DCAR_000321 | CarrotOmics Tripal4

Cds

>DCAR_000321cds ATGGGTATCCTATATGATGATATAGTGATAATAAATCAAGCAGAGAAAGA AGGTGAGCCAACTGTGATAACTGTGAATTGTCCAGACAAGACTGGCTTGG GTTGTGATCTTTGCCGCATCATTCTCTTCTTTGGTTTGAGCATTAACAGG GGTGATGTGTCTACGGATGGGAAATGGTGTTACCTTGTGTTCTGGGTTTT CGGAAAACAAAATACAAGATGGGGTCTATTAAAGAAGAGATTATCAGAGT GCTGCCCTTCTTGTTCTTCAGCTTCTGGAATCTCTTTTTACAGGACTGAT TTGGAGCCACCAAAGCCTTCGGAAGTGTTCCTCTTGAAGTTCTGTTGCCA TGATCGAAGAGGCCTTTTGCATGATGTAACATCAGTCCTCTGTGAGCTTG AACTCGTAATAAAGAAAGTTAAGGTGTCTACCACACCTGATGGGAGAGTG ATGGATCTCTTTTTTATTACAGATACAAGGGAACTACTGCACACAAAGAA GAGAAAGGATGACACGTATGATAGTCTGAGAGCTGTTTTGGGGGATTCAT TGATAAGTTGTGACATAGAAAAAGTTGGCCTTGAAGTTGCTGCTTGCTCT CAGTTTCCCACTGTGCTTCCTCCAGCACTAACTGAAGACATGAAGTTAGA GATGCTCGATCCTCAGAAAAGTGGACCTGCTCCTTCACATAATGTTACTA TTACGATGGATAATTCCCTCAGTCCTGCCCATACCCTTGTTCAAATCGTC TGTCAGGATCACAAAGGGCTCTTGTATGATATTATGAGAACTTTAAAAGA TTACAATATCCAGATTTCTTACGGCCGCTTCACTACAAAAACGAAAACAG AATGCGAAGTGGACTTATTTATTATGCAAGCTGATGGAAAGAAGATAGTT GATCCAAGCAAGCAGGGTGCATTGTGCTCTCGTTTGCGTATGGAACTGTA CCGCCCCCTCAGGTTAGCTCTAGTAAGCCGCGGACCTGATACAGAATTGC TAGTTGCAAACCCTGTGGAATTATCTGGAAAGGGTCGGCCACTTGTTTTT TATGACATCACTCTAGCTCTCAAGATGCTAGACACTGGGATTTTTACGGC TGAAATTGCAAGGCACATGATTGGAGACCGCGAATGGGAAGTTTACAGAG TTTTACTTGACGAAGGGGATGGCTCATCTATCTCAAGGAACATGATCGAG GAAGCAGTTCGAAAGATGTTGATGGGTTGGGAGTGA

Locus_tag

DCAR_000321

Name

DCAR_000321

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_000321pep MGILYDDIVIINQAEKEGEPTVITVNCPDKTGLGCDLCRIILFFGLSINR GDVSTDGKWCYLVFWVFGKQNTRWGLLKKRLSECCPSCSSASGISFYRTD LEPPKPSEVFLLKFCCHDRRGLLHDVTSVLCELELVIKKVKVSTTPDGRV MDLFFITDTRELLHTKKRKDDTYDSLRAVLGDSLISCDIEKVGLEVAACS QFPTVLPPALTEDMKLEMLDPQKSGPAPSHNVTITMDNSLSPAHTLVQIV CQDHKGLLYDIMRTLKDYNIQISYGRFTTKTKTECEVDLFIMQADGKKIV DPSKQGALCSRLRMELYRPLRLALVSRGPDTELLVANPVELSGKGRPLVF YDITLALKMLDTGIFTAEIARHMIGDREWEVYRVLLDEGDGSSISRNMIE EAVRKMLMGWE*

