DCAR_011162 | CarrotOmics Tripal4

Cds

>DCAR_011162cds ATGGCAAAAGGTCCTGGTCTCTACTCCGATATCGGCAAAAAAGCTCGAGA TCTTCTTAACAAGGATTATCAGAGCGACCAGAAGTTCACTCTCAGCACTA CCTCTGCTACTGGAGTTGCTATCACTACTTCAGGAACTAAAAAAGGAGAA CTGTTCTTGGCTGACCTCAATACACAGCTGAAAAACAAGAATGTCACTAC TGACCTGAAAGTTGATACAAAGTCCAATATTTTTACTACTGTTACTGTTG ATCAACCTCTTCCTGGGTTGAAGACTATCGTCAGCTTTGTACTTCCAGAC CAGAGATCTGGCAAGCTGGAACTTCAGTATTTGCATGACTATGCTGGAAT CACTGCCAGCATTGGGTTGAATGCAAATCCCGTTGCCAACTTCTCAGGTG TCTTAGGAAACAACATGGCCTCAATTGGAGCAGATGTCTCCTTTGACTCT AAAACAGGGAACTTCACCAAGTGCAATGCTGGATTTGGCTTTGCTCATGC AGACCTGACTGGTTCATTGACCCTGAATGACAAAGGTGACACCTTGAGTG CGTCCTACTATCATACAGTGAACCTTTTGACGAATACAGCAGTTGGTGCT GAAGTGACACACAAATTTTCAAGCAATGAGAACACCATAGCTATGGGCAC TCAGCACGCATTGGATCCTCTTACTACAGTGAAGGCACGTATTAACAACA ATGGCAAGACAAGTGCTCTTATTCAGCACGAATGGCGACCAAAGTCTCTT TTGACCTTGTCTGGTGAGTATGATCCCAAGGCTGTGGAGAAGACTCCTAA GTTTGGGTTGGCTCTGGCTCTCAAACCTTGA

Locus_tag

DCAR_011162

Name

DCAR_011162

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_011162pep MAKGPGLYSDIGKKARDLLNKDYQSDQKFTLSTTSATGVAITTSGTKKGE LFLADLNTQLKNKNVTTDLKVDTKSNIFTTVTVDQPLPGLKTIVSFVLPD QRSGKLELQYLHDYAGITASIGLNANPVANFSGVLGNNMASIGADVSFDS KTGNFTKCNAGFGFAHADLTGSLTLNDKGDTLSASYYHTVNLLTNTAVGA EVTHKFSSNENTIAMGTQHALDPLTTVKARINNNGKTSALIQHEWRPKSL LTLSGEYDPKAVEKTPKFGLALALKP*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr3:33184489..33187742+

Type

gene

Unique Name

DCAR_011162.gene

Sequence Residues

ATGGCAAAAGGTCCTGGTCTCTACTCCGATATCGGCAAAAAAGCTCGAGG
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TGTGTGTTTATTTGTCAATTCATTGGTAATTGTAACAAACTAATGAGAGA
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TCATCTGAACTTAGATTTATACTTTGTCTACCTGAGCAGCTGGAACTTCA
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AAGTATACCATTTGACGATAAGAATAAACTATTAAGTTGCATTATCCTTT
TAATATGTATATTTATGCATATTCTATTCTGTTGGCTTTGTACTAGTCCT
TTGTATTGTTGCAGTATCTGTTCGGTTTGTTTGAGTCCCAGTGTATGTAG
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AAGTTCTTGCAAGGGTATTGTGTGCTTAACCTGTTGCCACTTGCCAGTGT
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CGAATGGCGACCAAAGTCTCTTTTGACCTTGTCTGGTGAGTATGATCCCA
AGGCTGTGGAGAAGACTCCTAAGTTTGGGTTGGCTCTGGCTCTCAAACCT
TGA

Sequence Length

3253

Sequence MD5 Checksum

cbd5b2a1297c6c44d541f50b19cc8727

Relationship

The mRNA DCAR_011162 is a part of Gene DCAR_011162
The Genetic Marker MK016730 SSR0399 is adjacent to Gene DCAR_011162

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False