DCAR_005879

Cds
>DCAR_005879cds ATGTTCAAGTTTTTACAAAGCGTTGTAGCCGGATCCGGGTCGGGTCTCAA AGATCTGCCCTACAATATCGGGGAGCCTTATTCTTCAGCTTGGGGCTCGT GGATTCACTCCCGTGGCACCTCTAGGGATGATGGATCTCCAGTGTCAATA TTTTCTCTATCAGGGAGTAGTACTAATGATAGACATTTAGCTGCTGGCCG TAATGGCGTCAAGCGTCTTCGAACGGTTAGACATCCAAATATTCTATCTT TTCTTCACAGTACTGAGGTCGAAACTTCTGATGGCTCTTCTACAAAGATT ACTATATATATTGTCACGGAACCTGTCATGCCTTTATCAGAAAAGATTAA AGAATTAAAATTAGAAGGTACACAAAGGAATGAGTATTATGCATGGGGCC TGCACCGGATAGCCAAGGCCGTCAGCTTTCTTAACAATGACTGTAAACTT GTTCATGCAAATGTTTGTTTGGAAAGTGTTGTTGTTACTCAGTCTCTGGA CTGGAAGCTACATGCTTTCGATGTTCTATCAGAGTTTGATGGGAATAATC AAGGAGCTTCCACAGGGCCCATGCTGTCATTACTTCCAGATTATCAGCGG CTCTTGAGTTCAACTCCTTCTCGCAGGTTGAACTCGTCGAAGCTTCTAGA AACTTGCGAATATTTCCAAAATAAATTGGTGGACACCATTCACTTCATGG AAATTCTCAATCTGAAGGATAGTGTAGAAAAAGATACTTTCTTTCGTAAG CTGCCTACTCTAGCTGAGCAGCTTCCTCGACAGATTGTGCTAAAAAAGCT ACTTCCTTTACTAGCTTCAGCCTTAGAATTTGGATCAGCTGCAGCACCTG CTTTGACTGCGTTGCTGAAGATGGGTGCTTGGCTTTCAGCTGAAGAATTT AATATCAAGGTTTTACCAACACTTGTCAAACTTTTTGGTTCTAATGACCG AGCTATTCGAGTTAGTCTTCTGCAGCATATTGATCAATTTGGAGATTCAT TGTCATCACAAATTGCTGATGAGCAAATTTATCCTCATGTTGCTACTGGG TTTTCTGACACATCTGCTTTTCTGAGGGAATTAACACTCAAATCAATGCT TGTTCTTGCCCCCAAGCTGTCCCAACGGACTCTATCAGGATCACTGTTGA AGTTTCTTTCAAAGCTACAGGTTGATGAAGAACCAGCTATTAGAACAAAC ACCACCATACTGCTAGGAAATATTGCCAGCCATCTTAATGATGGGACACG GAGAAGAGTTCTCATAAATGCATTTACAGTCCGTGCTTTGCGTGATACCT TCTCTCCCGCAAGAGGCGCAGGGGTTATGGCTCTATGCGCAACCAGTTCT TATTATGATTCAACTGAGATTGCAACTCGCATCTTGCCAAATGTTGTGGT ACTTACTATAGATCCTGACAGTGATGTTCGATCAAAGGCCTTCCAAGCGG TTGACCAATTTCTGCAAATCCTGAAGCAAAATCACGAGAAGACCAGTGGT GGAGAGTCAGCTGGGGACTCGAGTACGGGGATGGCATCAGCACCAGGAAA TGCTAGTTTACTTGGGTATGTTATTCTGAAATCTAGTATCACCATTTTTT GTGTGGAAAAACCTGACATTTGTTTCAACGGGAAGCAGATGGACAAGTGT GTTTAA
Locus_tag
DCAR_005879
Name
DCAR_005879
Organism
Daucus carota subsp. sativus
Pep
>DCAR_005879pep MFKFLQSVVAGSGSGLKDLPYNIGEPYSSAWGSWIHSRGTSRDDGSPVSI FSLSGSSTNDRHLAAGRNGVKRLRTVRHPNILSFLHSTEVETSDGSSTKI TIYIVTEPVMPLSEKIKELKLEGTQRNEYYAWGLHRIAKAVSFLNNDCKL VHANVCLESVVVTQSLDWKLHAFDVLSEFDGNNQGASTGPMLSLLPDYQR LLSSTPSRRLNSSKLLETCEYFQNKLVDTIHFMEILNLKDSVEKDTFFRK LPTLAEQLPRQIVLKKLLPLLASALEFGSAAAPALTALLKMGAWLSAEEF NIKVLPTLVKLFGSNDRAIRVSLLQHIDQFGDSLSSQIADEQIYPHVATG FSDTSAFLRELTLKSMLVLAPKLSQRTLSGSLLKFLSKLQVDEEPAIRTN TTILLGNIASHLNDGTRRRVLINAFTVRALRDTFSPARGAGVMALCATSS YYDSTEIATRILPNVVVLTIDPDSDVRSKAFQAVDQFLQILKQNHEKTSG GESAGDSSTGMASAPGNASLLGYVILKSSITIFCVEKPDICFNGKQMDKC V*
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Type
gene
Unique Name

