DCAR_004533

Cds

>DCAR_004533cds ATGCCACCTTGGGAAGATGATGATGAAGATGAATCGCTCGCTCGATTCCT CGAATCTGAGCTCTCCGATCAGGAGCCAGAGCAGACACAAGAAGATGAGG AAAAGGAAGGGCCAGCACAGAAGAGGCCGCGCATGGAGGTTGAAGCTGAT GTGACTGAGGAAAGGAAATTAACCAGTTCCCCTTCCCCAAGTCAAATTCG AAGTCCTTCCTCTTCAAGAATCGTCAAGTGTAATAGTAGTGGACATCGTG TCGAAGGTGGTATTGATAGAGTGAAATCAAGTAGAATAGATACTGGCTCG TTTAGCAAAGTGCCTCCGGAGTTATTCCATCACATCCTCAAGTTCCTCTC ATCCGAGGATCTCGTTTCTTGCTCAATGGTCTGCAGATTTCTCAGCTTTG TTGCTTCTGATGAATCCCTCTGGCGTCACTTGTACTGCATGCGATGGGGT CTTCTACGACCAAAGAGTAATTATCGTGATTGTGCTTGGAAGAAGCTTTA CATTCAGCGTGATGAAGAAGATATGGTTGAGTTTGTTAGAAATTGTCCAT CTGAATTCAAAGAGTATTACATCCAAATGCAGACGGCAAAGAGAAGCCAA GCACCTATTCCTTCTCAGGATGACCGTATGATTGTGGACAAGACAGTTGC TGATCAAGTCTATACGTGGAAGAGCAGTAAAGGTTTAATTGGTCAGGTGG CTACTGATCATGCGTGTTCCGGAAAGAGTTGCTCTTACTATCAGATAGGT GATGTTTTTGTATGTGAGAAGACAGGAAATATTCATGTGTGTGATGATAA TTGCAAAGATGCTTCTGTCGATCCCGCAAATGGGCTACTAGTTTGTACAA TATCTGGTCACTGTTTTGATAGATTGATGTCACCTTCTGATGAAATGGAT CAAGACGCTGATCAGCAACAAGATGGTATTACAGATGAAGCTGAGCCATT CATGGGATCCGGCCGTTTCGCACGAGCTTATTTGTTGGGATATAACTGTG CTGACGAGAAAGAGTTAGAAGCTTGTTTGAAGTTTTGCTGA

Locus_tag

DCAR_004533

Name

DCAR_004533

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_004533pep MPPWEDDDEDESLARFLESELSDQEPEQTQEDEEKEGPAQKRPRMEVEAD VTEERKLTSSPSPSQIRSPSSSRIVKCNSSGHRVEGGIDRVKSSRIDTGS FSKVPPELFHHILKFLSSEDLVSCSMVCRFLSFVASDESLWRHLYCMRWG LLRPKSNYRDCAWKKLYIQRDEEDMVEFVRNCPSEFKEYYIQMQTAKRSQ APIPSQDDRMIVDKTVADQVYTWKSSKGLIGQVATDHACSGKSCSYYQIG DVFVCEKTGNIHVCDDNCKDASVDPANGLLVCTISGHCFDRLMSPSDEMD QDADQQQDGITDEAEPFMGSGRFARAYLLGYNCADEKELEACLKFC*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr1:48985562..48989341+

