DCAR_004080

Cds

>DCAR_004080cds ATGGAGTTGAAGAAATGGAAGCTTTTGACTCTTTTGCTACCACTTGTTGC ATATCTTCTCCTCTTTGCCATCAAGAACTTCTCCAAGCCCTCTGTGAGAA GTTGCAGCCTCCTTCCTCATGACCACTACTGGATAGCTAGCAAGCGTATT GTAACGCCACAAGGGATCATTTCTGGCGCAGTTGAGGTGAATGGAGGCCT TATCAAATCGTTGATCAAAGAAGGGGATTGGCAAGGAAGGGTCCATACTG AGCAAGTCATTGATTATGGGGAGGCTGTTATAATGCCTGGTTTGGTTGAT GTACATGCTCACCTCGATGATCCTGGAAGAACAGAGTGGGAAGGGTTTCC TTCAGGGACTAGAGCAGCTGCTGCTGGTGGGATAACAACATTAATAGATA TGCCTCTCAACAGTTTCCCGTCTACAGTTTCCGAAGAAACTTTAAAGCTT AAGATTGAGGCTGCAGAGGGAAATATCTTTGTAGATGTTGGTTTCTGGGG CGGTCTAGTTCCTGAAAATGCTTTCAATGCAAGTGCTCTTGAGGGTCTCC TGAATGCTGGTGTTCTTGGATTGAAGTCTTTCATGTGTCCTTCAGGAATC AACGACTTCCCAATGACCAATTCCACCCACATTAAGGAGGGACTATCAGT ACTTGCAAAGTACAGAAGACCTTTACTTGTACATGCAGAGATTGAGCAAG AATCTGAGGAATTGAAAAATGAGGTTGATGATCCTCGATCATATTCTACA TATCTTAAGACCAGGCCTGCCTCATGGGAACAGGCAGCTATCAGGGAACT CTTGACAGTGACAAAAGATACGAGGGCTGGTGGCCCTTCAGAAGGAGCTC ATCTTCACATTGTACATCTATCTGATTCAGGAGATTCCTTAGATCTTATC AAGGAAGCAAAACGTAGTGGTGATAGTTTAACTGTTGAAACTTGCCCTCA TTACTTGGCATTTTCATCCGAAGAGATTCCTGATGGGGATACACGATTCA AATGTTCTCCACCTATTCGCGGTGCAGCAAATAAAGAAAAACTTTGGGAG GCCTTGATGGATGGATATATTGACATGTTAAGCTCTGATCATTCACCTTC TGTACCAGAACTCAAACTCTTTGATAGAGGGGATTTTCTAAGAGCTTGGG GTGGCATATCATCTTTGCAGTTTGTTCTTCCAGTAACATGGTCAATTGGG CGTAAACATGGAATAACTTTGGAACAAATAGCATTGTGGTGGAGTGCTAA GCCCTCGAAACTTGCTGGCCAGGATTTGAAGGGTGCCATTGCAATAGGGA ACCATGCAGATATTGTTGTGTGGCAGCCGGAAATGGAATTTGAACTCAAT GATGATCATCCTATATACCTTAAGCATCCTAGTATCTCGGCCTACATGGG ATCTAAACTCTTCGGAAAAGTGTTGGGAACTTTTGTGAGAGGAAACCTTG TCTTTGCAGAGGGAAAGCATGCTCCTGCTGCCTGTGGTTCTCCAATCCTA GCCAGATAA

