DCAR_003288

Cds

>DCAR_003288cds ATGTCTGCATCGACAGTTTCAATTACCGCAAATCCCACCACCTCGCGACG TCGTCCGATCGTCACTACCGACATGAAATCCGGCTTAGATTTGCTCGGCA CCGACGCTTCTCCGATCTCCGGCGGCGTGGAAACGGGCCCCACTCGAGAC TCGAGCCAGTCAATTGAACGATCAAGAAGAGAAGCAGTAGTTCAAGTGAA GAAATCAATTGCCCCCAATTCGGGTACTACTTCGAAACCTTATAGGAGTC ATCGTAAATCGATATCGAAACCCAAATGGCAAACTGTGGTCAGTGTGTTT ACTAAGAATTTGGTGCTTTTGCTTTTGCTTGCGGGGTTAGTTCAGATGGT TAGGAAGGTTTATTTGAATAGTGTGGTTGATGATGTGGGGTTTGTGAGTG GGGGGTTTTCGGATAATGTCGATGGGAAGATTTCGGAAATTCAGGTTTTT GTGAGTAAGAGTTTGAGGGGTATGCAGTTGCAAGTTGAGGTTTTGGATAG GAAGGTTAAGGAGGTTGAGGACAAGAATGTTGAGCTAGGAGGTGAATTAG GGAAGTTGGGGGGGAAAGTCGATGTGGTGAGCGATAGGATGGGGAGTTTG GAGAGGTATTTGAATGGGAATGAGTGGTTGTCGAAAGGGGAGTTTGATAG GTTGTTGGAGGAGTTTGAGGGGAGAGCTGGGAGTGATGGCAAAGGGGGTT TGGATGAGGTTATGGCGGTTGCAAGAGAAATGGTTGGGAAGGAGATTGAG AAACATGCTGCTGATGGGCTTGGGAGGGTGGATTATGCACTGGCATCTGG TGGGGCATATGTCGTGAAGCATTCTGAGGTGTATGGTGGGATTAAAGGTG GGTTTCCATTTCCAGGGATTAGTGGTAGAGCTGGGGTTCATGCTAATTCG GGGAAGATGTTGAGACCTAGTTTTGGCGAGCCAGGTGATTGTTTTGCTTT GAAAGGGAGTAGTGGTTTTGTGCAGATTAAGCTCAGGACAGCTATTGTTC CCGAGGCAATTACGTTAGAACATGTTGCCAAGAGTGTTGCTTACGATAGG TCCAGTGCTCCCAAGGACTGTAGAGTGTCTGGATGGTTCAAAGGACAAGA AACTACTGATCTAACACGTAATGCTGAGAAAATGTTTTCCCTGGCCGAAT TTACCTATGACCTTGAGAAGAGCAATGCTCAGACTTTTGGTATATCAGAC TCCTCAGGCGTTGGCGTGATTGACATGATAAGGCTCGACTTCACATCAAA CCATGGAAGTGCTTCACATACATGCATATATCGTTTTAGGGTGCATGGCC ATGAACCTGATTCCATTGTCCCTCTAGCAATTCAGTCTTGA

Locus_tag

DCAR_003288

Name

DCAR_003288

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_003288pep MSASTVSITANPTTSRRRPIVTTDMKSGLDLLGTDASPISGGVETGPTRD SSQSIERSRREAVVQVKKSIAPNSGTTSKPYRSHRKSISKPKWQTVVSVF TKNLVLLLLLAGLVQMVRKVYLNSVVDDVGFVSGGFSDNVDGKISEIQVF VSKSLRGMQLQVEVLDRKVKEVEDKNVELGGELGKLGGKVDVVSDRMGSL ERYLNGNEWLSKGEFDRLLEEFEGRAGSDGKGGLDEVMAVAREMVGKEIE KHAADGLGRVDYALASGGAYVVKHSEVYGGIKGGFPFPGISGRAGVHANS GKMLRPSFGEPGDCFALKGSSGFVQIKLRTAIVPEAITLEHVAKSVAYDR SSAPKDCRVSGWFKGQETTDLTRNAEKMFSLAEFTYDLEKSNAQTFGISD SSGVGVIDMIRLDFTSNHGSASHTCIYRFRVHGHEPDSIVPLAIQS*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr1:37783504..37787039-