Type

gene

Unique Name

DCAR_004533.gene

Sequence Residues

CGGCAGTTTACTTTTAATTTCCCGCAGTTGAATACACAAATTGAAACCCG
GCCCGAGTACACCATTGTCCGGATCAATCAATACCCGACCCGACTACCGT
GGCCAATCCATCAAAATATCAAACTTATCACCTAAATATCTTCTAGTTCG
ATTCCATCGATAGTGTTTCTAATCGGAGATCGGCCGGCGTATTTCCGGTT
ACCGGAGGTTAATATAACAGCTTTTATGCACTTTATATGTTTGTATAAAC
CTATACATACAAAAATTAGGGCTGTTTGTATGTAAAAATGCCACCTTGGG
AAGATGATGATGAAGATGAATCGCTCGCTCGATTCCTCGAATCTGAGCTC
TCCGATCAGGTAATTTAACTCTTCAATTGTTTAATTCCCTATTTCCTATG
ATTTTATTGGTTAATTAAAAATGATTATGTATTTATTTGCTAAATTAAAA
TGATGAAAACGATCTTGTTTTTGCTCTTTAAATGATGATAAATTTGCTTG
TTCTTTTATGTAATTATGGTTTGAGCTCTGGACTTTTTACGCTTAATTTG
GCTGCGGAATCCCCTTTTTCGGTTGTATATGTGTTATATATATGTGCAGT
TCCCTGTTAATTAAAGCTAAATTTGTGTAGTAGTGTTTGTATTTTTAGCT
AATTGCGTATCGAAAATTTATAAACCGTAATACTGTATGTTAAGTTAGTT
CGTTTATGTCCTTGTTTGTTTCATATAGTGAATTGTATATCTTTGCGGTT
CCATATGTTTTGTATGAGAACTTCTGAATTTTACTCTATAAAGATATATA
AAAGTTTTGTTGTACTGCTGCAAGTTGACGTTCTTTTTAAGTTGTGAATA
TAGAAGTTCATACCAGAATGCATACACTGTAAACATAGAGTGTAGGCGTA
GCAAGAATTAACTGAACAAATGCAGTTTCGGATATTTAGAATTGGACTAA
GAAAGAAAATGCGAACTAAGAATCAAAGTTTGGTCTCATGGGAAATTTGG
TTAAACTTTTGCGGAATGGGATTAGCATAAATGCTGTTTGTACCGTGCAA
AAATCTAAAAGTTAGTGATGTGTGATTTCTGACTTTTATATGCCTTGAAA
ACTAATTTTGTTGATTTGAGGAAACTAATTTTGTGCTACACACCCTCACA
CACATATACATACTACACTTTGGGTTTACTCAGCTCCAAGAATTAAATTG
TTTACAATTTGTACTCCCATGTGCGTATGAATTTATCTCTGTCGTTTTCG
CTCACTCTCTCTATACATATGTATGTTTGTTGCAGGAGCCAGAGCAGACA
CAAGAAGATGAGGAAAAGGAAGGGCCAGCACAGAAGAGGCCGCGCATGGA
GGTTGAAGCTGATGTGACTGAGGAAAGGAAATTAACCAGTTCCCCTTCCC
CAAGTCAAATTCGAAGTCCTTCCTCTTCAAGAATCGTCAAGTGTAATAGT
AGTGGACATCGTGTCGAAGGTGGTATTGATAGAGTGAAATCAAGTAGAAT
AGATACTGGCTCGTTTAGCAAAGTGCCTCCGGAGTTATTCCATCACATCC
TCAAGTTCCTCTCATCCGAGGTATGGTGCTCTCTTTTTTTCTTCCACTCC
TATATTATAGATGTGGATGTGATATAGGCCTCTCTTCCTTTTGGCTTGAG
GTTAACATATCTGTGGCAACAAAATTTCAGGATCTCGTTTCTTGCTCAAT
GGTCTGCAGATTTCTCAGCTTTGTTGCTTCTGATGAATCCCTCTGGCGTC
ACTTGTGAGTAGTTTACTTAATTTGTTTGGTTGATACAACACCCCAACTA
AGCAGTTATTACACCTTGCTTTACCATATAATACCGTACACACATATAGA
AATATCTTGCTCTCCCACTGTACAGCACCTCTCACTTGTCCTGTAGTTCT
AAAATGAGCACCTAAAGTTGAACAATTAATCATGTATCTGACAAGTATGT
TCAAGCATTTAATTTATCAATATTCAAGTTTCATATCCTTTTTTTTTACA
TTTGAATATCATATCCTCTGCACCAAGTAAAAACAATTATAAAGTCACTT