Locus_tag

DCAR_004080

Name

DCAR_004080

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_004080pep MELKKWKLLTLLLPLVAYLLLFAIKNFSKPSVRSCSLLPHDHYWIASKRI VTPQGIISGAVEVNGGLIKSLIKEGDWQGRVHTEQVIDYGEAVIMPGLVD VHAHLDDPGRTEWEGFPSGTRAAAAGGITTLIDMPLNSFPSTVSEETLKL KIEAAEGNIFVDVGFWGGLVPENAFNASALEGLLNAGVLGLKSFMCPSGI NDFPMTNSTHIKEGLSVLAKYRRPLLVHAEIEQESEELKNEVDDPRSYST YLKTRPASWEQAAIRELLTVTKDTRAGGPSEGAHLHIVHLSDSGDSLDLI KEAKRSGDSLTVETCPHYLAFSSEEIPDGDTRFKCSPPIRGAANKEKLWE ALMDGYIDMLSSDHSPSVPELKLFDRGDFLRAWGGISSLQFVLPVTWSIG RKHGITLEQIALWWSAKPSKLAGQDLKGAIAIGNHADIVVWQPEMEFELN DDHPIYLKHPSISAYMGSKLFGKVLGTFVRGNLVFAEGKHAPAACGSPIL AR*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr1:44523264..44531755-