Type

gene

Unique Name

DCAR_003288.gene

Sequence Residues

TTTTTAAATCCTTGACCCGAATTGAGGGTAAGCCCGAATGCGGCAGGGTA
GAGTCGGATCGGGTCCAAATTGCAAAATTTCGCTTAACATTCCATTTCCA
CATTCAAATTAACAGAAATCTCCATTAAACTCTCACTCACTTTCCCCAAA
TCTTGTACATACAAACAGACACACACACATATATATAGCTTATTAATCCG
ATGTCTGCATCGACAGTTTCAATTACCGCAAATCCCACCACCTCGCGACG
TCGTCCGATCGTCACTACCGACATGAAATCCGGCTTAGATTTGCTCGGCA
CCGACGCTTCTCCGATCTCCGGCGGCGTGGAAACGGGCCCCACTCGAGAC
TCGAGCCAGTCAATTGAACGATCAAGAAGAGAAGCAGTAGTTCAAGTGAA
GAAATCAATTGCCCCCAATTCGGGTACTACTTCGAAACCTTATAGGAGTC
ATCGTAAATCGATATCGAAACCCAAATGGCAAACTGTGGTCAGTGTGTTT
ACTAAGAATTTGGTGCTTTTGCTTTTGCTTGCGGGGTTAGTTCAGATGGT
TAGGAAGGTTTATTTGAATAGTGTGGTTGATGATGTGGGGTTTGTGAGTG
GGGGGTTTTCGGATAATGTCGATGGGAAGATTTCGGAAATTCAGGTTTTT
GTGAGTAAGAGTTTGAGGGGTATGCAGTTGCAAGTTGAGGTTTTGGATAG
GAAGGTTAAGGAGGTTGAGGACAAGAATGTTGAGCTAGGAGGTGAATTAG
GGAAGTTGGGGGGGAAAGTCGATGTGGTGAGCGATAGGATGGGGAGTTTG
GAGAGGTATTTGAATGGGAATGAGTGGTTGTCGAAAGGGGAGTTTGATAG
GTTGTTGGAGGAGTTTGAGGGGAGAGCTGGGAGTGATGGCAAAGGGGGTT
TGGATGAGGTTATGGCGGTTGCAAGAGAAATGGTTGGGAAGGAGATTGAG
AAACATGCTGCTGATGGGCTTGGGAGGGTGGATTATGCACTGGCATCTGG
TGGGGCATATGTCGTGAAGCATTCTGAGGTGTATGGTGGGATTAAAGGTG
GGTTTCCATTTCCAGGGATTAGTGGTAGAGCTGGGGTTCATGCTAATTCG
GGGAAGATGTTGAGACCTAGTTTTGGCGAGCCAGGTGATTGTTTTGCTTT
GAAAGGGAGTAGTGGTTTTGTGCAGATTAAGCTCAGGACAGCTATTGTTC
CCGAGGCAATTACGTTAGAACATGTTGCCAAGGTAAGTTTTACTCTGTAT
CTCTATTACTTTCTTGCTATATGTATGTGCACTGTGTTTGGTTTTTTGTG
GCTACTTGTGATTCTGTAACATAGCATCATACTGACTGTACTTGGTTGAA
GACTTCTGTCGTTCCAGTATATATAGTAGGAAGTCCATATATGACAGCAT
CTTGAAGTTTGGTTTCTCTTACTAAGTGATTATATTTGAAGTTTAATGAT
ACCTCTACTGTATTAAGAGAACATAAACTTTTGGTCTGCTGTTTGAAGTA
ATCTGATTATACTTGAAATGAAAAATCATCTGATTGGGTTGTTGATGACT
TTTTAAAACAGTAGGTCTTATATTTGCCAAATCACCTGCAACATCATTTC
TAACAGTTTTTTGTGATTAATATTAAACACTCAATTAACTGATTCATTGA
TGGCTTTGCTCATCTGCATTTGGTTCAATTCTTTGCAGTCATCCGTTGAT
TAGTTGTACAAGTTATCAATCTTTAGTGAATTAAGCCCCTAGTATTTTCT
GATAATAAACATAATGAGTAATATATATACATACTGGACAGTGGACAATT
TTAATGGCTAACCTTGTGAGTGTATCCAACCCCCCTGCTATGGAAATACA
