DCAR_004536

Cds

>DCAR_004536cds ATGGGCTCCCAAGGCGGCTTCGGCCAATCCAAAGAGTTCCTCGACTTGAT CAAATCAATCGGCGAGGCGCGATCCAAAGCCGAAGAAGATCGCATCGTTC TGCACGAGATCGAGACGCTCAAACGCCGAATTATCGAGCCGGACATTCCG AAACGCAAGATGAAAGAGTACATCATTCGATTAGTTTACATCGAGATGTT AGGTCACGATGCTGCTTTCGGATACATTCACGCTGTTAAAATGACTCACG ATGACTCGTTGTTGTTGAAACGGACTGGTTATCTTGCGGTGACGTTGTTT TTGAATGAGGATCATGATTTGATAATTTTGATTGTGAATACAATTCAGAA GGATTTGAAGTCGGATAATTTTTTGGTTGTGTGTGCGGCATTGAATGCGG TCTGTAGGTTGATTAATGAGGAGACGATTCCAGCTGTGTTGCCACAGGTT GTGGAGTTGTTGGGACATAGTAAGGAGGCGGTGAGGAAAAAGGCAGTTAT GGCTTTGCATAGGTTTTATCAGCGCTCTCCTTCTTCGGTGTCACATTTGG TGTCGAATTTTCGTAAGAGGCTATGTGATAATGATCCAGGGGTGATGGGT GCGACACTATGTCCTCTTTTCGATCTTGTTTCAGTAGATGTTAGTTCCTA CAAGGATTTAGTTGTAAGCTTTGTGAGCATTCTCAAGCAAGTAGCTGAGC GAAGATTGCCGAAGGCTTATGATTATCACCAGATGCCAGCTCCATTCATT CAGATCAAGTTGCTGAAGATACTAGCACTTCTCGGTAATGGTGACAAGCA GGCCAGTGGACAGATGTATACTGTTGTTGGTGACATAATGAGGAAGGCCG ATACTACAAGCAATATAGGGAACGCCATTTTATATGAGTGCATCTGCTGT GTTTCATCTATTTTTCCTAATACAAAGTTATTGGAAGCTGCAGCCGATGC AATTTCCAAGTTTCTAAAGAGTGACAGTCATAATCTGAAGTATATGGGTA TTGATGCCCTTGGTAGATTGATAAAGATAAGTCCAGACATTGCTGAGCAG CACCAACTGGCTGTAATTGACTGCTTAGAGGACCCAGATGACACTTTGAA ACGAAAAACTTTTGAACTTCTGTATAAGATGACAAAGTCCTCTAATGTGG AAGTCATCGTGGATCGAATGATTGAGTATATGATAAACATCAATGATAAT CATTACAAAACCGACATAGCTTCCAGGTGTGTTGAGCTTGCTGAGCAATT TGCACCAAGCAACCATTGGTTTATCCAGACCATGAACAAAGTCTTCGAGC ATGCTGGTGATTTAGTAAACATTAAGGTGGCACATAACTTGATGCGGTTG ATTGCTGAAGGATTTGGAGAAGACGATGATACTGCTGACAGTCAACTGAG ATCATCTGCTGTAGACTCCTATTTGCGCATCATCGGAGAACCAAAACTCC CATCAGCATTTCTCCAGGTCATATGCTGGGTGTTGGGGGAATATGGAACC GCAGATGGAAAATATTCTGCTTCTTATATCACTGGAAAGCTATGTGATGT GGCAGAGGCACATTCAACTGATGACACTGTCAAGGCATATGCGGTAACCG CGCTTATGAAGATATACTCCCTTGAGATAGCTGCTGGGCGACAAGTTGAC ATGCTGCCAGAGACCATGAACAAAGTCTTCGAGCATGCTGGTGATTTAGT AAACATTAAGGTGGCACATAACTTGATGCGGTTGATTGCTGAAGGATTTG GAGAAGACGATGATACTGCTGACAGTCAACTGAGATCATCTGCTGTAGAC TCCTATTTGCGCATCATCGGAGAACCAAAACTCCCATCAGCATTTCTCCA GGTCATATGCTGGGTGTTGGGGGAATATGGAACCGCAGATGGAAAATATT CTGCTTCTTATATCACTGGAAAGCTATGTGATGTGGCAGAGGCACATTCA ACTGATGACACTGTCAAGGCATATGCGGTAACCGCGCTTATGAAGATATA CTCCCTTGAGATAGCTGCTGGGCGACAAGTTGACATGCTGCCAGAGTGCC AATCTTTAATCGAAGACTTATGCGCATCGAGCTCAACGGATTTGCAACAA CGTGCTTATGAGCTTCAAGCAATTATTCGCTTGGATGCTCAAGCTCTTGA AAATATATTGCCACTGGATGCTAGCTGTGAAGACATTGAGGTTGATAAAG GGCTTTCATTCCTCAACAGTTATGTCCAGCAGTCTCTGGAGAATGGGGCT CAGCCCTATATTCCTGAAAGTGCACGTTCCGGGGTTTTAAATATGAGCAA CCTTAGAAGCCATGACCAACAGGAAACTTCAGGTCATGCTCTTAGGTTTG AGGCTTATGAACTTCCAAAACCCACCATGCCCACAAGTAGACCTGCTACC ATAATGCCCTCAACTGAGCTTGTCCCAGTACCCGAGCCATCTTATACGAG GGAAATACACCAGACTCCAGCAGTGCCATCTATTTCTCACAGTGGATCAG CAGAATTAAAGCTTCGACTTGATGGGGTTCAGAAGAAGTGGGGAAAGCCA ACATATTCATCTCCAGTGCAATCAACCTCAAACTCTGATTTTCAGAAGAC TGTCAACGGAGCAGCTCAACCTGATGCTACAGGTAGTACAAAACAAAAGG CACGGGATGTATCCCATGATATAAAAAAACAGGAAGTTGAAATACCCTCA GAAAAGCAAAGACTCGCTGCTTCTTTGTTCGGTGGTGTTTCTAGGTCTGA GAAGAGACAAACTGCTGCTGGCAACAGGGGGGCTCCGAAGGCAAACAGCG GTGCAACAGAAAGTCCTCACATGACCAAGGTAGCTACTTCATCTGAACCC AGTACAGTGAAGACCGCTCCTGTCCAACCTCCTCCAGACTTGTTGGACTT TGGAGAATCAACTGCAACAAGTGATGCCCCTTCCACGGATCCGTTCAAGC AGTTGGAAGGTTTAGTTGATGTAACACAAGATGGATCAGCTGCGAATTCT GGTTCAGTTGCTACTAAAGCATCTGATTTTATGTCGCTTTACAGTGAGAG GCCTGGCAATGTGCCAAGTAATCTGATCGATCCTAGTATTGATGTTAATA TGAGTTCAGGTCTATTAAATGCAAGCAACAATTTTGACCATGGTGCAGGC GTGGTGGCACAGTCGCCTCAATCAGCAAATAAAGGTCCAAATCTTAAAGA TGCTTTACAAAAGGATGCTCTAGTGAGGCAAATGGGTGTGACCCCTACAA ATCAGAATCCCAACTTATTCAGAGACTTGCTTGGCTGA

