DCAR_003870

Cds

>DCAR_003870cds ATGGGTTGTGCTGCATCGCGTATTGATAAAGATGAAAGGGTTAGAATATG CAAGGAGAGGAAGAGATTAATGAAGCAGGTGGTAAGATTTAGAGGAGTAT TTGCTGAGGCCCAGTTAGAGTATTTGACAGCACTGAAAAATACTGGTGCA ACCCTTCGCCAGTTCACAGAATCCGATTCACTGGAACTCGATGATAACCC ATTTGGGGCTACATCCCCACCTTCACCTCCTCCTCCATTGCCTCCCTCAC CTCCACCTCCACCTACTTTTAGTCCTGATCCAAGGAAGGTTAATAATAAC CACAAGTTGGATGCTTCCCAAGAAGAAAGTATAGAATTCGATGAAGATAA TAGCTGCACACCTCCTCCACCTCCGCTTCCAAGTTCTTCGTGGGAGTTCT GGGATCCGTTTGGTAATTCTGCTGCGCATTATAAGGAGAAAAGTGAAACA GTTGATCAGATTGAAGAGGAATGTTGGGCCGAGGCCAAGGAGAATAGTGA TATTGTGGATCAGGTTGAAGAGGAAAACTGGGCTGAGGCCAATACAGAAT TTGAAGAGGAAAATTTGGAAGAGGAAGCTGGAAGTACTGATCTTGTGAAT CTTCTTTCCGAGAAGCCACATCGGAGTGAATTTTTTGATGATAATTCATC TGTGATGAGCTGGCATACTAAAGACACCTCAGATATGGCCATGGTGGTTT CGATGAGTAAGAGAACCTTGGCAAATATTGTCAGGGAGCTAGATGATTGC TTTCTAAAAGCGTCTTCTGGTGGGAAAAATATAGGCGTTCTTATGGACAT TACGGTGGTGGACTCTGTTCTTTGGCAGAAGAATAAGGAAAATAAGAGGA AGAGGTCAAATTCTGTAAAAGTCTTCAGTGCACTAACATGGAGTTGGTCG TCCAGATCACTTAATCATACAAGAGATATTATAGATTTCTCTGATCCTAG TGAAGCCTGTAAGCCTGGAGCTCATTGCATTACCCTAAGAAAGCTATGCG ACGAGGAGCATAAACTCTACAAGGAAGTAAAGGAGGAAGAGATGAACAAA TTAGAGCATGAGAAAAAGTCCTTGCAATTACAAAAACAACAAATGGAAGA TCAGGACTGGACAAAAACCGAGAAAACTCGAGCAAGTGTTGAGAGCCTAC AGTCTGAGATCATACGTCTACAACAGTCAATTAGCCGGACTTGCTCAACC ATTTTGGTTCTAATAAATGAGGAGCTGCATCCACAGCTGTCTGCATTAAC TTCTGGGTTGATGCATATGTGGAAGAAAATGTTTGATTGTCATCAAGTTC AGACCCATATTTCCCAGCAGGTGAATCACCTCTCAAATTACCAATGTGTT GATCCAACTACTGATTACCATAAGCAGGCTGCAGCTCAGCTTAAATCTGA GGTCACTTCATGGTGTGACAGCTTCTGCAAACTCATAAAATTTCAACGAG AATATGTGAGAACTATGTCCAGGTGGATCAAACTCACAGATTGCCTTGTG GAGAATTCTGATCTATCCAGTGGCCCATCTGCAGTTCACGCACTCTGTGA GAACTGGCATCTTGCCCTTGACAAGTTACCTGAAAAGGCAGCCGAAGAAG CCATCAAGAGCTTTTTGTCAGCCATTCACGCCATAGTCTTGCAGCAGGAA GATGAACTTAGTCTACTCAGAAGATCTGATAAACTCGAAAAAAAATTGCG AAGGGAGCTAAACTCAATGGCCGAAATGGAGATGAAGTTTGAGGGGAGCT TTAATGTCGAAAACCCACACTCTGGGTTGAGCCCTAAGCATCCATTAGTT GTTAAGCGAGCAAAAGTGGAGGCGTTGAAGAAGCAGGTGGATGATGAGAA GGCCAAGTATCTCAGCTCAGTTGAAGTTACTAGAGTCATGACCCTAAATA ACCTAAAGACTAGTCTCCCTAATGTATTCCGGGCATTGATGGGGTTTGCT AGTGCCTATAGTCAGGCATTCGAGGTCATTCATAGTGCCACACCGTAG

