DCAR_000320 | CarrotOmics Tripal4

Cds

>DCAR_000320cds ATGGAGCACAATCAGAGCAGCGATGATGAGTACTCTCACAGCGACGATGA TTACAACTTTAATGATGAGCTGCACTTCTCTGAACCCTCTTCATCTAATA AGGTGATCAGGAAAGAATCTTTGTTGGCTGCACAGAGGGAAGACCTACAA AAGGTAATGGATTTGCTGTTTGTGAAAGAACACCATGCACGGACCATACT CATTCATTATCGTTGGAATGTTGAAAAAGTCTTTATGGTGTTTGTGGAGA AGGGAAATGAGTTGTATGCAGAAGCAGGTATAACAGTAAAGGAGCATGAT GGACAATCCTTGTTTCAAAACTCATCTAATGTAACATGTGACATTTGCAT AGAGGAAGTTTCAGCAATTGAAACAACGACAATGGATTGTGGCCATTGTT ATTGCAATAATTGTTGGACTGAACATTTCATTGTGAAAATAAATGAGGGC CAGAGTAGACGCGTCAGATGCATGGCTGAAAAGTGCAACGAAGTTTGTGA TGAAGGTAAAGTTAAAAGTTTGGTCAGTGCCAGAGATCCTGTTCTTGCTG AGAAGTTTGACTGCTTCCTCCTACAGTCATACATAGATGATAATAAGAAG GTGAAATGGTGCCCTAGCATTCCTCATTGCGGAAATGCAATCCGGGTCGA GGATGATCAGTACTGTGAGGTTGAATGTGCATGTGGCCTGCAATTTTGCT TCAATTGTTCAGCTGAAGCACATTCACCATGTTCATGTCTGATTTGGGAG CTTTGGCACAAGAAATGTATGGATGAATCGGAGACAGTTAACTGGATTAC AGTCAATACAAAACCCTGCCCACATTGTCACAAACCAGTGGAGAAAAATG GCGGATGTAATAGAGTACGATGTATCTGCGGACAAGCATTCTGGTTAGTC CTCTCATGCTAA

Locus_tag

DCAR_000320

Name

DCAR_000320

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_000320pep MEHNQSSDDEYSHSDDDYNFNDELHFSEPSSSNKVIRKESLLAAQREDLQ KVMDLLFVKEHHARTILIHYRWNVEKVFMVFVEKGNELYAEAGITVKEHD GQSLFQNSSNVTCDICIEEVSAIETTTMDCGHCYCNNCWTEHFIVKINEG QSRRVRCMAEKCNEVCDEGKVKSLVSARDPVLAEKFDCFLLQSYIDDNKK VKWCPSIPHCGNAIRVEDDQYCEVECACGLQFCFNCSAEAHSPCSCLIWE LWHKKCMDESETVNWITVNTKPCPHCHKPVEKNGGCNRVRCICGQAFWLV LSC*

