DCAR_005053

Cds
>DCAR_005053cds ATGTGTAATGCTTATCATGACAGAGACAGGTTTTCTGCTGGGAAGGTAGT CAAAGAAAATAACTGGGGGCATTTAAAGTTTACCTCATCAGATCAGAAAG TGACAAATAAACTTACCCAGAGGCCTGCTAAGAGGCAGTGCCTTGGTGAT GGTCCAAGTGGAGCTGATAATGGTGGTGCATCCAGTGATAGTGATGAGCA AAGTTTGACTGCTTATTATGCAGGTGCTGTAGCACTTGCAGATACACCAG AAGAGAAGCAGAGAAGGGAGAGTCGTTCAAAACGTTTTGAAAAAGCACGT GGGAATCGGTCTGCAAATAATTATTCTAGAGTCAAAACTGTTGGAGCTGG ATTGTATACTAAAAGAACTCATGCATTGGTGCTTAAAAAAGATTTCGAAG AAGGCAACAGCAGAGCTGTTGAAGATATTGACTGGGATTCTCTTACTGTC AAGGGTACCTGCCAGGAAGTTGAAAAGCGTTATCTTCGCCTTACTTCTGC ACCTGATCCTGCCACTTGTGGCATTTTCAGATTGTCAGTTGATGCAAGGA AAGATGTCGCTGTTAAACATGCTCTTGCGGTGCGTGCAGCTGTAACATCT GGAAATTATGTATTGTTCTTTAGGCTGTACAAGGAGGCTCCTAATTTGAG CACTTGTCTCATGGATCTGTATGTAGAAAAGATGCGTTATGCGGCAATGA AATGTATGTCTCGTTCATATCGCCCTACGCTTCCTGTCGCATACATTGCT CAGGTTCTAGGCTTCAGTAGTGTCTTGCCCACGGCTGAGCAAAATGATGA GAAGGATGTTGATGCAATAGAGGAGTGTGTGGAATGGTTGAAGGCTCATG GTGCATGTCTTATTACAGATAATCCTGACGAGGTGCTACTTGACGCAAAG GCAGCATACAGACTTCACTTCAAACTTGTCTATTCTTTATTGATATGTTC TGGAGAGGACATAACTTTACATTTAGACACTAAACCCATAAATGTTTCTG TATGTCCTTGTGTGCAGGCTTCAGTATCTAGTCTCTTCATGCCAGAACCA GAAGATGCTGTTGCTCATGGAGATGCAACTCTTGCCGTTAATGATTTTTT GACTCGGGTTCCTTCATTACCAAATTGA
Locus_tag
DCAR_005053
Name
DCAR_005053
Organism
Daucus carota subsp. sativus
Pep
>DCAR_005053pep MCNAYHDRDRFSAGKVVKENNWGHLKFTSSDQKVTNKLTQRPAKRQCLGD GPSGADNGGASSDSDEQSLTAYYAGAVALADTPEEKQRRESRSKRFEKAR GNRSANNYSRVKTVGAGLYTKRTHALVLKKDFEEGNSRAVEDIDWDSLTV KGTCQEVEKRYLRLTSAPDPATCGIFRLSVDARKDVAVKHALAVRAAVTS GNYVLFFRLYKEAPNLSTCLMDLYVEKMRYAAMKCMSRSYRPTLPVAYIA QVLGFSSVLPTAEQNDEKDVDAIEECVEWLKAHGACLITDNPDEVLLDAK AAYRLHFKLVYSLLICSGEDITLHLDTKPINVSVCPCVQASVSSLFMPEP EDAVAHGDATLAVNDFLTRVPSLPN*
Sequence Coordinates
DCARv2_Chr2:3940019..3946488-
Type
gene
Unique Name

DCAR_005053.gene

Sequence Residues
ATGTGTAATGCTTATCATGACAGAGACAGGGTTATGTCTATGCTTGTATT
CTGAGGCGTACACCTAGTATTGTATTGTGTATATATGTGTGCATGTTTGT
GTACACAGCACACAAGTCTACTTGTATACCTATATCTACTTGTATTCATC
TCTGACATAAAACTGTCGTTTGTCAAGGATAGTGAGAGCACCCCTTATAA
ACCAAATTTTCGTTAAATATTATTTGTTATATTTGGATTTGGCTATAAAA
AATTAACTTTTTATATGCGTTGCATGTGGTGCTGTGCTAGTTATTACTTT
TCCCTGCTTTGCTTGTTGTCCATGCTCTTATCTGTTTGATTACATCCTTA