Sequence Coordinates

DCARv2_C10726282:778..4381-

Type

gene

Unique Name

DCAR_000321.gene

Sequence Residues

TTTTAATCTTTACAGGAAAGCCAAGATTTTGAGAAAGAAGGGAAAAGATG
GGTATCCTATATGATGATATAGTGATAATAAATCAAGCAGAGAAAGAAGG
TGAGCCAACTGTGATAACTGTGAATTGTCCAGACAAGACTGGCTTGGGTT
GTGATCTTTGCCGCATCATTCTCTTCTTTGGTTTGAGCATTAACAGGGGT
GGTATGTTTTTTATTCTTGATTTCCAATTTCACCCTCTTTTTGTGTTTAA
ATTTTGAAAACTTTGTTGGGTATTTGAATAATTTACCAATTAAGTTTTCA
ATAAGAGATTGCTATCTGGGGTTGTGGGTTTGTGAGATGTGATTGCTTAA
ATATCATTGTTGGGCTATGTACATATTGTTAGCCTTGCTTTCAAAGGGAC
TTTAAAGCTGGACAAAAGAATCATTTGAGTCATGGTAATTATATTGATGT
CTTTGTTATCTGTAAAGAGTTTTGTACCTCCTAGCTCAATTTTATATCAG
GTTTCAAGAAACTGAGTATATGAATTGCAGAATTGGTACTTTGATTCTGC
TTGTGTGTGTGTGTTTTATATTAGACTGAGTAAAAGATACTGAATTGTGC
CTTCTTTTGATTGTGATGCTGAAGATGTGTCTACGGATGGGAAATGGTGT
TACCTTGTGTTCTGGGTTTTCGGAAAACAAAATACAAGATGGGGTCTATT
AAAGAAGAGATTATCAGAGTGCTGCCCTTCTTGTTCTTCAGCTTCTGGAA
TCTCTTTTTACAGGACTGATTTGGAGCCACCAAAGCCTTCGGAAGTGTTC
CTCTTGAAGTTCTGTTGCCATGATCGAAGAGGCCTTTTGCATGGTACATC
TATAAGAACCAGTAACAGTGCCTTAATAAATTATATATGTACTGTGAGCA
GATTTTGCTGATCTAATAATGTGATGTTGCATATGTCGAACAAGGGGGTT
ATCATCATTTATTTATCATGTTCTTTATTATTTTGTATACTGGCAAGAAG
CTCCCATATTAATATCTGTATCTATGCTGGTTGCCCCAGTTCTTTCTACC
ATCAGCATGTATGTGGGTTCATTTGATCTCGTTAATGACTTATCTTCATA
TAATTTACGCCTCTTACATTGAAATGTAATTCACAGATGTAACATCAGTC
CTCTGTGAGCTTGAACTCGTAATAAAGAAAGTTAAGGTGTCTACCACACC
TGATGGGAGAGTGATGGATCTCTTTTTTATTACAGATACAAGGTAAGTTC
CCAACGGTCTTAACTTGATGTTACACATGTTCTATACTTGCTACTGTTTC
ATGATTGCGTACTTTCTATTCATTCTTAGGAGCGGAAAAGTGTGTGTGAG
TGTGTGCGTCAAGGACAGACCATCATAGCCAATTCAATTGGCTTAGCCAT
GCTACAGAGCTATATATTTCATTGTAGTAAATGATTATTGATTGTTGATT
TCCTTAAAATTCAAATGATTACATAGACATGGAATTCCGCTCGATCAGCA
ATAAATCATAAAATTGGTAGTCTGGAACAAGAACTCCTATATTCTGAATT
TTCCCAACAGATGCACGTGTCTGTTAAATATATATTGCGTGTATAACAGA
AAGTTGGCCTAGTATCCTTTATATTTATTTCTGTGTTCTTTAGGGCAGGG
CGTCTTGTTATGTAATTAATTACTTTGTCAAGGAGCTATATTAGTTTCAA
AACCGAACTTGAAACTTCTCCTACAACTGTTTTGTCAGGGAACTACTGCA
CACAAAGAAGAGAAAGGATGACACGTATGATAGTCTGAGAGCTGTTTTGG
GGGATTCATTGATAAGTTGTGACATAGAAAAAGTTGGCCTTGAAGTTGCT
