DCAR_011975

Cds

>DCAR_011975cds ATGGGTTTTATATGGAAAATTTCAACTTGGGTTGTGTCTATAGTGTTCAT ATTGTCATGTATTTGCAGCTCTGTTACTGCTACAGTTACTTATGATGATA AAGCTATCATCATTAATGGTCAAAGAAGGATTCTCATTTCTGGTTCTATT CACTACCCAAGAAGCACTCCTGAGATGTGGCCTGATCTTATACAAAAGGC TAAAGATGGAGGCTTGGATGTAATCCAGACTTATGTGTTCTGGAATGGAC ATGAACCTACTCGAGGAAAATTTAATTTTGAAGGGAGGTATGATCTTGTT CGATTTATTAAAGTGGTACAACAAGCTGGCCTTTATGTGCACCTTCGAAT TGGCCCTTATGTTTGTGCTGAGTGGAACTTTGGAGGATTCCCTACTTGGC TTAAGTTTGTACCTGGAATTTCATTTAGAACAGACAACGGGCCTTTTAAG GTGGAAATGCAACGTTTTACAGAAAGAATCGTCAACATGATGAAGTCAAA TAGATTATTTGAACCCCAGGGCGGTCCGATTATTATGTCACAGATAGAGA ATGAATATGGACCGATAGAATGGGAAATAGGTGCTCCGGGAAAATCTTAT ACCAAATGGTTCTCAAGTATGGCTGTAGGCCTTAACACTGGTGTTCCATG GATCATGTGTAAACAAGAAGATGTCCCTGATCCAATTATAGACACTTGCA ATGGTTTCTATTGTGAAGGCTTCTTTCCAAAGAAGTGGTACAAACCTAAG ATGTGGACTGAAGTCTGGACTGGCTGGTACACGGAATTTGGTGGTCCAGT CCCTTATAGACCAGCTGAAGACTTGGCCTTTTCCGTTGTACGATTCGTAC AGAATAGGGGTTCTTTCTTTAATTATTATATGTACCATGGAGGGACTAAC TTTGGCCGTGAATCTTCGGGTTTGTTCATTGCCACTAGCTATGATTATGA TGCTCCTCTTGATGAATACGGATTACAAAGGGAACCAAAATATGGACATT TGAGACTCATGCATAGAGCCATTAAGCAAGCTGAAGCAGCTTTAGTTTCA GCATACCCTACAGTTTGGTCACTTGGCAAAAACTCTGAGGCTCATGAGTA CAGGGCAAAATCTGGGGCGTGTGCTGCATTTCTCGCCAACTATGATACTA GATCTTGGGCGAAAGTTGACTATTTTAATAAGCTATATGACCTTCCTCCA TGGTCCATCAGCATTCTTCCGGACTGCAAAAATGAAGTTTTCAACACTGC TAAGGTAGGTTTCCATGGTTCTCATATGAAGATGCTCCCTGTTAGTGCAG CTTTCCATTGGCAGTCATTCACTGAAGAAGCTCCAACTGCTGATGATGGT GATACTTTCACAAAGTGGGGGTTGTATGAGCAGTTAAATCTTACTAGAGA TTACTCAGATTATTTGTGGTACCTCACAGACGTGAATATAGCCTCAAATG AATGGTTCCTCAAGAACGGAAAAGATCCTATTCTTACGATTGCGTCAGCC GGACACACTTTGCAGGTTTTTGTCAATGGACAACCGTCAGGAATTGCTTA TGGAAGTCTGGAAAATCCAAAACTGACATTTACCGGCTCCGTTAAATTGA GGGCCGGCATTAACAGAATTTCTTTGCTAAGCTCTTCCATGGGTCTTTCG AATGTTGGTGTGCATTATGAGACATACAGCACAGGGATTCTTGGTCCAGT TACCTTAAAGGGTCTAAATGGGGGAACACGAGACTTGACAAAGCAGAAAT GGTCCTACAAGGTTGGTTTAAAAGGCCAAACTATGAGTCTTCACACACTT GGTGGAAGTTCTTCTAGTAATTGGCTAGAAGGATCATTGGTTGGTCAGAA GCATCCACTATCCTGGTACAAGAATGGGGAGGTAATCCATTCGGGATTTC ACTGGTCAGAAGAACATTGTGATCAGAAAATCGAAGCTGCTGCTGCTGCT GCTGCAGCACTATACTATACAGAAGAATATAAATAA

