAGATTGTAAGTATGGAGACTTTTATGCAGTAGTCA
TTAATCATGTTTCAGGAGATAATATGTTAAAGCATTTATTCAGCAATATT
TTGTAATAGTTTTTTTATTTGGCAGGTGACATACTTGGTTACTTTGAAAG
GAGAAGTTGTACATCAAACTTCACTGAAACAAGGAGGAAGACATTTCATA
TGA

Sequence Length

3853

Sequence MD5 Checksum

06620cb4f167b2ea0d1779b104519be1

Relationship

The mRNA DCAR_014819 is a part of Gene DCAR_014819
The Genetic Marker MK016681 SSR0040 is located in Gene DCAR_014819

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False