Type

gene

Unique Name

DCAR_004080.gene

Sequence Residues

ATTTATTTTTTTTTCGGTTTTTTAAGAAGGAATGATATGATATAATAATA
TGATCGGACCGTGCATCAATGACACGATTCCATGTGTAGTGGGATAGTGT
GATGTAAGATACCATGTTGATTCATTTATTATTGCTGAACCGGGATGGCT
GCATCCCAAACCGCTTTCCATTGCCTTTCTCGTTGGTTTCCATATACATT
GGACTGCCATCCCATTGGCTCTTCTTTTTTCTATGGCCCGCAATTATATA
TACAATAATCTTGCACAATCAAGGTCTCTCTGTGTATATATTGCTACTAC
TGTATTTTCACAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGGGGAGAGAGTG
TAGCAACAGGTAAAGATGGAGTTGAAGAAATGGAAGCTTTTGACTCTTTT
GCTACCACTTGTTGCATATCTTCTCCTCTTTGCCATCAAGAACTTCTCCA
AGGTTTTATTTTTATTGATTTTTCTGTTTTTTTCCTGCTACTTTTTCTAA
TTTTTGTTGATTGATGTACTAATTCATGTTTTTTAATCTGGCCCATTAAT
TTTTCTTGATCAATTTTGCAAGTGAATGTCCCAAATAGGACTAATGTGAT
TTTAGTCTCTCGACATTAACATTTGTTATGTTCTTCATGATTAATCTGTT
GGTATTTGTTTATACAATTGAGTGCATGACTATTCATCAAAAAACTAATG
ACCAAGCCAAATTATGTCACTAGTTTTAGCTGATTAATAGTGGCAAAATC
AGCCAAAATGCATACTTGGGTTGTTGTACATGATATTTCAAGTACATGTA
CATTTACATTTCGGAGTGTTGAGTCTGTTGTTGAGATGCAAATGCAATGT
ATATCTTTGCACTTTGTTGTCGAACAAGGAACAACATATTGTTTTACAGT
TTGTTAGATTGTGCTGGAATAGTGAAGGTGCTGTTCTTGAGGTTTGTTTT
TTGGTGGCAATGGCTGTTTTTGATCAAGTTGTGCATTGGTTATCTCATTT
GACGATTAAGGGACTTCAAATTTATACTTTAAGTTAACGGCCCAAGACCA
AGTAGACAGTAGATAAATTCAACTTGCTTGCTACTTTAAACACTAATTGC
GTATAATATGTTAATGTTTAATTAGAATACCCTGCAAACTGTTTGTGTCA
GCTTGGTGGATTATTTATTGGCCGAGTAGGCCTGACCATCCTTCCATGGT
AGCAGTGTCGCTTAGCACTTGTAGTTTCTTTTCCTCTCAGTATAAACTAT
GCTAAAGATATTAACTTATTATCCAGCAGCCCTCTGTGAGAAGTTGCAGC
CTCCTTCCTCATGACCACTACTGGATAGCTAGCAAGCGTATTGTAACGCC
ACAAGGGATCATTTCTGGCGCAGGTTAGTTTTGATGTTCTCCTTCTCGTT
TGTTGTTATTCTACAAGTTAACATATACACAAACATTGAGAAATCATGCC
TCGTCAAACTTGTCTACCTTGCAGTATACCAGCCAATATCGAAAGAGACT
TTTTATGTTCTTGTTTCGTCAAAGAAAATAGTTTGGATCAGATAAATTTT
GTTATTATATATGTTGATCAACTGATTGTTCTGACTAGATGCTTAAATGA
GCAGTTGAGGTGAATGGAGGCCTTATCAAATCGTTGATCAAAGAAGGGGA
TTGGCAAGGAAGGGTCCATACTGAGCAAGTCATTGATTATGGGGAGGCTG
TTATAATGCCTGGTTTGGTTGATGTGTAAGGAAATCTTAGTATTAGTACC
TTTTTTTAATCTATGCTTTTATATCGTAAAGAGTTCATGGTAACTAAAAA
ATTGTTATCTTTACAAAATTAAGAATGACACAAGTCACGTACAATAGCGG
AAAATGGCAATGTTCTTACAATCCTGTAACAGTTCTCAAGTTTTAACTAT
ATGGAAAATAGAGTAATAATCCAAATAGTAGGGCTTCTGGGACCTGGGTG
CAAGATTTTAACAAAATTAATGTTTCTAGAGTAACCTAGAATTACCTTTA
CTACTAGGATGAATATTGATCTAAATGATCAAAAATCATCTAGAAGTTCT
CTTTCTGATCAAATAACTAAAATACAATTATACACACATAGATTCTATTC