TTAAACAATATCATATAATCATTTTCAAGTAATATGAGAACTGAGTTCGA
TTACTATATTACCATAAGTTCAAATTAAAATTTATTCAAGTGCAATGTTT
ACAGTTTTCTGCTGGGAAGGTAGTCAAAGAAAATAACTGGGGGCATTTAA
AGTTTACCTCATCAGATCAGAAAGTGACAAATAAACTTACCCAGAGGCCT
GCTAAGAGGCAGTGCCTTGGTGATGGTCCAAGTGGAGCTGATAATGGTGG
TGCATCCAGTGATAGTGATGAGCAAAGTTTGACTGCTTATTATGCAGGTG
CTGTAGCACTTGCAGATACACCAGAAGAGAAGCAGAGAAGGGAGAGTCGT
TCAAAACGTTTTGAAAAAGCACGTGGGAATCGGTCTGCAAATAATTATTC
TAGAGTCAAAACTGTTGGAGCTGGATTGTATACTAAAAGAACTCATGCAT
TGGTGCTTAAAAAAGATTTCGAAGAAGGCAACAGCAGAGCTGTTGAAGAT
ATTGACTGGGATTCTCTTACTGTCAAGGGTACCTGCCAGGAAGTTGAAAA
GCGTTATCTTCGCCTTACTTCTGCACCTGATCCTGCCACTGTAATCTTAT
TCACACCCTCCTTGTATTGAACATGTGAAATAATGTTCGTTTTTAAATAA
AGTTTAATTGAATAAAAACACTTTTTCCTATCAGGTGAGGCCTGAAGAGG
TGTTAGAAAAAGCTCTTGTCATGGTTCAGGGTTCCCAGAAGAACTACCTT
TACAAATGTGATCAGTTAAAATCTATCCGTCAAGATCTGACCGTACAGCG
GATACGGAATGAACTCACAGTTAAGGTACTATTCTTGAAGTGCTCAATAT
AGTGTCTTTAAGGATGAACTGTATGTCATGAACAATCTGAAATGGTTTTG
TTTTTTTCTTTAATCCTATAACAACTTATTCTGTAAAGCTGATTGTACTT
TGCTTCCATTTTTTTTTTGTTTCATGGTAAGCCAAACTCCAGAACTAGTG
GTTTCTAAGATTAGAAGTAATTCTTTGTTTCTGTTATCTTGTTTCAGGTC
TATGAAACTCATGCTCGATTAGCAATTGAAGTTGGTGATTTATCAGAGTA
TAATCAGGTTCGATTGTAATATGTTCAATGATTAGGCATTTCATCTTTCA
AATTGTTGTTACCTTGATGTTGTATGATTGGTTACTGATTTACAGGCTTC
TATAGTCGATCAAATTACTTTTCTTGGCTAAAACAATTGCTAATCTCAAA
ACATAAGCATCAGCGCCCTTATATATATATTTGTGGCCTGAATTTCACTT
TTTATAGTTCATAGATTACTTGAACTATAGGATTATAAATCCTGTTAATC
CCCAATCTCATGCAGTATCAAGCATGTTTGTGTTTTTCCAATCTCTGTGT
GTTTTCTTCCATGTATTTGCCTTGAATTTATCCTCAGTTTTAGGCAATCA
GCTGGAGTAGAATAATGGTACAAATCTGTACTTAAAATTGAAATATTGAT
TTTGAATCTTTGATAGAAATTTTGAAATCTTGCCTTGGATATTCAAATCA
AATTATGGATTCTTTCGCTTGCAAGAAATACTATGTCGCAGAAAGTATCA
GCAATTCACTGTATCAACTTGTCCTGTGGATGTGTACATTTTGTTCTTCA
AATCATCTATTTGATATAGTGGTTCACCATTTATCTCTTTTGCAGTGTCA
ATCTCAATTGCAAGTACTTTATGCAGAAGGAAACAAGGGATGTGATATGG
AATTTTCGGCTTACAATCTTCTTTGTGTTATTCTGCACTCAAATAATAAC
AGGGATCTCTTGTCAGCCATGTCAAGGTTAGTAAGATGCACCAAAGAACA
AATTACATGATTACTACTTAACATATCAGATATGTTGTTAAAACGTATAC
AAATAGGCTCTAAAGGTCCATCTATGGTTGAATGACTTGATTTATTTTAA
GTAAATTGTTCTCTACAAAGTTCTTGAACAAATTGGTGCTGCCGTGCTGG
TGATAATATTGACTAGAAAAAAGCTTCTTTACTGAGAATTTTTATATTTT
AGTACTTGTTAAATGATTAGTTGCTATAATTAGGAGGCACCCATATACTT
TTTCATTTCTTTGCTAATTGGAGAAATGTTTTAATTAGTTAATAGTGAAG
