DCAR_004897 | CarrotOmics Tripal4

Cds

>DCAR_004897cds ATGGAGGGTGGTCCTGTCAAGCCAAATAAAACGGAGTTCACAGAATGCTG GCGGACTTCATTGAAAACACCCTACATAATGCGGCTTGCACTCTCAGCTG GCATTGGAGGTCTTCTCTTTGGCTATGACACGGGTGTTATTTCGGGAGCT CTGCTTTACATAAGAGATGAATATAGTACGGTAGAGAAGCATACTTGGTT GCAGGAAACTATTGTTAGTATGGCTGTAGCTGGTGCAATTGTTGGCGCTG CATTTGGCGGATGGATAAATGACAAATTTGGCCGAAAGAAATCAATCTTG CTAGCTGATATTCTGTTCTTTGCTGGTGCAGTAGTTATGGCTGCTGCTGT TGGCCCATGGATGATTATTTTGGGAAGAATTTTAGTAGGTTTGGGAGTTG GAATGGCTTCAATGACCGCCCCTCTTTACATTTCAGAAGCTTCACCTGCT AGAATTAGGGGTGCTTTAGTTAGTGCAAATGGTTTGCTAATCACGGGAGG GCAATTTCTGGCATATCTTATAAATTTAGCTTTCACCAGGGCACCTGGAA CCTGGCGTTGGATGCTTGGAGCTGCTGGAGTACCAGCTGTTGTTCAATTT GTATTGATGTGGTCACTTCCAGAATCTCCTAGATGGCTATATAGTCAGAA TAAGATAGAAGAATCAAGGGAGATCTTGGCAAAGATCTATCCGGCTGATG AAGCTGAGAAGGAACTGGAAGCCTTACAATCATCTATTGAAGCTGAAAAG GCAGATGCGAAATCAATAGGTGAAGGTTTTTTAGCCAAAGTACAGAGTGC TTTCAGCAACAAAATTGTACGAAGGGGCCTATATGCTGGTATTGCAGTCC AAGTGGCACAGCAATTTGTGGGTATAAACACAGTGATGTACTATAGTCCC ACAATTGTTCAATTTGCTGGATTTGCTTCAAACAAGACAGCTATCGCCCT CTCTCTAATCACATCAGGTCTTAACGCTTTAGGATCCATCATTAGTATGG CTTTTGTTGACAGGTACGGGAGAAGGAAACTGATGCTCATCTCCATGATT TCCATTATAACTTGCCTCATTGCCTTAGCTGGGGTATTTTATGGAGCCGC TGCACGTGCTCCCAGTATCAGCAATTTTGAGTCCTCTCATTTTGGAGGGA ACTCTACATGTCCAAGTTATATTACTGCATCAAATCCATCTTCTTGGAAT TGTATGACTTGTTTAAAAGCATCCTCAGATTGTGCCTTTTGTGCCAATGG CGCAAACGAATATCATCCTGGAGCATGTCTTGCTGTTAATGATGGTTCCA AAAGTGCATGTCGAGCAGATAACCGCACATGGTACACTCAAGGCTGTCCA AGCAACATCGGTATCTTAGCAGTATTACTACTCGGACTCTACATTATATG TTACTCCCCAGGAATGGGAACGGTACCCTGGATTGTGAATTCGGAGATAT ATCCATTGAAATACAGAGGCATTGGTGGGGGAATAGCCGCAGTTTCAAAT TGGATTTCTAATCTTATTGTAAGTCAGTCATTCCTGAGCTTAACACATGC ACTTGGTTCTGCTGGCACGTTTCTTTTGTTTGCTGCTATTTCAGCTGTCA CAGGGACTGCAATATTCTTCCTTGTGCCTGAAACGAAAGGTCTAACGTTT GAAGAAGTCGAGAAGATGCTTGAGAAAGGGTTTAAACCAAGCGTATGTGG TAATGACCCTGATCCTGATAAAAAGCTGGATGGAACAGTTTAA

Locus_tag

DCAR_004897

Name

DCAR_004897

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_004897pep MEGGPVKPNKTEFTECWRTSLKTPYIMRLALSAGIGGLLFGYDTGVISGA LLYIRDEYSTVEKHTWLQETIVSMAVAGAIVGAAFGGWINDKFGRKKSIL LADILFFAGAVVMAAAVGPWMIILGRILVGLGVGMASMTAPLYISEASPA RIRGALVSANGLLITGGQFLAYLINLAFTRAPGTWRWMLGAAGVPAVVQF VLMWSLPESPRWLYSQNKIEESREILAKIYPADEAEKELEALQSSIEAEK ADAKSIGEGFLAKVQSAFSNKIVRRGLYAGIAVQVAQQFVGINTVMYYSP TIVQFAGFASNKTAIALSLITSGLNALGSIISMAFVDRYGRRKLMLISMI SIITCLIALAGVFYGAAARAPSISNFESSHFGGNSTCPSYITASNPSSWN CMTCLKASSDCAFCANGANEYHPGACLAVNDGSKSACRADNRTWYTQGCP SNIGILAVLLLGLYIICYSPGMGTVPWIVNSEIYPLKYRGIGGGIAAVSN WISNLIVSQSFLSLTHALGSAGTFLLFAAISAVTGTAIFFLVPETKGLTF EEVEKMLEKGFKPSVCGNDPDPDKKLDGTV*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr2:1303710..1306359+

Type

gene

Unique Name

DCAR_004897.gene

Sequence Residues

ATGGAGGGTGGTCCTGTCAAGCCAAATAAAACGGAGTTCACAGAATGCTG
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TAACTTGCCTCATTGCCTTAGCTGGGGTATTTTATGGAGCCGCTGCACGT
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ACGTTTGAAGAAGTCGAGAAGATGCTTGAGAAAGGGTTTAAACCAAGCGT
ATGTGGTAATGACCCTGATCCTGATAAAAAGCTGGATGGAACAGTTTAA

Sequence Length

2649

Sequence MD5 Checksum

63461bb2ab7bbf8fcd68da4802ee5fb4

Relationship

The mRNA DCAR_004897 is a part of Gene DCAR_004897
The Genetic Marker MK004179 K1623 is located in Gene DCAR_004897

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False