TAGTCTGCAAATAATTTTGGTACCCTTCAAATTAAGTATGCACTTCTCTC
ATGCCTTGACAATATACTTTTTGTCTCAACTAATGGCATTTCCTATGGAT
GAATCATACAATAGGTTCTCATTTGTGTTAGCAAATATATATCTACACAC
ACACATATATGCGGCCCCACCCAAAGAAAATTGATAGATGCTACGTTCAT
GGCAGACATGCTCACCTCGATGATCCTGGAAGAACAGAGTGGGAAGGGTT
TCCTTCAGGGACTAGAGCAGCTGCTGCTGGTATGTAAACCTGTGTTAAAG
ACAACAACTTTTTTAAAGGAGGTTTAAAAGATAGGATAAATTAAAAAGTC
CTAATTGGAATGTAAAAGCAGAAAGAAGTAGCAACTGATAACATCTATGT
AGAACCTTTTAGAAGGAAAATCATAGGAAAGATTTTATATAAAATTGTTA
TAAGGTTATTGCAACCGCATTGTACTATGTCTCATGTCTTCTTGTGTACT
CCTTTTGTTTAATACTCATAAGTGTGTATCTTCTTGTACTATGTCCAGTG
TCATAAATTATCACTCACTGGCTACTGTATCATCTTTTGCATACCTTTTA
TTTAATAATAAGTTGTATCTTCCTCTCCTTTATCACTTTGATACAAAATT
TGTGGCTGCCACTTGTAGACAGTCAAGAAATTTCACCAAAACACAATTGC
TACTTCAACAGGCAGAAAATATTAATCACACCTCTGTACATGCAGGTGGG
ATAACAACATTAATAGATATGCCTCTCAACAGTTTCCCGTCTACAGTTTC
CGAAGAAACTTTAAAGCTTAAGGTATGGATCAATTGTATTTCACCTCTTG
GATTTTTATTTTTCAGAAGTATAAAGTGCGAGTAATAATGACATTACAAA
ACCATATTTGGATATTTTCATCTAGTAGTGGGAAACAAAAGAAATAATAA
CTTAGTCTAAGACCTGGTTCTATTCTCATATTTCTATAGGATTTAGCCTA
CAATCTCATCCCACCAAAAAAATGTATTTATTTCTTTCATTTTACTGCTC
GCTATTTCATCAATTAAGTACTGCTGAATTAAGATCTGTCATATGTTTGC
TTGACAGATTGAGGCTGCAGAGGGAAATATCTTTGTAGATGTTGGTATGC
CCTTAAATTTTACTAGATCAGGCTTTAGGCAAGCAAATAGTAATTGTACT
CAATATTTCTGTGGACAGGTTTCTGGGGCGGTCTAGTTCCTGAAAATGCT
TTCAATGCAAGTGCTCTTGAGGGTCTCCTGAATGCTGGTGTTCTTGGATT
GAAGGTGTGTAATTGAGGCTTGAATTTGACTGATTTAGTGATGTAGGTGT
ACTCAGTCTTAATTACTGTAGATTATAAAAACGATAGTAATTTTGTTGGC
TGTTATGAACAAGTATAACACTTTATGTTCTTTTTGTAGTCTTTCATGTG
TCCTTCAGGAATCAACGACTTCCCAATGACCAATTCCACCCACATTAAGG
TACTAAGAGTTGTGAACTGCAATTTCTTGGAAAGTCAGGTTACAAGTCAG
CTTGGTATAACATCTTTTGAGTTTGCATCAATTTTTACATGTATGCTCTC
TTTAACCTGATGCCATTGTTCTAAAATATATGCTGAAATGCATGTGCCTG
TCCTTATATTGAATTCTTAAACTTGTCTTAAATTCCTTGTATGGTCTGCT
TTTTAGTATGACAATGATCTTGTGTCTATAAACTTATAGGCCATGAATGT
GAAATTGGTTTATTTATTTTTCTTTTAGGAGGGACTATCAGTACTTGCAA
AGTACAGAAGACCTTTACTTGTACATGCAGAGATTGAGCAAGAATCTGAG
GAATTGAAAAATGAGGTTGATGATCCTCGATCATATTCTACATATCTTAA
GACCAGGCCTGCCTCATGGTAAATTTAAATTCTTTTTTTCTTTCAAAGGG
AAGTTGGATTTGATAACTAGACATTAATAATAACAAGATTCATCACCTTG
GAGATAAAAGAACTCCTAACTGTCTGCAACTATTTCTGATTAAATATTGT
TTATGTGTGTTGCAAGAGCTGCCTCTTGTGTATGTCATTAGTTTTGATGC
TTGAGATGCTCTATATCCGTTCCTAACTACATCAGTTGATACGTGTGAAA
ACATGATCACTATAATTGGGACTGGCCGCTCTTTCATATCGATATCACAT
CTTTTGGCACTGTAATGCTAGACTGTAGAAATAGTTCCTTTGTTCCTCTA
