DCAR_002531

Cds

>DCAR_002531cds ATGAAGAATTGGTCTGGAGGAGTGTTGATAGTAGGACTTGGTTTGATTTT ACTTCTTCGGTACAGCTTTGTAGGAAAACAGCCGCATAAGCAGTCAGCTT ATGATTTTTTTAATAGCCATTTGTCTAAAGATTCTACTGAGAGTGGAGAT AGTTCTAATACAGTGAAAACTGAAACTGTCCAAAATCCTGAGAAAAGGCC CCACTTTGTTGACGTCGAAGGACTTGATGACCTCTATGCTTTTAGGAATA TGTCTGAAGAAGAGTCAAAGGTTTTGCTTGTTTGGTCTCAGATGCGTATG CTTCTTTCAAGGTCAGATGCTTTACCTGAAACATTTCAAGGCATTAAAGA GGCTGCTGTGTCATGGAAAGAGTTATTGTCATTGATTGAGAAAGATAAAT CCTCCCAGTTGAATGATAACATCCAGAATGACAAGAAATGCCCTTACTAT GTTGGCATGCCGAGTGGTTTGAATACATCAACATCTGGTAGTGGATACAT TCTTGAAATTCCTTGTGGTTTAGTTGAGGATTCGTCGGTCACGTTAATAG GAATTCCCAATAGGGGACAGGGAAACTTTACAATCGAACTTGTAGCCTCA AAATTTCCGGAAGAACAAAATCCTCCAATAGTTTTGCATTTTAATGTATT TTTACCTGGAGAAAATTTGACAAAGGAGCCCATTATAGTTCAGAATACAT GGACCAATGAGACTGGTTGGGGGAAGGAAGAAAGGTGTCCTAATCATCAT TCCATTAACACCACGAACGTTGATGGACTGGCAAAATGTAACGAAGAAGT CGCCACAAGTGCTGAAGAAGAAATTGCTCATGCTAGTAATCTTAGTGTCA ACCAATCATCAAATGTTTCCAGTGGGAGTGCTCATGTCAGTGCCAATTTT CCATTTTCTGAAGGTAGCCCATTCACTGCCACCTTGTGGACTGGTGTGGA GGGATTCCACATGAGTGTGAATGGACGGCATGAAACATCTTTCGAGTATA GGGAGAAACTTGAACCATGGTTGATTAATGGAGTTAGACTATTGGGTGAC GTGGAACCTGTGTCTGCCATTGCTAAAGGTTTGCCTGTTTCTGAAGATTT GGATTTGATTGTAGATGTTGAGCACCTTAAAGCTCCAGTAACTGCCAAGA AAAGGCTTGTACTGTTAATTGGGGTATTCTCTTCTTGCAATAATTTTAAT CGGCGTATGGCATTAAGGAGATCCTGGATGCAGTACGATGCTGTACGTTC CGGGGAAGTGGCAGTTCGGTTTTTCACTGGCCTTCACAAGAATATTCAAG TCAACTTTCAGCTGTGGAAAGAATCTCAAGCTTATGGAGATATGCAGCTT ATGCCTTTTGTTGATTACTACAGTCTGATCAGTTTGAAAACGATTGCAAT ATGCACTATGGGGACCAAAATCCTCCCAGCTAAATATATAATGAAGACAG ACGATGACGCTTTTGTGAGGATAGATGAAGTTCTGTCTAGTCTCAAGCAA AAGGCTTCTGATGGCCTCTTATATGGTCTAATATCTTTTGAGTCAAAGCC CCAGAGAGACGCGGAAAACAAATGGTTTATTAGTACCGAGGAATGGCCAC ATGAGAGCTACCCGCCATGGGCTCATGGTCCAGGTTATATAATATCCAGA GATATTGCGAAATTTATTGTGCAAGCGCACCAAAAAAGAGAGCTCAAGCT TTTCAAATTAGAAGATGTATCCATGGGAATATGGATCGAAAAATTCAAAG AACGTGGTCACGAAGTGCAGTACATTAGTGATGAACGGTTTTATAATGCG GGATGCGAGCCTAATTACATCCTCGCGCACTACCAAAATCCGCGAATGGT CTTATGCCTGTGGGAGAAGCTGCAGAAAGAACATAAGCCCGACTGCTGTG AATGA

Locus_tag

DCAR_002531

Name

DCAR_002531

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_002531pep MKNWSGGVLIVGLGLILLLRYSFVGKQPHKQSAYDFFNSHLSKDSTESGD SSNTVKTETVQNPEKRPHFVDVEGLDDLYAFRNMSEEESKVLLVWSQMRM LLSRSDALPETFQGIKEAAVSWKELLSLIEKDKSSQLNDNIQNDKKCPYY VGMPSGLNTSTSGSGYILEIPCGLVEDSSVTLIGIPNRGQGNFTIELVAS KFPEEQNPPIVLHFNVFLPGENLTKEPIIVQNTWTNETGWGKEERCPNHH SINTTNVDGLAKCNEEVATSAEEEIAHASNLSVNQSSNVSSGSAHVSANF PFSEGSPFTATLWTGVEGFHMSVNGRHETSFEYREKLEPWLINGVRLLGD VEPVSAIAKGLPVSEDLDLIVDVEHLKAPVTAKKRLVLLIGVFSSCNNFN RRMALRRSWMQYDAVRSGEVAVRFFTGLHKNIQVNFQLWKESQAYGDMQL MPFVDYYSLISLKTIAICTMGTKILPAKYIMKTDDDAFVRIDEVLSSLKQ KASDGLLYGLISFESKPQRDAENKWFISTEEWPHESYPPWAHGPGYIISR DIAKFIVQAHQKRELKLFKLEDVSMGIWIEKFKERGHEVQYISDERFYNA GCEPNYILAHYQNPRMVLCLWEKLQKEHKPDCCE*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr1:30243137..30248800-