GCTTGCTCTCAGTTTCCCACTGTGCTTCCTCCAGCACTAACTGAAGACAT
GAAGTTAGAGATGCTCGATCCTCAGAAAAGTGGACCTGCTCCTTCACATA
ATGTTACTATTACGATGGATAATTCCCTCAGTCCTGCCCATACCCTTGTT
CAAATCGTCTGTCAGGATCACAAAGGGCTCTTGTATGATATTATGAGAAC
TTTAAAAGATTACAATATCCAGGTAAATAATGTCTTTTGCTTCTTTGAGT
TGGTGTAACCATTATTTCAGTATCACCCTATTGATGCATTAGATAATGGA
TATCCTCCTATGGCAGATTATTAGATTGTCAGTGAGTGTTTAGTCGACTT
TTGAGCAATAATCCTGTTACTGCATACACAAGCACCTTTGGTATTGTAGA
ATGTAGACCGTTGTTCTTGACGATTTAAGTTTGTGATCTTATATTTTGCC
CAAGTTTACCTAATTTTATGACTGATTGACTGTTATTTGTTAAATAAAGG
ATCCTCCATGATAGGATGTTCATATGCTTGTATATGATGTTCATAGTATG
CTCAGTATTTAATTCTAACAATGGATTTTCAGCTTTTTATACTAAATGTT
TCTCTTGATTATGACAGATTTCTTACGGCCGCTTCACTACAAAAACGAAA
ACAGAATGCGAAGTGGACTTATTTATTATGCAAGCTGATGGAAAGAAGAT
AGTTGATCCAAGCAAGCAGGGTGCATTGTGCTCTCGTTTGCGTATGGAAC
TGTACCGCCCCCTCAGGTTAGCTCTAGTAAGCCGCGGACCTGATACAGAA
TTGCTAGTTGCAAACCCTGTGGAATTATCTGGAAAGGGTCGGCCACTTGT
TTTTTATGACATCACTCTAGCTCTCAAGATGCTAGACACTGGGATTTTTA
CGGTATTCCTTGCTTCTTATCCTCTGTTCTTATGTCACAAACTTTTACAG
CTTTAAAATTCACTGTGATAGACTGAATTATGATACAGGCTCATCAACTG
AATGTTGTAATTTTAAGTGTAGCATTCTTTGATTGTTTGTTGTTAGCGTA
CTCAAATTATAAGTATTTCCTTAAAAACTATGGGTTCACAGTCCTTAATT
GAGTACAACTTTTCTATATTGGATGCTCTTTCTGTTATAGGGCTCTCTAT
ATCGGATACTCTCTTCTTCCTGTGAAAAAAATACCTTTCTCTTGCATTTT
CTGGTTTTTCCACCTTTTGGCCATAGATTTTTTTTTAATCATTAGTAGAA
TTCTCCACCCTTTCGATCTTCTTCTTAAGCTGTGTTTACATCTACAGGCT
GAAATTGCAAGGCACATGATTGGAGACCGCGAATGGGAAGTTTACAGAGT
TTTACTTGACGAAGGGGATGGCTCATCTATCTCAAGGAACATGATCGAGG
AAGCAGTTCGAAAGATGTTGATGGGTTGGGAGTGATAATGTATGAAGACT
GTAGGTGTGTCTCCATTTAGTTGACATCCGATGTGGTGATGTACAGTGGA
ATGGCTAAGCCGTACCAGGTTAAGAACTTTGGCAAGACTAACTTAGCAAT
ATAGCAAGAAGAAGATTAATAGGTAGTTTGTAGCAAGGAGATAAACAAGA
ACATGGTGAATATAGTCTCTCCAGAAATTCATCCTCAGACCGGTAGTGTA
ACATTGTATATCGAAACAATCCTGCAGATGGGAAGACGCGGCTTCACATA
TATGTTTTAATTGCCTCCTGTGGGAAAGCTTGACCTCAAACCTCTACGTC
CTG

Sequence Length

3603

Sequence MD5 Checksum

beb29a3df128336e54ef40ba4b773b2a

Relationship

The mRNA DCAR_000321 is a part of Gene DCAR_000321

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False