ATCCTACCCATTCTATAGTGCTATTTAATCATTAACTATAAGATAGGAAT
AAAAAGAGTTTAAATGCAGATATTCTAGTATTTTAACTCATAAATCTCGT
TATTCAGGGAACAGGCAGCTATCAGGGAACTCTTGACAGTGACAAAAGAT
ACGAGGGCTGGTGGCCCTTCAGAAGGAGCTCATCTTCACATTGTACATCT
ATCTGATTCAGGAGATTCCTTAGATCTTATCAAGGTAAGGTTCTCTGCAT
TTTGTCTGTGTTCAAACTGCAAGCATATGGTGCCATAGACAGAAAATGGA
TTTGTAGTTTTAAATTCGTTAGTGAAGGCTATAACTGTATATACGTAGAA
ATATCGTATATATGTAGTTATCAAGTGCATCACTGTAGAGGCCCACACAA
GTAGAATGAAGGGAGAACATTCTAAGAGTGAGGATTCAGCAATATCAATA
AATAAGCTTGATTGCAGTGGGGTCACAAACTGTGTCAATCAGGGAATATT
GAATTATATAGTGTTGTCAGAAGGTTCAATATCTATAATACCTAGGAAGC
TTATACTATCTTTACATGATGCCTTAAATCTTAATTGTGTTCGAATTGAA
TATTCTTTGTTGGTATCTATATCTATTGTAGGAAGCAAAACGTAGTGGTG
ATAGTTTAACTGTTGAAACTTGCCCTCATTACTTGGCATTTTCATCCGAA
GAGATTCCTGATGGGGATACACGATTCAAATGTTCTCCACCTATTCGCGG
TGCAGCAAATAAAGAAAAACTTTGGGAGGCCTTGATGGTATCTTGCTATT
AAACATCCACCTAGCATTTGCAAACTATTCTCTTCATACTATGTGTACAT
ACTTATTCACAAATAAATTTCAGGATGGATATATTGACATGTTAAGCTCT
GATCATTCACCTTCTGTACCAGAACTCAAACTCTTTGATAGAGGGGATTT
TCTAAGAGCTTGGGGTGGCATATCATCTTTGCAGGTTGGTTTTACCAGTT
ATTAGGAAATAATAGTGCCGCGCTACTTAAGAAAAATGGTTAATGTGGCC
ATTACAAATATTTCAATCGTAAATATTTATACTAGTTATACTACTTAAGA
AAGATGTGATTCCTCATGGTTACATTAGTTTTTTTATTCATAATAGTTGA
CCATATTGGTATGGAATTAAAGAGTTTTAATTAGTATACGGTTTCTCTAC
CAGGACAGTCAAAACTAAGCAGCTACTCCCTCCGTGCCCAAGTAGTTGTC
CAGTTTTGACTTTGAACTGTCAAATTGACCAAAATTTGATGAATATTTAG
AAGTATTTTTTGTTATATTTAAAAACTAAAAATTATATTTTAAAATAGAT
TAAAGATACTTTACGATGATATATTTTTATTTTTATTAAATTATATAATA
TATATTAATTTCAGGCAAATTTGGTTAATTGGACCATTCAAAAGTCAAAG
AGGACAACTAATTAGGGACAAAGGGAGTATTATACAAGTTCATTGTAGAT
CATAAACAACCATGCTCAACATCTCTTGCCGTCTTCGTGTTATTTCTTAA
TCCATATTAGTGGATGATTAATATCTGAATAAAATGGCATCTTTATGCCT
TCCTAGCTACTTTGTTTCTCTGATCAGTTAGAGATGTTAATTTGTATTTT
ATTCTATTTTCGAGACTCCTGCAGTTTGTTCTTCCAGTAACATGGTCAAT
TGGGCGTAAACATGGAATAACTTTGGAACAAATAGCATTGTGGTGGAGTG
CTAAGCCCTCGAAACTTGCTGGCCAGGATTTGAAGGTTGCGTATGGCAGT
CACTTTTACATGTTGTAGAATTCACCTGTTCTTATCAAGCTAACTAAGAA
AAACCCAAAGCTCTTTTGTTAAAAGATACCTTATGTAAATATTTTTGCAT
GTGTGGGCATGCAAACCCAAGTACTAAAACATTTTTCTTTAGGAGGTGGA
AAAAATACGATATTTAACATATTGGTCGCTGATAGCAATTTGATCAACAC
ATGCAGGGTGCCATTGCAATAGGGAACCATGCAGATATTGTTGTGTGGCA
GCCGGAAATGGAATTTGAACTCAATGATGATCATCCTATATACCTTAAGC
ATCCTGTAAGTGTAAATCTGTGTAATTTAATGATTATAGAGTTATTGCAT
CACTCGATTTTTTCTAAATAAAATGCTTCTGAAATCTTAAATTTCTTTTA