TGCATGGAACATCTATATGTGTGCAGACCTTTGGAGACGTGGAGTTCTTA
TATGTTGCTCACATTGCTGTAGGCTGCATATAACAAAATATGAAACTACT
CGATCTATCTTCTCATCAGTGGCTGATTTCCTTAAAGTCTGAGTGTGGTA
TCTGGCATCGGACATATCATGCTGCAGTTTGCTTATGTGATTACTCAATT
TTCATTTGCTGCCAGTGAATGCCTTACACTGTGCTCTCGAATCTTGGATA
AGATAAATTGAAAATGAGAAATTTTTTTCTCCAAATCTTTTTGAAAGCGG
GAGGATTTGGGAGACAAATATACAAATTACTCTTTTCCTATTCTTCAGCT
TTCTTGTCCTTCTCTTCCAAAAAACTAATTGAGAAACAAGCAGTGGAAAT
AAATTCTTTAACTTTCATTTCTTTCCAAAAAGGTTTGTCGAACAGCTGGC
CAAGTGAAGAGGGGATACTGCTTGTACTAAGTATGGTCTGTACGAGTTCG
GTTCTTTGTACAACAAATTCACCCTTATGGTCTAAGTCCCTTCATTTAAT
GTTTGGAGATTTTTTGTTTTTAGATCCTGCAGTCTCCGATATACTACTCA
CTTTTAGTTACCTAAAGCGAGAGGAGAGAGTTACACTATTAACATTCTTC
TGTGCATATTCTCATTCCTCACAGTATGATATTGAGGACAAGTGGCTGCT
CTCAGTCTATTGTTTACCATAGGAACTCGTGCCATATAAATTAGGACATC
AGTTTGATGAGCTCATTGGGCAAGACTCAGTCATTTGTTTTAACTCTTCA
GAAAATTTTGAAAGCATTGTAATTGAAGCCTGTGTTATTACTTATTACTG
ACTGCTGCATCTTAGTTGTAGTGGAGAATTTTTATATGATTATCCAATAA
ATCAGACCTATTATTGCAGTCATAGACTCATATCTATATATGTGTGTTTA
CACATATAGTTAATAACCCTTGGATTGAGAAATATTGGCAGAGATTTCTG
TCATCTTTTGACAGGTTCCATATACTAAATTACTAATTAGTTCTTTTGGA
ATGCTGTCCCCTTGAACGTTTGAGGTGTTTAATCAAAAAGAATGACATAT
CGTCAATCCATGACTTTAGCATCAGTTGTGATATTATATAGAGTTAGAGC
ACACATGATGTTGCTGCAATAATGTTGCTGCAATAATGTGTAAAGGATTT
TTATTTTCTCCTGTTACAGACTGCTATACATGTCTTCTAACCAATATACA
TTTGGTCATTTATTGAACAGAGTGTTGCTTACGATAGGTCCAGTGCTCCC
AAGGACTGTAGAGTGTCTGGATGGTTCAAAGGACAAGAAACTACTGATCT
AACACGTAATGCTGAGAAAATGTTTTCCCTGGCCGAATTTACCTATGACC
TTGAGAAGAGCAATGCTCAGACTTTTGGTATATCAGACTCCTCAGGCGTT
GGCGTGATTGACATGATAAGGCTCGACTTCACATCAAACCATGGAAGTGC
TTCACATACATGCATATATCGTTTTAGGGTGCATGGCCATGAACCTGATT
CCATTGTCCCTCTAGCAATTCAGTCTTGAGGTTGATTTCCTCGTTTTAGA
CCCTTGCCTGTTCTCCCTATCTCTCTTCTTTTTTATCTTCTAGTTTCATC
TTGGGAGGCTTAACTGTTGAGACACCAAGCTTAAA

Sequence Length

3535

Sequence MD5 Checksum

a819d6a6f4d26e7cdf925cd0adcf7b4b

Relationship

The mRNA DCAR_003288 is a part of Gene DCAR_003288
The Genetic Marker MK002845 K0289 is located in Gene DCAR_003288

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False