Locus_tag

DCAR_004536

Name

DCAR_004536

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_004536pep MGSQGGFGQSKEFLDLIKSIGEARSKAEEDRIVLHEIETLKRRIIEPDIP KRKMKEYIIRLVYIEMLGHDAAFGYIHAVKMTHDDSLLLKRTGYLAVTLF LNEDHDLIILIVNTIQKDLKSDNFLVVCAALNAVCRLINEETIPAVLPQV VELLGHSKEAVRKKAVMALHRFYQRSPSSVSHLVSNFRKRLCDNDPGVMG ATLCPLFDLVSVDVSSYKDLVVSFVSILKQVAERRLPKAYDYHQMPAPFI QIKLLKILALLGNGDKQASGQMYTVVGDIMRKADTTSNIGNAILYECICC VSSIFPNTKLLEAAADAISKFLKSDSHNLKYMGIDALGRLIKISPDIAEQ HQLAVIDCLEDPDDTLKRKTFELLYKMTKSSNVEVIVDRMIEYMININDN HYKTDIASRCVELAEQFAPSNHWFIQTMNKVFEHAGDLVNIKVAHNLMRL IAEGFGEDDDTADSQLRSSAVDSYLRIIGEPKLPSAFLQVICWVLGEYGT ADGKYSASYITGKLCDVAEAHSTDDTVKAYAVTALMKIYSLEIAAGRQVD MLPETMNKVFEHAGDLVNIKVAHNLMRLIAEGFGEDDDTADSQLRSSAVD SYLRIIGEPKLPSAFLQVICWVLGEYGTADGKYSASYITGKLCDVAEAHS TDDTVKAYAVTALMKIYSLEIAAGRQVDMLPECQSLIEDLCASSSTDLQQ RAYELQAIIRLDAQALENILPLDASCEDIEVDKGLSFLNSYVQQSLENGA QPYIPESARSGVLNMSNLRSHDQQETSGHALRFEAYELPKPTMPTSRPAT IMPSTELVPVPEPSYTREIHQTPAVPSISHSGSAELKLRLDGVQKKWGKP TYSSPVQSTSNSDFQKTVNGAAQPDATGSTKQKARDVSHDIKKQEVEIPS EKQRLAASLFGGVSRSEKRQTAAGNRGAPKANSGATESPHMTKVATSSEP STVKTAPVQPPPDLLDFGESTATSDAPSTDPFKQLEGLVDVTQDGSAANS GSVATKASDFMSLYSERPGNVPSNLIDPSIDVNMSSGLLNASNNFDHGAG VVAQSPQSANKGPNLKDALQKDALVRQMGVTPTNQNPNLFRDLLG*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr1:49032583..49043927-