Locus_tag

DCAR_003870

Name

DCAR_003870

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_003870pep MGCAASRIDKDERVRICKERKRLMKQVVRFRGVFAEAQLEYLTALKNTGA TLRQFTESDSLELDDNPFGATSPPSPPPPLPPSPPPPPTFSPDPRKVNNN HKLDASQEESIEFDEDNSCTPPPPPLPSSSWEFWDPFGNSAAHYKEKSET VDQIEEECWAEAKENSDIVDQVEEENWAEANTEFEEENLEEEAGSTDLVN LLSEKPHRSEFFDDNSSVMSWHTKDTSDMAMVVSMSKRTLANIVRELDDC FLKASSGGKNIGVLMDITVVDSVLWQKNKENKRKRSNSVKVFSALTWSWS SRSLNHTRDIIDFSDPSEACKPGAHCITLRKLCDEEHKLYKEVKEEEMNK LEHEKKSLQLQKQQMEDQDWTKTEKTRASVESLQSEIIRLQQSISRTCST ILVLINEELHPQLSALTSGLMHMWKKMFDCHQVQTHISQQVNHLSNYQCV DPTTDYHKQAAAQLKSEVTSWCDSFCKLIKFQREYVRTMSRWIKLTDCLV ENSDLSSGPSAVHALCENWHLALDKLPEKAAEEAIKSFLSAIHAIVLQQE DELSLLRRSDKLEKKLRRELNSMAEMEMKFEGSFNVENPHSGLSPKHPLV VKRAKVEALKKQVDDEKAKYLSSVEVTRVMTLNNLKTSLPNVFRALMGFA SAYSQAFEVIHSATP*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr1:42703547..42709312+