CATAAATTAGATCAGGAAGAAACTATATATGTTATATTCACTCGCAGCTT
GAATTTCCTTTGAAAATTTATCATGCGGAACTTTTGTATTTCTTAAATAC
AAGTTTTTGTTTTAAAGTTCAGAATGCCTTTTGATTTCTTTCTATTGTAT
GTCAATTTTGGTATTACATGATCTACAGAGTATCTCGGCCTACATGGGAT
CTAAACTCTTCGGAAAAGTGTTGGGAACTTTTGTGAGAGGAAACCTTGTC
TTTGCAGAGGGAAAGCATGCTCCTGCTGCCTGTGGTTCTCCAATCCTAGC
CAGATAACAAGTACGCCATATTGCTGGTAATTTTCTGGATATACCCGGTA
TGCTTTCTCAGAATCGGACTTTTAAGTACACAAGGTTTCTAGTAAAGAAT
TATCAGTATCATCCTTCAACATCAGAAGGAATCTGGGGTAAATGAAACTG
CAGTCTGGTGCATTACCAAAGTACCATTAGAATTAGCTGTATACTGGATA
CCATAGTTTTATGATCGTAAACAGTGACATCCTTCAACTTGTTTTTATTG
AACATTTATGTAATTCTACTTGAACATGAAAATATTTAATCAGACAATTA
CTCTTCACTCTTTCTACTCCTGCATATTGATTAATAGCTACCAGTGCCAT
TATTCTGTTGTATGCTTTGAACATGTGAACTGATTTTACAAGTTGTAGTT
AGCTATACAATTCCAGCAGCACCAGTAAAAATTCCAACTTTCTACATAAT
AAGTACTCTTTATTGACTTAACAGTATCAGGAAATTAGGATTGAACAACA
ATTGTCCCTTGTTTGAACATTAGGGTGTGTTTATGGCCTCTCTAACTGTC
ATTGGTGCCGGGGCAATTGCTGTATTAGTTTTAGTTTCAGATGCAGCCTT
GTTAGAATTATCTTTCAATGCAGCATAGCCACCCCAACCGCCGCCACCAT
AGCCGCCCCAGCCGCCACCACCATAGCCGCCCCAACCGCCCCAACTGCCA
CCACCATAGCCACCCCAACCACCACCACCATAGCCTCCTCCACCCCCACC
ACCGCCGCCTCCACCACCAAAACCACCACCGCCGCCTCCACCACCGCCAC
CCCCGCCCCAATAGCCGCCTCCTCCACCACCGCCGCCGCCACCCCCACCA
CCGTAGCCACCATATCCCCAATTGTAACCACGACGCCAGCCCCAACTACA
TAATACACTGCCACACTTCTCATCAGCAAAAGCACCATCAGTATTATCTA
TCTTCGCATTCTTTAAACCAGTCATAAGTTCATCCCAGTCCTTATCAGTT
GGAAACCTAAGGGACTTGTACTTGTCATCCCCTTCTCCATCAACAGCTTT
TTTCGCCCCAGCATCCTCGCCAGCCATCAATGCTTGATCCTTCTCAAACA
GCCAGTCGTGATCATTAGGTAAATCTTGAATATGCTCTGTGTTAGCCATC
GTCGTGGCTACAGAAGAATGATCATCCCTACGTCCAGCAGCTTGTGATGG
ATTAACAGCTAGTTTACGTTTAAAACCATCTATAGGAACATGGTCATCAG
ATTTAGAGTAAGCTTTCGCAGAATGATCATCACTGTAGAGTGAGAACATA
CGTGCAGAAGCTAGGCCGACGAGAGAAACTAGCAACAGCACGGGCAAGCA
AGCCCATTTGCTCGATGCAGCCATGCGATATAACACCTGATCTAAGACTA
TAGAATACAGTGTCCCTGATCCCAGAGGTGTTTTATAACCCAAGTTTTGC
TTGCCAAGGAATGAAGTTTGAGAACTATACGTAAATTATATGTCAAAAAT
GCAATACCATATCTATGAACAATGCATAATCTGTTATACATAGGCAGCAC
CATATGAAATCTGTGTTCAAGTAAACCTTACGTGCTAATAATTTGATGTA
ACTGCCATAGTGTGTCTCTGATTAATTTTCAGTAGAGCCGG

Sequence Length

8491

Sequence MD5 Checksum

14e1376bffaa2b2717e90eb2eaa73a14

Relationship

The mRNA DCAR_004080 is a part of Gene DCAR_004080
The Genetic Marker MK002840 K0284 is located in Gene DCAR_004080

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False