Type

gene

Unique Name

DCAR_002531.gene

Sequence Residues

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TTTTGTAGTAAAATTTTGTCTTTTTTTTTCTTCTTCGTTCTGTCAATAAA
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GAAATTGCTCATGCTAGTAATCTTAGTGTCAACCAATCATCAAATGTTTC
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AATGCAACTGGCTTAGGGGCGCAAGATATATTATACAGATAAGTTCCAAG
GTCGTCTAGACAGAAGTACTTGGCCCATCTTTCCATTCTACTCTGTTATG
GTATTCGGGTTAGGAGTACTTCTCATATATAAACTGTTTAACTGTTCAAA
GATATTTTTTAATTAGGCAACCTCTCACATTTATATGAACTACTTCGTTT
GCATTGATTTTAATTTTTCAAGTTATCATCTACTTTTACCAACAATATGC
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TGGAAAGAATCTCAAGCTTATGGAGATATGCAGCTTATGCCTTTTGTTGA
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ATTTACTCTCTAGTTCCAAACTTAATTATGAATATAACTAACACTGCATA
AGATCCACCAGCGACACAAAAGGATAGGTTGTATAGTTTGATATATACTT
TCTCGAATCTCGCCTTTTATTTTATTTTGGCGCTCGTAAGTCAGGGTAAT
TTTACGTATATGTTTATCATTGTTTTTGCTTTATCTGTAAATCAGGTATG
GACAACAAACTCTTACCTCTAGTTAAGTATGCTAGAACCTCACATCTGCA
TAAAATTGTATTCTTAGTTGTAATATAGGCTGATGAACTGCTAGCGGAAA
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AGGGAGGACAAATTAAAATGAATGTATATGATATGGCAAAATCTGAAAGG
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AGATCTACTGCCTGGAGCTATAACTAACTTGTGCAAGTAAATTAGGTATG
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TAAATTAGGTACAAGCATCCAGTTCCAACATATCAAAGAAACCAGATATG
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TTTCCCGAAATGATTTTAATGTAAAATGCACTGATATAGCTGTGTAGATG
TACATGCAATAAATAGCAAGGGCTGTGATGGCTTAAAGCTGTCCTGCATC
ATGCTGATTGAAAGTATTATTTTGGTTGATCTTGTATTTATGAAAGTGAT
TTAATCATCTTTTCTTTGAATGCTAACTATGTTTAAAATTTGTTGTCGTT
TTCATAATCACGACATGCTTATAATTGGTCCTTAGATCAGATGTTAAGTC
GTATATTTTCATCAATTAACCTCTTCTCAAGCACAGATTGAAGTGGCTAG
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GACCAAAATCCTCCCAGCTAAATATATAATGAAGACAGACGATGACGCTT
TTGTGAGGATAGATGAAGTTCTGTCTAGTCTCAAGCAAAAGGCTTCTGAT
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GGAAAACAAATGGTTTATTAGTACCGAGGTATTAGTCTTTGTCAAACTTA
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TTCTTTGGCAGGAATGGCCACATGAGAGCTACCCGCCATGGGCTCATGGT
CCAGGTTATATAATATCCAGAGATATTGCGAAATTTATTGTGCAAGCGCA
CCAAAAAAGAGAGCTCAAGGTAAGAAATTCATTCTCAGTCTGTACATTGC
CTAATGGTTTTCCCCTTGCTCAATGATAGATTTGCTTTGGTTTCTGGAAG
TATTTCCCTGTTATTTTATTATTAATTATAAGGCCTATAATTTTATTTGT
AGAGTTTGTTAAAAATGCTTAAAATATTTTCTCTTGCTCTAATAAAATTT
CCAGTGCAATCTAAGAACAATACTAAGAGATGAGGTAGTGTATTACAGAT
TTTGTACTTTGTGCATAATCAAGTAAATCTTATTGTCAAGTCATTCAGCT
TTCATGAGTTAAATATACTTCTCAATTTGAAATTTATTGCTCAATTGCTG
CATTTATAGCTTTTCAAATTAGAAGATGTATCCATGGGAATATGGATCGA
AAAATTCAAAGAACGTGGTCACGAAGTGCAGTACATTAGTGATGAACGGT
TTTATAATGCGGGATGCGAGCCTAATTACATCCTCGCGCACTACCAAAAT
CCGCGAATGGTCTTATGCCTGTGGGAGAAGCTGCAGAAAGAACATAAGCC
CGACTGCTGTGAATGACTTAAACGGACGTAATCGACAACAATGACACCTG
AGTTTAAGTTGTATGCAAATGTACTTTAACTTAGGCATTAGATGTGTACC
GTTTTGATTGTTTGTTGTACAACTCTGTCATATGATTCTGTTATAGTGAC
ATTTATATTATCTTTAAAAGTTATACTAACATCTATGAAAGCAGTCTCTT
TAGACTTCTTGTC

Sequence Length

5663

Sequence MD5 Checksum

d8431c7781ba8476860838b288aea6d5

Relationship

The mRNA DCAR_002531 is a part of Gene DCAR_002531
The Genetic Marker MK010697 1_30245569 is located in Gene DCAR_002531
The Genetic Marker MK005715 K3159 is located in Gene DCAR_002531

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False