Locus_tag

DCAR_011975

Name

DCAR_011975

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_011975pep MGFIWKISTWVVSIVFILSCICSSVTATVTYDDKAIIINGQRRILISGSI HYPRSTPEMWPDLIQKAKDGGLDVIQTYVFWNGHEPTRGKFNFEGRYDLV RFIKVVQQAGLYVHLRIGPYVCAEWNFGGFPTWLKFVPGISFRTDNGPFK VEMQRFTERIVNMMKSNRLFEPQGGPIIMSQIENEYGPIEWEIGAPGKSY TKWFSSMAVGLNTGVPWIMCKQEDVPDPIIDTCNGFYCEGFFPKKWYKPK MWTEVWTGWYTEFGGPVPYRPAEDLAFSVVRFVQNRGSFFNYYMYHGGTN FGRESSGLFIATSYDYDAPLDEYGLQREPKYGHLRLMHRAIKQAEAALVS AYPTVWSLGKNSEAHEYRAKSGACAAFLANYDTRSWAKVDYFNKLYDLPP WSISILPDCKNEVFNTAKVGFHGSHMKMLPVSAAFHWQSFTEEAPTADDG DTFTKWGLYEQLNLTRDYSDYLWYLTDVNIASNEWFLKNGKDPILTIASA GHTLQVFVNGQPSGIAYGSLENPKLTFTGSVKLRAGINRISLLSSSMGLS NVGVHYETYSTGILGPVTLKGLNGGTRDLTKQKWSYKVGLKGQTMSLHTL GGSSSSNWLEGSLVGQKHPLSWYKNGEVIHSGFHWSEEHCDQKIEAAAAA AAALYYTEEYK*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr3:42629203..42633977-