AAGTGCAGAAGATGTGCTCTCCTTAGCATTTGTGAGCTGAGAGAAACTGG
GCATAAATTTATATTGGTGGTGAGAATAGTTAGCTACACAAATAATTAGG
ATACAATGGATCGCGCTCAAGAGAGAACCAAGTCTTAAAAAAGAACCATA
GAACCAATTCTCAACCTTTAGATTCATTTAGATTTAATGGCTCAAGATTA
ACATAGCGAATCTTTAAAAATATTATGACAATCAGTATAAAATATGTATA
ATCAATTATAAGGATAGTGGTGTAATTTTACATATATTGCCATTTATTGA
AAATCAATCAAGATCAATCATAAACGACAGTTACAACTTAGTTGTATGTA
TTACTTTGATCAGATTATTTTTCATATTAAATGAACTCCACTAATCTTGT
CAGCTCTACTATTCTTACTCATTTTCTCTTCAAAATTTTATAATCTCATT
GTACTTTGTTTTTACCTTTACTTGATTCCTTTTTAAAAGTGAATATATAG
AAAGGTTCCGTTGTAGGATCCTAAATTTTCATGATCTAGCATGTTTGTAC
CACTTTTCTAAAGTGAATATACACAAAGGTTCTGCTACAGAACCCTTTTT
TAAAATGAATATACACAAAGGTTCTGCTACAGAACCCTTTTTTAAAATGA
ATATACACAAAGGTTCTGCTACAAAACCCTTGTCAATACTTGAAGATTTA
AAGGGTTCCTAGGCTAAGGGTTCTAAGAGGAACATGATCCCTTGTACCAC
GATTAAGTAATGAGGAATAAAATAAAAATCTCAAACATAATCAACCCACT
ATATATATGATTCACAGGATCGAAGATACAAAAATTATAGAGGTAGCTAA
TAGAAACTTGTAAGTTTCGCATTGGAAATTTAGCTTTTGTGATGATATTT
CAATCAAATGATCTGTAATGTACCACTTTTTTCCCAATGAACACAATACT
CAATCCATCATAACTATGCTCAGTCATTTCGAACAACCAAATTGTAAACT
TGTTGGATTTGACTTTTTATAGACAAAGGTTCAGCAGATGAACTTTAATG
TTTGTACCACTTTTTTTCAATTCCACACAAATACTCATCCCACCATAAGT
ATGCTCAGTCATTTCAAACAACCAAATTATAATCTTGTTGGATTTGACTT
CCTATATACAGAGGTTTAGCGAATGAACCTTTATGTGCCGCTTCAGAATT
TTAGAATTGTAATAACACTTTAAATCGAACGCCCTCCACATTACAACATT
CTTTTTCACATCAACAACAAAACTTGTTGGATTTGACTTCCAATGGACAG
AGGTTCAGACTATGAACTTTTACTGTTTGTGCCACTTTTTTCCCATTTCA
CACAAATACTCCTTCCACCATAACTATGCTCAGTCATTTCAATCAACCAA
ATTGTAATCTTGTTGGATTTGACTTCCCATATACAGAGGTTCTGCATATG
AACCTTTATGTGCCGCTTCAAATTTCAGAATTGTAATAAAACTTCAAATC
GAATGCCCTCTACATTACAACATTCTTTTTCCTATCAACACCAAAACTTG
TTGAGTTTGACTACACATAGACGATATTCAGCATATAAACTTTAATGTTT
GTACCATTTTTTTCCCATTTCACACAAATACTCCTTCCACTATAACTATG
CTCGGTCATTTCAAACAACCAAAACTTGTTGAGTTTGACTACACATAGAC
GATATTCAGCATATAAACTTTAATGTTTGTACCATTTTTTTCCCATTTCA
CACAAATACTCCTTCCACTATAACTATGCTCGGTCATTTCAAACAACCAA
ATTGTAATCTTGTTGGATTTGACTTCTTATATACAGAGGTTCAGCATACG
AACCTTTATGTAGCGGTTTAGTTAAGGTGGAATTTTATGTGCCGCTTTAT
GTGCCACTTCAGTTATGGTGGAATTTTAGATCTGTAATAACACTTCAATT
CAAACACCCTCTACTGTACAACATTCTTTTTTATATTAACACCAATACTC
ATTCCATCATTATTGTTTTTAATCACCTCCGACAACACACTTGTAAACAT
GGTGGATACGACTTCCTCTAGATAGAGGTTCAGCATGTGAACCTCAATGA
