DCAR_013778

Cds

>DCAR_013778cds ATGGCAGTCTCAACCTCATTCCGAGTATTTTCCACAAGGTTCCCACAACC TATTCTCCACCCAACTAAAACCCCTGTTTTTCAAACCCTATTTCTCAGTA CAATTCCTCCACAAACCCCCACAAAAATCTCATTTTTCAGGTCAATTTCA ATCCAAAAAGTGCCCACAACTCCTCACGCATCATCATCTTCAACCCCTTC AGCTTCAGTTAATCTCCAGCCCATTTCTGATCTTCCCCCAAAGCTTCAAG AAATTGTCAAGCTTTTTCAATCAGTTCAAGAACCCAAGGCTAAATATGAG CAGTTGTTGTTTTATGGTCGGAATTTGAAACCCCTTGATGCAAGATTCAA GATTTCTGATAATAAAGTTCAGGGTTGTGTTTCCCAGGTCTGGGTCAGGG CTTATTTTGATGACGATAAAAATGTGGTCTTTGAAGCTGATTCTGATTCT GTGCTGACCAAGGGCTTAGCGGCATTGCTTGTTCAGGGTCTTTCGGGGGA GCCTGTTGAGGAGATTGTCCGGGTTTCACCTGATTTTGCTGTGCTTCTTG GGTTGCAACAGAGTTTGACTCCTTCTAGGAATAATGGGTTTTTGAATATG TTGAAGTTGATGCAAAAGAAGGCTTTAAATTTATTCATTGAAGCTGAGAA AAGTGGGAGTAATGAGATGGTGGTGGAAAGTTTGAGTTTGGGTTCGAGTA CTGATAAGGACGGTGATTTGTTTGTGGGAGATGGTGTGGAAGTCGATGGT GGTGATTCGGGCTCGAGTTCTGATAATGTGATTGCTTTGGGGAGTAGAGG AGAGAGGATCAGGGAGAAATTGGAGAGAGAGCTTGAGCCTGTTGAATTGA AAGTGGAAGATATATCTTATCAGCATGCTGGACATGCTGGGGTGAGAGGC AGTGATGGAGAGACGCATTTTAATGTGAGAGTGGTTTCAAAGGAGTTTGA AGGAAAGAGTTTAGTTAAAAGGCATAGGCTTATCTATGGGCTATTGCAAG ATGAACTGCAGAGTGGACTTCATGCATTGTCAATTGAAGCGAAAACACCG ACTGAAGTTGGAAGCAGCTAA