CTTTTTCCATAAAAATGATCACTAATTCCGCTACTGAATAAAAGAAAAAC
ATAATAAGATCTGTTAGAGCATATATAAACTTATTATGTTATAATAATAG
ACAATGAGGGTATTGAGGCTGCAGATTAGTTGATTTTTTGGTTTCACTTG
CAGCACATATAGCTTTCATGTTCTTCCCTTCCCCTCTCCTAATCCTCAAA
ATATAAAATGCTGCTTGATTAATAAATTTATTATGCATTGTCTAGGTACT
GCATGCGATGGGGTCTTCTACGACCAAAGAGTAATTATCGTGATTGTGCT
TGGAAGAAGCTTTACATTCAGGTAGTTTAAATTAGCTTCTATATGAGGTT
TTAAATTGAGCTTCTTTGGAAGTCATTTACTATATGCTGGGATGCCCATT
TTGTGATTCTTGATGACCTTGATATCTCAGTTGACCCTCAACGATCTACA
AAACAATTTTTAGTTGAAAATTAGTTTGAAATATGAACTTATGTCCTACA
GCGTGATGAAGAAGATATGGTTGAGTTTGTTAGAAATTGTCCATCTGAAT
TCAAAGAGTATTACATCCAAATGCAGACGGCAAAGAGAAGCCAAGCACCT
ATTCCTTCTCAGGTAACTGCTACTAGTTGTCAACATGATTATTATTTATT
AATTCACACAATATTGTGTTAATGTTAGTGTGTGTGTGTGTGATTATATT
TTGGCACAATGCATGTCTTGAGCTATATGTAATGTAGGCTTGGTTATGAT
TGCTGATTTTTTTTCTTTTTTTCCCTAATTTATAAGGATGACCGTATGAT
TGTGGACAAGACAGTTGCTGATCAAGTCTATACGTGGAAGAGCAGTAAAG
GTTTAATTGGTCAGGTGGCTACTGATCATGCGTGTTCCGGAAAGAGTTGC
TCTTACTATCAGATAGGTGATGTTTTTGTATGTGAGAAGACAGGAAATAT
TCATGGTATTATCTAAAGTTCCAAAACACATTTTTTTAAGAACTAAGAAC
TAAAACTCATTAAATATGTTCGTTCACATTGTTCAATGTTTTCTCATTTC
CAACATCTTTTTTGTAGTGTGTGATGATAATTGCAAAGATGCTTCTGTCG
ATCCCGCAAATGGGCTACTAGTTTGTACAATATCTGGTCACTGTTTTGAT
AGATTGATGTCACCTTCTGATGAAATGGATCAAGACGCTGTAAGAAAAGA
ATATCTTTTAATTTTCATATTGTTTTCATGGTCAGGCAATCTTACTTTTA
ACTCCTGATTGACTGTTGGACATATCGCTTCTAACTTCCCATGGTATAAC
TGAAATGAATAACTGATATATTTCTTCTTACTTGATTCTAGGATCAGCAA
CAAGATGGTATTACAGATGAAGCTGAGCCATTCATGGGATCCGGCCGTTT
CGGTATTACCTCCTTGGCTTTAATAAAATCTGTTAAGTTTCTTGGTTTTG
TAACAAATTATCATTAATTCTATTGCAGCACGAGCTTATTTGTTGGGATA
TAACTGTGCTGACGAGAAAGAGTTAGAAGCTTGTTTGAAGTTTTGCTGAT
GCGTCACGGGTTTTGACATTCTAGAGAAAACCAATGTTTTAACTTAATGT
TGTTTGTAAACTTCATGTTACATTGCTGAATGTCTGTCTAGTATTTCTGA
GTAATAAGCTTATCAAGTTATTGAATCGTTGCCTGAAAGGGTAACACACA
ATTCGTAATCAAATAATTATCATGTTGTA

Sequence Length

3779

Sequence MD5 Checksum

149c666578825c5ca84052fed8a36020

Relationship

The mRNA DCAR_004533 is a part of Gene DCAR_004533
The Genetic Marker MK008020 1_48986734 is located in Gene DCAR_004533
The Genetic Marker MK005958 K3402 is located in Gene DCAR_004533

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False