Type

gene

Unique Name

DCAR_004536.gene

Sequence Residues

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CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTCTGGTTTGCATTGAACATTCAACTT
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GTCCGAGTAACATAGCAAACGGGTCAAGAAAAGCAAAAGCCAGAAGCAAC
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CTTGACAAATATTGGTTTAATTGGTTTCTTTCTCGTTTGCTTACTAGTTC
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TCTGTGTCTTCTCTGTCTAGCTAGTGATACAATTATGTGTCATAATCCTT
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TGTTGACAGCTTGTCCTTTCTTGTTTGCCCTACAGACCATGAACAAAGTC
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AGCTATTGAAGGCCATTATTGTAATATGCCAATGATGCTGTTCCATCCTG
TTAAATTTTGGCAGTTTACTGTTAGTTTGTACAGCATATTCTGTTACTTC
TTTTCTGCTTTTGTAAGTGGGAACTGTTTTCTGTGAGCAGGTAGACTCCT
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TTAATTTTTTTAAGTATCTGGAGAACTAATTTATTTTTTTCGGTGTATTG
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TTTTCTTTCCTTTCCACAGTGCAAGTAAAATTTTCAACCCACAGTTGAGC
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TGGAGACTGGATATATTTGACCAAGGAATTTTGGTTTTTCAAATAAATAA
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CGCATTGTGTTAGATTGATTTGTGGAGATAGTGCCTGTATGTGCTTTGAG
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CCCCTTAAATAACACTGATCTCATGCGATCTAAACAATGACCATCATGTA
GACCGCATTTTATATTATACTTGTTATATTTTTCTGAGTCACTCAACAAG
CTTACATGGACACTGATGACTGTCCATGGCCTGAAGATTTACTGAGCTTG
TGTGCACATGTTTTTATCTTCTTTACATACTGATTTGACCTATAAAAGAA
GTTTGTGCTAGTTACTGTGCTATTACTGATTACAGATTCTGTATATTACC
CGTAGTGTTACTATCAGTGTTCTCTGACACTGGCTTTTCAGCTATATGAC
CTACCTGACTTTATTACAAATTCATGAGTGTTATTTTTACGCGTTTCTTC
TATTCTAAACCTTTACTCAAGAACACCCATACACTACTTGCTGCAGGTTG
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GGGGCTCAGCCCTATATTCCTGAAAGTGCACGTTCCGGGGTTTTAAATAT
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GGTTTGAGGCTTATGAACTTCCAAAACCCACCATGCCCACAAGTAGACCT
GCTACCATAATGCCCTCAACTGAGCTTGTCCCAGTACCCGAGCCATCTTA
TACGAGGGAAATACACCAGACTCCAGCAGTGCCATCTATTTCTCACAGTG
GATCAGCAGAATTAAAGCTTCGACTTGATGGGGTTCAGAAGAAGTGGGGA
AAGCCAACATATTCATCTCCAGTGCAATCAACCTCAAACTCTGATTTTCA
GAAGACTGTCAACGGAGCAGCTCAACCTGATGCTACAGGTAGTACAAAAC
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CCCTCAGAAAAGCAAAGACTCGCTGCTTCTTTGTTCGGTGGTGTTTCTAG
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GAACCCAGTACAGTGAAGACCGCTCCTGTCCAACCTCCTCCAGACTTGTT
GGACTTTGGAGAATCAACTGCAACAAGTGATGCCCCTTCCACGGATCCGT
TCAAGCAGTTGGAAGGTTTAGTTGATGTAACACAAGATGGATCAGCTGCG
AATTCTGGTTCAGTTGCTACTAAAGCATCTGATTTTATGTCGCTTTACAG
TGAGAGGCCTGGCAATGTGCCAAGTAATCTGATCGATCCTAGTATTGATG
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GCAGGCGTGGTGGCACAGTCGCCTCAATCAGCAAATAAAGGTCCAAATCT
TAAAGATGCTTTACAAAAGGATGCTCTAGTGAGGCAAATGGGTGTGACCC
CTACAAATCAGAATCCCAACTTATTCAGAGACTTGCTTGGCTGA

Sequence Length

11344

Sequence MD5 Checksum

bbabbd0ae5f35b4d8254333509d5c38b

Relationship

The mRNA DCAR_004536 is a part of Gene DCAR_004536
The Genetic Marker MK002454 K0028 is located in Gene DCAR_004536

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False