DCAR_005879.gene

Sequence Residues
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GACACTTGGAAAAGCTAAAAAGGAAATACAAAGTAAATTAATTGGAACAT
TTTTGTTATTGGGGTTTCCTCTTTAAGATTCACAAAACAGTACACCTTGT
GATGCAGGAATGAGTATTATGCATGGGGCCTGCACCGGATAGCCAAGGCC
GTCAGCTTTCTTAACAATGACTGTAAACTTGTAAGTGCTTATGTATGTTT
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TGTATATAAACGTATATAGGCAAATGATCAAATAGAAACTACTTGATAGA
AACTAAACAGAAACCAGGAGAAACTCCTCGTAGATGACATCACCCACCTC
TATATGTCGTCACCCACCCCTAAAATGACATTACCCACCCCGGGACCATC
TCCGGCCCCACTCAATCACACACACACACACACACACATATTGGACTTCT
ATTATATTCTTTATTTGTTCAGAAAGTTTGGTTTAAACAATTAATTAGCT
CTACAATCTTCTAATTCTTCTTCAAATTCTATTGTTTTTACTTGTGACAA
CTTTCCTCCATAGGTGGTTTTATACTTCTTCCTACTGCTCAATGTTTGCC
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AATGGATTTAATATTGTGGTACAGGTTCATGCAAATGTTTGTTTGGAAAG
TGTTGTTGTTACTCAGTCTCTGGACTGGAAGCTACATGCTTTCGATGTTC
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GTAAGTTCTGTTTGGATGTTGTAATTATTAATTAGAGTTTCTTACAATAG
ATCGTATGACGCAGAATTAATTTCATTTCATGTGATTGAAGTTTTTGGTT
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GTGTCTATATATAATTACACACACACACACACTCATATATATATATATAT
ATATGTATATAGGGCAATGAGAATTAGTTCCTTAGAGATCTAGTATGTCT
GCACCTCACATTTACGTGTTCTGTAAATATTGTTTACTATTTTTTGCTTT
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ATTTTACATAGAATCTTGTTATTTTTAATCCATATTTATTGTGAAACATG
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CAATGATCTAAAGGGAAAAGAAACATCTCATGTGAAAAAAATTCATTCAA
GAATTGTTATATCAGGTTATTCTATTCTTCTTTTAATCTTTACATATACG
TGTTTAGTAATTTGTTTACAATCTTTCAGTAGTATAAGTACACATTCTCT
GTTTAGTTCAACACATAAATGTTTGTATATAAAAAAACAACCAATATTAA
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GCTGAGATTTGGCCCCTGCTTAAAGTTCTATCTGCTGCAGTTTTTAGACC
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CTTTAATTAATAATTTTTAAACCTTATCATTGTGACAGTAACATAATCTT
TTTGCATCTTGGTTAGCTACTTCCTTTACTAGCTTCAGCCTTAGAATTTG
GATCAGCTGCAGCACCTGCTTTGACTGCGTTGCTGAAGATGGGTGCTTGG
CTTTCAGCTGAAGAATTTAATATCAAGGTTTGTTCATTTTATACCTATCG
GGGGTATTGTTTTACTTAATGTCACCAGTTCAAAATAAATACTGCCATTA
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GCTCCATGCTTTTTCCAGGTTGATTTTTGGAAGGTGTCACTCCTTGATCA
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GCAAATAATATATTTTCATTAACTATAGTATTTACAGGGATTGGGGGCCT
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GTTTAGTTACGTGATCATTTGAAGAATTTAACCTAATTTTCAGTATATAT
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ACATCCGTTTTAATCACTAATATCGTGCTTGAATTGTAATGGATTCGGAA
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Relationship
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  • The Genetic Marker MK008049 2_19245046 is located in Gene DCAR_005879
Database Reference Annotations
GFF_source:.
Publication
Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.
Analysis
Is Analysis
False
Is Obsolete
False