Type

gene

Unique Name

DCAR_011975.gene

Sequence Residues

ATGGGTTTTATATGGAAAATTTCAACTTGGGTTGTGTCTATAGTGTTCAT
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AGACTTATGTGTTCTGGAATGGACATGAACCTACTCGAGGAAAAGTAATG
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GTTTTGATGCAGAGGATTCCCTACTTGGCTTAAGTTTGTACCTGGAATTT
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AAATTTAAGAATTATATAAATTTACCACTTTTCTTAACTTTTGACTGTTT
TGTGTACTGATATTGACTTTGATGAACCAAAGGTGGAAATGCAACGTTTT
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TATTGTCAAGGAACGCACACACAAGTGATGTTGTACATGAAGCACAGTCA
CTGGCAACTGCTTCCATTTATATGGCTTTGAAATTAGAATCATATTGCCT
AATTACAATCGCAGATAGACACTTGCAATGGTTTCTATTGTGAAGGCTTC
TTTCCAAAGAAGTGGTACAAACCTAAGATGTGGACTGAAGTCTGGACTGG
CTGGTAAGCTACATGGATGTACTTTTTAATATATCAAACATGATAGTGAA
TTTGTCTAAAGCATGCGACAGGAACTATGTTAGACTGAGGCCCTTGGTCA
AGTCCCCTAAACTACTCATGCTACCACTCCTTTGCCTATTAGTTACAGCA
CCATAAATTTATAAATACTGTTTGATAAACCACTGGCAATATATATAGGT
ACACGGAATTTGGTGGTCCAGTCCCTTATAGACCAGCTGAAGACTTGGCC
TTTTCCGTTGTACGATTCGTACAGAATAGGGGTTCTTTCTTTAATTATTA
TATGGTAAGTCAAAGGTTTTTATATTTATTTAAAAAGATGACGTTTAATA
AATGATATTCTTTGAGTTGAACTGATCCTTTTATCTTATATGTCAACTTG
TATCTTAGTACCATGGAGGGACTAACTTTGGCCGTGAATCTTCGGGTTTG
TTCATTGCCACTAGCTATGATTATGATGCTCCTCTTGATGAATACGGTAT
GCATAAAAGTTCTAAAACATATATAGTACATTTCTCGTTTCTTCCATTGT
GCTTCAACTATGTTTATCAGCAAGTACACATTTCATAAATTTATAGTTAT
ACGGACATAAAATAGTTTTGACGTTGTTCATTGTGGATTATTTATTAGGA
TTACAAAGGGAACCAAAATATGGACATTTGAGACTCATGCATAGAGCCAT
TAAGCAAGCTGAAGCAGCTTTAGTTTCAGCATACCCTACAGTTTGGTCAC
TTGGCAAAAACTCTGAGGTAGCTGGCTAAAGCAGTTCATGAATGCTTTTT
TTTTTGTTCAAGTTAATTGTTCTTCTCACATATCTCTTTTTACAGGCTCA
TGAGTACAGGGCAAAATCTGGGGCGTGTGCTGCATTTCTCGCCAACTATG
ATACTAGATCTTGGGCGAAAGTTGACTATTTTAATAAGCTATATGACCTT
CCTCCATGGTCCATCAGCATTCTTCCGGACTGCAAAAATGAAGTTTTCAA
CACTGCTAAGGTGATGCAATATAAAGCTAATGCATTGTGCTTACAGTAAT
CCATTTATCCTTCTTCTTTAAAAGTTAACTCTGTCTGCATCATTTGTGAC
TTCTAATGACAGACATTCTGGAAATGATAGAAATTTTTCCGTTTTCATAT
ATAAAGTTTCTAAAACTGAACATATAAATTTTGTTAGCTTTCCTAATACT
AATATTACCTAATAATTTTGCAGGTAGGTTTCCATGGTTCTCATATGAAG
ATGCTCCCTGTTAGTGCAGCTTTCCATTGGCAGTCATTCACTGAAGAAGC
TCCAACTGCTGATGATGGTGATACTTTCACAAAGTGGGGGTTGTATGAGC
AGTTAAATCTTACTAGAGATTACTCAGATTATTTGTGGTACCTCACAGAG
TAAGAACTATAGTCTATAGATACTATCATTATCCTGTCCTGTGAAAAAAC
TATTACTAAAACTCTAACTATCTTGGTAAAACAAATTTCATATTCTTACT
CTGTTCTCACCAGCGTGAATATAGCCTCAAATGAATGGTTCCTCAAGAAC
GGAAAAGATCCTATTCTTACGATTGCGTCAGCCGGACACACTTTGCAGGT
TTTTGTCAATGGACAACCGTCAGGTAAATGGACTAATAGTTGTTGCAAGA
TTTTGTATTGTGGAGTATCTCCCTAATTTCAAAATCTGTCTCCAATTTCT
AAAACTGCTTCACAACTTTTTATAATGAAAGCAGTCGTAATATCCTCTGA
TAAATATAAAATGAGGAGTTTACTCTTGCATTGGAGTCAATTATTAGTGC
TTATCTTTGTTTTCATCGTTTAAATGTTCTTTAATTTGTGAAATTTCTCT
TTAATGACAGGAATTGCTTATGGAAGTCTGGAAAATCCAAAACTGACATT
TACCGGCTCCGTTAAATTGAGGGCCGGCATTAACAGAATTTCTTTGCTAA
GCTCTTCCATGGGTCTTTCGGTTAGCTTCGTCAAACCTTTTGCCTTACAA
TTTTTGTTTTCGATTATTATTTGTCAGCTGATATGACATCTAATCTAAAT
TCCTTCACAAATGTGTTTCAGAATGTTGGTGTGCATTATGAGACATACAG
CACAGGGATTCTTGGTCCAGTTACCTTAAAGGGTCTAAATGGGGGAACAC
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GAATATCTACAGCTACAGTTCCTTTAACTGTGTACATCTTAGAAACATTA
AGATAAAGACTGACCAAAGTTGGTTTAAAGAGAGATTGGCAAGGACGTTT
TGAGGATTTGCGATCGAACTTGACATCTTTTTTTAACTTCAAGAAATGAT
AAGAGAGAAACAGTATATATCAGAAATTTAGTCAATGCAATGTAGAAGGC
TCGAGGTACAGATAAAGGGGTAAATCTTGATCCCGTTTTTTCCTTGTTGT
CCAGGTTGGTTTAAAAGGCCAAACTATGAGTCTTCACACACTTGGTGGAA
GTTCTTCTAGTAATTGGCTAGAAGGATCATTGGTTGGTCAGAAGCATCCA
CTATCCTGGTACAAGGTAATTTCATCAATTCAAATTTTATTTTTATGGGC
AGAGTTAACGTATAGAGATAAATAAGAGCTATATATGGTAAATGTGGTTT
TTATTCATCAATATTTTTAAACTTTTCAGGCTACTTTTAATGCTCCACGA
GAATCTGGCCCATTAGCATTAGATATGAGTAGCATGGGGAAAGGTCAAAT
TTGGATAAACGGCGAAAGTGTTGGACGCCATTGGCCTGCTTACATCGCTC
GTGGTAGCAACTGTGGCACCTGCAGTTATGCAGGGACTTACACTGAAAAG
AAGTGCTTGAGCAATTGCGGACAACCCTCTCAAAAATGGTGAGACGAGAG
CCCTATACATATTTAAGTGCCAATTTTTTTTTTTTTTTGCAACAAAAGGG
AAAAAAAAAAGAAGAGTTGCTAAAGTACAAGTGTCAAAATTTTGTTTTCA
GGTATCATGTCCCCCGATCATGGTTAAAACCAACCGGGAATCAGCTGGTT
ATTTTTGAAGAATGGGGAGGTAATCCATTCGGGATTTCACTGGTCAGAAG
AACATTGTGATCAGAAAATCGAAGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCAGCACTA
TACTATACAGAAGAATATAAATAA

Sequence Length

4774

Sequence MD5 Checksum

49b3e7f32a928571dff3f1d787d3e177

Relationship

The mRNA DCAR_011975 is a part of Gene DCAR_011975
The Genetic Marker MK002180 ESSR-075 is adjacent to Gene DCAR_011975

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False