Sequence Coordinates

DCARv2_C10726272:208..3834-

Type

gene

Unique Name

DCAR_000320.gene

Sequence Residues

ATGGAGCACAATCAGAGCAGCGATGATGAGTACTCTCACAGCGACGATGA
TTACAACTTTAATGATGAGCTGCACTTCTCTGAACCCTCTTCATCTAATA
AGGTAACTTTAAAAAAAAAAAAATTGTTTTTTACTGTTCTTGATTTGATC
AATTTTTTTAATTTTTTTTTTGCATTATCAATTTTGTTTAGTTTGTTGGT
ATATAAATTATGGGTTTAGGGTTTAATGTTTCTTTATGACGAGGGTTGTT
GATGAAACAAACATATGTGTCGAATTTGTCGAAATTTTGGCATGTCTGCA
CAGAGGAAGGGTTTGCAATGCTAGGAAAGATTGCATCTTTGTTGAGTTAA
GATTTTCAAAAATTAGTTTGATATGTAGTTGTACTGAATTGATGAATTGA
AAATATGGTTTGAGCTAATACACCATACCTTGTTTTCATGCATTTATTTT
GGAATATAGTTTATCGAGTTATGTATGTACATATGTCTGTTTAGAAAGAT
ACATTTGAAGTTCATTTATAGATGTCGAATACCTCGTACTAAAGGGAAGT
ATGAATTTGTAGGGTCTTAGTTAGATTCTTGTTTTGTTATGTATAGTTAT
TATATTGATTTGTATCATATTGAAGTTAGGATTGTGCATATCTGATAGGA
ATGTATGATGGGAACCATCTATGCAAATTAAATTTTGGTTGGGCCGTGAC
TGGTCTATGCTGAGTGATTGAACTTTATTTTTGAACATATTACTTTGTTG
ATGTTTAATTGATGCTTTGTAGTGCAAGTGAAAGATCCTTCTGGTTGATA
ATATGTAGATCAAGGAACAAGGTTTCTTTGACACCTGGCCTCATGTAGTT
TATATGCGTCGATTTTATAATTGTGGCAAATAAATTGATGGAAGAATACA
TGGAACAATATGAGTGAATTGTGAAGTGGTCACTGAGCTTTACTCAGTTT
AGCACTTCAGCGGCTGGATTGTTAAATTTTCTGTGTTTTAGGAAAGTGGA
TGATTAAAAAACAACTGTTGACATCTATTGCTTTTGAACAACAAAAACAG
TGTGCGGCCATTAAATTGCAATTTTGAAGATTTCAGTCACCAGAATGTGA
CATTAGTTTAATTTCAGCCAATAATTCTGCAATGTATTAAAAAATATTCA
TCAGTAACATCGGGTAATTTAGAGACTGAATCTTAAAAAATATTGCCGTT
AAGAAACTGGTGAACATATAACATAGTGTCACAATTTATTTCGCTGTTAT
TCAAACCATTATAATTTTTTACATTAGGCAGAAATTTGGAAAATAATTCA
CATACTAATTGCACATTAGTTGTCAATAAAATCTTGAGTGCATATTCTCC
GAATCTAATATCTTCTATCGTCTAAAAATTATTACTTTTGACCACAATGT
GTGTATCTACTCTAGTTTTGGTATATTTTATGTTTCTTTTGTTAGTTATT
TTTCTTAGGCAAACTTTAGCATTTTCTTCAACGCAGCCTCCGGTTTCTTT
TCCATAAATTTTGGCTGCATAATATAGGTGCACACAAAGACACATTAACA
ATTATAAAGCATTACTAAGAATCATCTTTACGGTCTCCATCACCATGAAT
CGCGACAGTCTAGCAGTCAAGGTAATTGAAGTAAGAATGTGTGCATCCCT
TTTTTGGTGCTGTTGCTATAGTGTCCATAAAGTAACCCTATATGTTCTGA
TTTTTTTTTTTTAATGTTAGTTGCATTTTGAATCTACATATTTTGTTGAT
ATCTGTCCTTTGACAAGACTGTAACTGAAATGCTTCCTTGGTTTGTCTTA
TGTAAAAGGGCCTAGAAAATCGAAAACGTAAATTAATACTTCATTTTGAA
TTGCCCCTATTTTTTTATTCTTTTGTAATACTAATACATTAACTGTTAAT
TCTTAAAAATAGTGGTTTACAAGTTGCAAGAACAGCTTCTATAGGGCTCA
CTTTGTTCTGTGATATTACACTGAGCAGGTCCATTTCTTTTGATAATTAT
ATGAAATTACAAGAAAGTATATGTTCACCAATTTGAATTTTGGTTTCCTA
TTAATAGCCTTTTCCTTTGCAGGTGATCAGGAAAGAATCTTTGTTGGCTG
CACAGGTGAGTTAATTTTAATGTTATTTACTTTCTAATTTGGCCTTAAAT
TGCCATAGGGATTTAATGTGCTTGTTTTTTGTGCTTCGTTAATGCAGAGG
GAAGACCTACAAAAGGTAATGGATTTGCTGTTTGTGAAAGAACACCATGC
ACGGACCATACTCATTCATTATCGTTGGAATGTTGAAAAAGTCTTTATGG
TGTTTGTGGAGAAGGGAAATGAGTTGTATGCAGAAGCAGGTATAACAGTA
AAGGAGCATGATGGACAATCCTTGTTTCAAAACTCATCTAATGTAACATG
TGACATTTGCATAGAGGAAGTTTCAGCAATTGAAACAACGACAATGGATT
GTGGCCATTGTTATTGCAATAATTGTAAGTGTATCGTTGCCTTTGGTTTT
CTTACAATGTATCTCAAGTTTATTTGTTGCAGAAGTATGGTCACTTGATA
TAATCTACAACTTTCAGTGTCAACTCTCGTATTAATTATTGTATTTCTTG
GACTCTGTATTCTCAAATGTAATACTTTGAAGTAACTCTTGAATGGCGCG
GATACCATAATTTAAGGTGACAGACATCTAAGTTGTGCTAGCACTTAAGT
CATATGCTTTGATGTTCAACCCTAAATGATTATTATAATTACATGTTTAT
ATTTAACTTAGATCATATTTAAATTTCTATAAGCTTTACATCAGCAACTT
ATGTACTTGATTCTGCATGCAACATTGATCTGCAATTTGTCTTGATGTGC
AAAGTGTCTTCTGGGCTTAATAAATGCACAGCAAGTTTTTTGCTTCAATG
GCACAAGCTATTGTGCGAGTCTTTTAACAATGTCAATGGTATATGCTCTA
GCTCGAGTCTTCTGTTCATGTCTTGGACACTTTTTCCCGCTTGATTATCT
GGTATATCTTTAATGGTACTGTATATACTATTGACTTGAAGATTAACGTT
ACAACTAATATAATATGTTAATTCTTGAATCAAAAACTTGATAGAATTTC
ATCTTAGTTTTCCTCATCTCATTCAGGTTGGACTGAACATTTCATTGTGA
AAATAAATGAGGGCCAGAGTAGACGCGTCAGATGCATGGCTGAAAAGTGC
AACGAAGTTTGTGATGAAGGTAAAGTTAAAAGTTTGGTCAGTGCCAGAGA
TCCTGTTCTTGCTGAGAAGTTTGACTGCTTCCTCCTACAGTCATACATAG
ATGATAATAAGAAGGTGAAATGGTGCCCTAGCATTCCTCATTGCGGAAAT
GCAATCCGGGTCGAGGATGATCAGTACTGTGAGGTTGAATGTGCATGTGG
CCTGCAATTTTGCTTCAATTGTTCAGCTGAAGCACATTCACCATGTTCAT
GTCTGATTTGGGAGCTTTGGCACAAGAAATGTATGGATGAATCGGAGACA
GTTAACTGGATTACAGTCAATACAAAACCCTGCCCACATTGTCACAAACC
AGTGGAGAAAAATGGCGGATGTAATAGAGTACGATGTATCTGCGGACAAG
CATTCTGGTTAGTCCTCTCATGCTAA

Sequence Length

3626

Sequence MD5 Checksum

572791eb7571960a3792d29a36cc6a31

Relationship

The mRNA DCAR_000320 is a part of Gene DCAR_000320

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False