Type

gene

Unique Name

DCAR_003870.gene

Sequence Residues

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TTTATATTTTCGATTGTCAGTTTGTTTCCTAGCGTGTCCTGCCATTTAGT
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TCTACTGTCCCTATTTGTTTTAAAACTGACAAAATACATTCGCTGGTCTA
TGTAATTTTCCTCTTTTAACTTCAAATGCTTGATCTCAGTAGAGGACATG
TTCATGAAGCTCCTCAATGTCAATTCCTCTTTAACTCTGAGGAATTTGGA
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GAAATTTGAGTTGCATAATGAAAACTCCTCCAGCTGCATTTTTGAAATTG
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AACATGGATTATTACACTCACTTTTGCCATGGGGTTTGCTATTTTTGCTT
GTAATATTTATTTTCTTCTACCTCTTCTTCCAAAATTTTTACATTGTAAT
ATATGTTTCTTGTAATTAAAATACAGGAGGAAGAGATGAACAAATTAGAG
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ATTAGCCTAGCTACCAGAATAAATCTCAAGAGCTGCTAGGGAACTTGAAA
AGTTAAAAATGTATTATATGATGGTGGCTCCTGTTTCGGATTTCCAAACA
TTTCCTTGACATTTGTAACTGTAAATTGTCTGCATTAACTTCTGGGTAAT
TCTGTTTCTAAAAATTAAAACCAAGATGTCTTTTTATGCGTTGCAATTAG
CCTAGCTACCGGAATAAATCTCAAGAGCTGTTAGGGAACTTGTAAAGTTA
ATAATGTATTATATGATAGTGGTGCCTGTTTCGGTTTTCCAAACATTTCC
TTGACATTTGTAACTGTTAATTGTTTTGCTATGTTGGTACTCAATACCTC
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CAAAATGGGAACTGTATCTACAGTCATGGAAAACACAGAGCTTTTACTGT
AAACTTTGCCAGTTGAATCTATTGAATCAAACTGAACTTATCAAATTTAA
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GAGTTACCACAGGACGAGTTTATTAAATCCATAAAGGCTATTTGATGGAT
ACATCATTTCCATTTTTTATTTCTCGAACAAGCGTTACATTTTGCAAGAG
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GGAAATATAAATTTTAGGTTGATGCATATGTGGAAGAAAATGTTTGATTG
TCATCAAGTTCAGACCCATATTTCCCAGCAGGTGAATCACCTCTCAAATT
ACCAATGTGTTGATCCAACTACTGATTACCATAAGCAGGCTGCAGCTCAG
CTTAAATCTGAGGTCACTTCATGGTGTGACAGCTTCTGCAAACTCATAAA
ATTTCAACGAGAATATGTGAGAACTATGTCCAGGTGGATCAAACTCACAG
ATTGCCTTGTGGAGAATTCTGATCTATCCAGTGGCCCATCTGCAGTTCAC
GCACTCTGTGAGAACTGGCATCTTGCCCTTGACAAGTTACCTGAAAAGGT
ACGCATTTGCTAATCCATGCAGTACTTTTGTTAAGCCATATGTACATGTG
ATTGCCCGATGTTCTCATCTCTAAATTCAACTAGTTCCTGATGTCCTACT
CTGACTCTTGTTAAAATTTAGGATCTGCAATGCCAATATAGATCCAAACA
TTTATTCTCTGTCTCTCCTCTTTGTTTTTACATGATGCAACATGATTATA
CATACAGATTTGTGTAGTTTATATGACATATGAAGTAACATACCGAGCTG
ATTCCTATGGAGTGCATAGAATTTCCCATGATATGTGATAGTAAGCTAAA
TAAAGTTTAAAGTAGGAGGTTCAGCCGTGCGGGAGGGGTAAGGGTGTATC
TGTAAATTCTAACCTCCATTGTTGTAGTCACAGATGAGAAGTTTATAGTG
ATATACTTGCTCTCTGAGATTATTCACTACTTGATATTTTGATAGAACTT
GAGTTTATTTTATTGAAGAAAGTTTATTATCTACCAAGGACTTGCAAGCA
ATCCCCAGACATAATAGAACTTTAATGTCCAAAAATAAAAAATTAAGCAT
CACTTTGTACCTCACCTGACAAGAGATAAGTTTAATCCAAGGTTAAAATG
TGTGATTTTTAAAGTTAGTAAAATAATAAAATTCTCATCAAGGTGAAACC
CAAACTTGTATAATATGAAAATGAAAATATAATCCAATTAAAGGCAACCC
TTTGGTTGGACACTTCAAGTATTACATGAGTGTAAGATCAGTAAAATTAT
TAAATGAACTAAAGAGCATTCAACAATATTGTGAATATTAAATTGACAAC
CACACGCGCTAATAGTTTATGGTAGATGCATAGGTGCTTAATGTAACACC
CCAGTCCCATATCGAGGAGTGTGGAAACTTTAGTTCAATTTATAAGCATA
AGTACTGCTACCAATGGTACAAACAAATCATGATCTTTTGGGGGCCTGTG
GTGGGCTTGTGGATTACCCAAGTTGTTGCAATTGAGCCATTGTATTTCGG
CTTATTTTCGGATTCGGAGTTCAGGACTTGACCCGATTTTCGGAAAAGAC
CACGAAGGCTGGTGGTATTATCCCGCAAATGGACAGAGATCCGGAGGCGG
GGACACGAAGCCAACCGGTATTATCCCACAATGGCTAGAGAGTTAATTTG
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TGATATATATACCTGTCAACTTTCTATTAAGCTTTTAGTGGTCACATTTC
TTAGGCAGCCGAAGAAGCCATCAAGAGCTTTTTGTCAGCCATTCACGCCA
TAGTCTTGCAGCAGGAAGATGAACTTAGTCTACTCAGAAGATCTGATAAA
CTCGAAAAAAAATTGCGAAGGGAGCTAAACTCAATGGCCGAAATGGAGAT
GAAGTTTGAGGGGAGCTTTAATGTCGAAAACCCACACTCTGGGTTGAGCC
CTAAGCATCCATTAGTTGTTAAGCGAGCAAAAGTGGAGGCGTTGAAGAAG
CAGGTGGATGATGAGAAGGCCAAGTATCTCAGCTCAGTTGAAGTTACTAG
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CATTGATGGGGTTTGCTAGTGCCTATAGTCAGGCATTCGAGGTCATTCAT
AGTGCCACACCGTAG

Sequence Length

5765

Sequence MD5 Checksum

bff9dc06bee11290ac7ccf42adb0c5b1

Relationship

The mRNA DCAR_003870 is a part of Gene DCAR_003870
The Genetic Marker MK003128 K0572 is located in Gene DCAR_003870

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False