CGAGTGTATGTATATATATGTATATATCTGTTCTCACCTTCTGCAGAGAA
GCTTGATTCGAGTATGCTGAAGATTTGATGATTCGATGCTGCTGATGTAA
TAGCGTTGGTAATATGGGAAAGTTGTCAATTAAATCAAAATTGGGCGCTG
ATTTTTATCCTAAATATTTTGGGTCTATACTGCCCTTGGCTATGTACCAA
ATATACTATATATTTTTTTTATTTAAAATAATTGTGGTTCTATGGTTCTA
TGGTTAGTGGTTCTCTCTAGAACATGACCCTACAAATGTATATAAAAAGA
AGAAGAAAGAGTTCCTTGTAAAATGACTGTAGAATGCAACCACAATTGGA
ATTAGGTACATGGAAGGGGTTTGTAACAATTCAACAAAAAGATTACTCAA
GAGTTCCGTAACAAATGGAAACAAAGGATTACTGAACGAGGAGCTTTCTA
GCACACACATAATTGATACCATACCTCCTAATAAACACATGACAGAGGTG
TACATAAAAGAAAAAGGAGATGTCTGTTTGCATGACTTGGCATCCGCTCT
CTCTCTAAAGCTTTTCGATATGGTGTTGTTGGTTCTGTGGTCAAATCTTA
TACATTGGTGATATATCAGTTGGAAATGGTAGACATATAGTGAAGACATT
TTACCAAAGTACAACTATGTACTCCCTCTGTTTCTAAAAACCTTTCCCAT
TTGAGATGTCGGCACTGTTCATAACATGAGACAAATTACTAATTTACGTC
TAATCTATAAGACTAAATATAGTCATGAGTGATCTTTGATTCGTTTTTAT
GAGTACTTTAATACGGTGAAGTTTTTATATTTAATACTAATACAAAATTA
AAGATATTAATGATCAAAAGTGTGTGTTGGCAAGCGTGATAAACACAAAT
AGGAAAAGTATTTAGGGACGGAGGGAGTACTGTTTTTGGTCCCATATCAT
CACAATAACATTTCTATATCGTTCTTGATGCAGTCACGCATTTATTGACT
CCCTGATCTGTTTTACATTTTTGTCACATAAGTTTCATTTATCAAGTTTA
ATTTGAACTTCATAGTGTGGCATTTTCAGATTGTCAGTTGATGCAAGGAA
AGATGTCGCTGTTAAACATGCTCTTGCGGTGCGTGCAGCTGTAACATCTG
GAAATTATGTATTGTTCTTTAGGCTGTACAAGGAGGCTCCTAATTTGAGC
ACTTGTCTCATGGGTTAGTCTCTGATAGTGAATGTAGTCTTTTTTATGAT
ATGTCATTTTGTTTATCTGTAATTTTCTCTTCACAGATCTGTATGTAGAA
AAGATGCGTTATGCGGCAATGAAATGTATGTCTCGTTCATATCGCCCTAC
GCTTCCTGTCGCATACATTGCTCAGGTTCTAGGCTTCAGTAGTGTCTTGC
CCACGGCTGAGCAAAATGATGAGAAGGATGTTGATGCAATAGAGGAGTGT
GTGGAATGGTTGAAGGCTCATGGTGCATGTCTTATTACAGATAATCCTGA
CGAGGTGCTACTTGACGCAAAGGTATGTTGCAACTTAGACGTCATCTTGA
AATGCCCAAAGAGTAACTTGAAATGCCCTTTAGTTAATCCTTATGTAGTT
GAGTTGCTACATGTATTAAATTCTGTGTTTTCTCTTCACAGGCAGCATAC
AGACTTCACTTCAAACTTGTCTATTCTTTATTGATATGTTCTGGAGAGGA
CATAACTTTACATTTAGACACTAAACCCATAAATGTTTCTGTATGTCCTT
GTGTGCAGGCTTCAGTATCTAGTCTCTTCATGCCAGAACCAGAAGATGCT
GTTGCTCATGGAGATGCAACTCTTGCCGTTAATGATTTTTTGACTCGGGT
TCCTTCATTACCAAATTGA
Sequence Length
6469
Sequence MD5 Checksum
8b855dc73206188eb827db7466b633af
Relationship
Database Reference Annotations
GFF_source:.
Publication
Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.
Analysis
Is Analysis
False
Is Obsolete
False