Locus_tag

DCAR_013778

Name

DCAR_013778

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

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Sequence Coordinates

DCARv2_Chr4:27447837..27457244+

Type

gene

Unique Name

DCAR_013778.gene

Sequence Residues

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ACATTATATATGAAGAGTCCAGATGATCAGAATACACTAGTTTTTCTTCA
GTTTCAGGAAGGTTATTGTCCTGTACTCTTGCCCACAGGCTAAAACCTTG
CCAAACCAGACTTTGCTGTTTAAAGCCCTTTGTATAATGCATACTTCTGT
AAAGAACCCGAACCCATCTATTACATTATTTGCAGTTATCAGAATCAAAA
CTGGCACTTTTTCTTAAAATGTGTCAAAACAGTACTTAATTAATTAGTTA
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AATCCACACTAAACAAAGCAAAAGGGTATGAGAGGTAGCTAGCGACGACA
GTGTGCCTTGCACATATGTTTACAGTCATAGAAACAAGCACCCCCACAGT
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CCTTCCATGTTTAGTAAAACTATAACATAAGTGGATTAATCCGATATATA
AATGCAGGTGGGTGCAGTGATCATAGTGACAGCTAAAATATACCATGTAC
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TGCACTGTGCATTCATTGTCTTACAGGCATGCAGCTGCCAGACATGGGCC
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AAAACTAGCAATAACTACTTGTTTTTTAAATTTTTTTCACTTTTGAGAAT
ATCAATTTTTTTCCTAAAATAGCTAAACATATACTTAAAAGGTGGCTTCG
AGTTTCTAAGGGTAACATTAGAATACTCTTGTATTAGTGTGGTCTACAAA
ATTATATCTAACAGATGTTTTCAACAATCCGACTTAACGGATATGAAATG
TTATAATATAATATTTTTATACAAATTTAAATTATAAAATAATTTACTAT
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ACTTGGTTATTGCACTTGAACAATAATAAGACTGCAGTAACAGTTAATAG
GCCCAATATTAAACCAGCCCAGACCCATACAATCTCGTGATTCAACAACC
GTGGGCTTCGTCCTTCATAAACTATCCAATCATCTATCTTCTCCAGCTCC
TCTCCGAACACACTGCAAATTTTCATCAACCAAACCAAAAGCACACACAC
AAACATGGCAGTCTCAACCTCATTCCGAGTATTTTCCACAAGGTTCCCAC
AACCTATTCTCCACCCAACTAAAACCCCTGTTTTTCAAACCCTATTTCTC
AGTACAATTCCTCCACAAACCCCCACAAAAATCTCATTTTTCAGGTCAAT
TTCAATCCAAAAAGTGCCCACAACTCCTCACGCATCATCATCTTCAACCC
CTTCAGCTTCAGTTAATCTCCAGCCCATTTCTGATCTTCCCCCAAAGCTT
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TGAGCAGTTGTTGTTTTATGGTCGGAATTTGAAACCCCTTGATGCAAGAT
TCAAGATTTCTGATAATAAAGTTCAGGGTTGTGTTTCCCAGGTCTGGGTC
AGGGCTTATTTTGATGACGATAAAAATGTGGTCTTTGAAGCTGATTCTGA
TTCTGTGCTGACCAAGGGCTTAGCGGCATTGCTTGTTCAGGGTCTTTCGG
GGGAGCCTGTTGAGGAGATTGTCCGGGTTTCACCTGATTTTGCTGTGCTT
CTTGGGTTGCAACAGAGTTTGACTCCTTCTAGGAATAATGGGTTTTTGAA
TATGTTGAAGTTGATGCAAAAGAAGGCTTTAAATTTATTCATTGAAGCTG
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AGTACTGATAAGGACGGTGATTTGTTTGTGGGAGATGGTGTGGAAGTCGA
TGGTGGTGATTCGGGCTCGAGTTCTGATAATGTGATTGCTTTGGGGAGTA
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AGGCAGTGATGGAGAGACGCATTTTAATGTGAGAGTGGTTTCAAAGGAGT
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CAAGATGAACTGCAGAGTGGACTTCATGCATTGTCAATTGAAGCGAAAAC
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ATTTTTTCTGATATGCCATTTTTGTTTGAAATTAGTCAGTAAACTTGTTT
TATGTTTCATTGTACTTGTAGTTAGCAAATAATCTGATACTATTATGTAT
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TATAATTTCCTGCCCCCTGAGAGATTACACTATAACGCGCTTGAAGTTTA
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ACATACTGTGAGATAATGGCAACTATGTTAATGGGATTCTTGATACTCAT
GTATGTTCCTTTTGTCATTTTCCGGGGGAAGGGGAACTGCATCTGCGGAT
TTTTTTTTTTTAACTTGTCATTTTATGGTTGTGAATTATATCTAGTATTG
TGTATATCTAATTAAAGTTAGACTTTCGTTTTTGCGTTGCGACTCAGTTG
TGTTCAGTGTTATGATAACCATCCGGTGCATTATAAGTATGGATCATGCC
TTAAGGGTCCCAGCTTTGGTCTCTACAAGATAAAAGAAAATGTGTTCTGA
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CCTTTCGCAAACTGCTGTTTTCTTTACTTCGATTCTAAATAAGCTTCTTA
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AAATTTCATTCTTGGTGAGTTTTAGAGTTCCCACTCTTGGAGAGTTTTAA
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TGATGATGATGATGATGACAGTAATAAGTTAACAACTATTTGTACCATGG
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TGTAGCTATTCCTCGAAACATTAACTATTTGTATATGTTGTATATGTTTG
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TGATTTGCAAGTTCTCAAGTCCCCCCTCCCCCCTCCCCCCGATCTTCTGT
TTTTACTTGGATGACTATCTACTAGCTTGGTGTGTAATATTTTTTCACAT
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TTTATCCTCTATAAAGTAGATTATTGTTTATAATCTGTGTTAAGTTGGAC
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TCTTTTTCAGCTTTGACCAGTAACTGATCAACATATATTAAGATCTAATA
TGTCATAAATAGACCTAGGACTTTAAGCTTCCTGGCATTCCGCAGTTTCC
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AGTTTATGTATATGCTTCACATCATAGCTTCTTTCATTATTATCCGAGAG
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GGAAGTGAATAGAAGTGGGGCAAGTGAATATTATATTCATAAATAATAAG
TTAAGAGCACCTAGATCTTCTTTTAAAGAGATCTTCTTTAATAAGTCCTG
CTTCTCGTGCTAAATTTTATACTGTATGCTGTATTTGTATATTCATAAAT
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AAAAAATTTGGTGTGAAGTGGGAATTGGTGGAATGTACTTACTTTACGGA
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CAGAATATTCTGTAACTTGGATTGAGAACCCAGAAAGGCTAGTACGAACA
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AAGGCTACCAAAGGGAGCACTTCTATATGAAGGTCTTTTTGGTGCCTGTC
AATGTGTCATCAGTTTTTGTGCTTGTGTTATTATTCTGATATTGAAGATA
CTCCTGGATATTTAATTTGTTAGAACTTTCTACGGAATATGCAATAGTAT
ATAATATAAGGTCTGTCTGCTAGAAAGCAGGGATACTTCATCTGGGTGAA
GAACTGCGTAGGGGATACTTGGGGGTGCGGGGGTGCGGGGGGGTGCCGGG
GTGCGGCGGGATACGCACGGGATACGCCACGTGGCGTATCGGTGGAGGCA
GAAACTTAAAACTAGTTGGTCAAAAGAAAGAAAAGAGGGATCAAAACCTA
ATTAGACTAATTGAGTACCTGTACGAGAGAGAGCAGAGCATCTTCAGCTA
AAGTATGTCGATTGGTAAGTGTGTTTTGTGTAATATCTGCTCATGTGTGT
CTATAGATTGTAAGTATATATAATTGCTCGTGTGTGTGTGTATATTTCTA
TCTCTAGTAGGATTGATATAGTTATTCCGCTATTTTGTTCTACTTAAATG
CATCTTATGAATTATTTATTATATATATATATATATATAATATTTTTAAT
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AAGAATGTGTTTTTCATCTCTTAATTTTACAGCTTCTGGTGATAAGGATG
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TGCACAAAACCATATCAAAGGATTGGTCCTGCGAGGCGGCCTAAGTAATG
GCTGAACTCTCGTTTTTCTTCCACTGCCGAGTAAGTCTGCTTCAATATTT
TTCTGATTTATATCCTTTTCTGATACAACAAGCTGGTTACGAGGAGGAAC
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TTTAAGA

Sequence Length

9407

Sequence MD5 Checksum

18f74a41b64f810e1afef75f0863fb35

Relationship

The mRNA DCAR_013778 is a part of Gene DCAR_013778
The Genetic Marker MK018060 4_27449930 is located in Gene DCAR_013778
The Genetic Marker MK002697 K0141 is located in Gene DCAR_013778

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False