DCAR_020189

Cds

>DCAR_020189cds ATGATGGTGGATCTGAGCTCATTTTCCGACGAGAATTTTGAGGCGAAGAA ATGGATAAACAATGCCTGTCAATCACGTCACCCTCAAGATCCGCTGGAGA ATCATTTAGTAGATCTGGAGATGAAGCTTCAAATGATCTCCGAAGAGATC TCCGCCTCGCTCGAAGAGCAGAGCGCCGCCGCGCTCCTCCGCGTGCCTCG CGCTTCGCGTGACGTCATTCGCCTTCGCGATGATGCGTTGTCGCTTCGTC AATCGGTGGCTTCGATCATCCAGAAACTGAAAAAGGCAGAGGGTTCCTCG GCAGAATCTATAGCTACACTTTCAAAAGTCGATACAGTCAAGCGACGAAT GGAAGCAGCTTTTGAAACTTTGCAGGATGCAGCTGGGTTAACTCAGTTGA GTTCAACTGTGGAGGATGTGTTTGCCAGTGGTGATCTTCCACGTGCTGCT GAGACATTGGCAAATATGAGGCATTGCTTATCTGCTGTTGGGGAGGTTGC TGAATTTGCTAATATTAGGAAGCAGCTTGAGGTCTTAGAGGATAGACTAG ACAATATGGTCCAGCCTCTGTTGGATGACGCAATAAACAATAGAAAGACG GAAGTTGCTCAAAATTATCGTGGAATCCTCATTCGTATAGGAAGATTTAA GTCTCTAGAGACATACTATGCCAAAGTTCACCTCAAGCCATTGAAGCAGC TGTGGGAAGATTTTGACTCTCGGCAACAAACTAATGCAATACCGAGCGAG AAAAATGAATCTATTTCACTTTTAAGTTGGTTGCCGAGTTTCTATGATGA ATTGCTTCTATATATAGAGCAAGAGTGGAAGTGGTCGATACTTGCTTTTC CGGAAGATTACAAGACTCTTGTGCCAAAGCTTTTGCACGAGCTAATGGCA ACTGTTAGTGGAACTTTTGTCTCACGCCTCAATTTAGCAACTTCTGAAGT TGTCCCAGAAACAAAAGCTTTGGCTAAAGGCATATTGGATATCTTATCTG GAGACGTGCCAAAGAGTGTCAAAGTTCAAACGAAGCACCTTGAGGCACTA ATAGAATTACACAACATGACGGGAAGCTTTGCTAGAAATATTCAACACTT GTTCTCAGAAACCAACCTGAAGGTTTTATTGGAGACACTGAAAGCAGTTT ATAATCCGTATGAACCCTTCAAACAAAGGTATGGACAGATGGAGCGCATT ACTTTATCTGCTGAGATTGGAGGAATTGATCTCAGAGGAGCTGTAAAAAC TACCCGCATTGGATCCCAAGGAGTTGAACTTAGTGAAACAGTTCGAAGAA TGGAAGAGTCTATCCCACATGTCATTGTACTTCTTGAAGCTGCTGTAGAG AGATGCATCAACTTTACTGGTGGTTCTGAGGCAGATGAGTTGATTCTGGC TCTCGATGACATAATGTTACAATACATTTCCACTTTACAAGACATTCTGA AATCCTTAAGAGCTGTATGTGGTCTAGATGTTATTTCTGATGGTAATGAG AAAAAGGATGGAGTTTCAGTAGCGCGTAAAGTTGAGTCTTCAACTGAAGA GGAATGGTCTTATGTCCAAGGTGCATTGCAAATTCTTGCAGTGTCAGATA GTTTAACAAGCAGATCTGCAGTTTTTGAAGCTTCCCTGAGAGCTACTCTT GCTAGACTGAGCACCAACCTGTCTGTGTCAGTATATGGTTCAAGTCCAGA TCACAAGCAGTCACATGTGGTGGACGTTGATGGAAGTGGAGATTTATCAG TGGCTGGAAGGGCAGCCTTGGATGTGGCAGCTTTGAGGCTTATTGATGTC CCTGATAAGGCTCGGAAACTCTTTAACCTATTAGAACAGTCCAAAGATCC TCGGTTCCATGCTCTTCCAATTACAGCTCAGAGAGTTGCAGCATTTGCAG ATACAGTCAATGAGCTCGTTTACGATGTCCTGATATCTAAAGTTCGACAA CGTTTTAATGATGTGTCTCGTCTTCCAGTTTGGTCTTCTGTTGAGGAACA AAGTTCTCATCACCTACCAAGCTTTAGTGCATATCCACAGAATTATGTGA CTAGTGTTGGTGAATATCTTTTAACTCTTCCCCAGCAATTAGAACCACTC GTCGATGGAATATCAGGCAGTGATGCTAATGCCGATGAAGCGCAGTTCTT TGCAACTGAATGGATGTTCAAGGTTGCAGAGGGTGCTACTGCTCTTTATA TGGAGCAGTTGAGGGGTATACACTATATAACAGAGCGTGGAGCGCAGCAA CTGTCCGTAGATATCGAGTATTTGAGCAATGTGTTGTCTGCTCTCTCAAT GCCAATTCCTCCCATCCTTGCTACATACTACACATGCCTGTCTACCCCAA GAGATCAGCTCAAGGAACTGTTGAAATCGGATTCTGAAAGCCAGCTTGAT CCCCCGACAGCAAACCTTGTTTGCAAAATGCGGCGTGTTAATTTGGAATA A

Locus_tag

DCAR_020189

Name

DCAR_020189

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_020189pep MMVDLSSFSDENFEAKKWINNACQSRHPQDPLENHLVDLEMKLQMISEEI SASLEEQSAAALLRVPRASRDVIRLRDDALSLRQSVASIIQKLKKAEGSS AESIATLSKVDTVKRRMEAAFETLQDAAGLTQLSSTVEDVFASGDLPRAA ETLANMRHCLSAVGEVAEFANIRKQLEVLEDRLDNMVQPLLDDAINNRKT EVAQNYRGILIRIGRFKSLETYYAKVHLKPLKQLWEDFDSRQQTNAIPSE KNESISLLSWLPSFYDELLLYIEQEWKWSILAFPEDYKTLVPKLLHELMA TVSGTFVSRLNLATSEVVPETKALAKGILDILSGDVPKSVKVQTKHLEAL IELHNMTGSFARNIQHLFSETNLKVLLETLKAVYNPYEPFKQRYGQMERI TLSAEIGGIDLRGAVKTTRIGSQGVELSETVRRMEESIPHVIVLLEAAVE RCINFTGGSEADELILALDDIMLQYISTLQDILKSLRAVCGLDVISDGNE KKDGVSVARKVESSTEEEWSYVQGALQILAVSDSLTSRSAVFEASLRATL ARLSTNLSVSVYGSSPDHKQSHVVDVDGSGDLSVAGRAALDVAALRLIDV PDKARKLFNLLEQSKDPRFHALPITAQRVAAFADTVNELVYDVLISKVRQ RFNDVSRLPVWSSVEEQSSHHLPSFSAYPQNYVTSVGEYLLTLPQQLEPL VDGISGSDANADEAQFFATEWMFKVAEGATALYMEQLRGIHYITERGAQQ LSVDIEYLSNVLSALSMPIPPILATYYTCLSTPRDQLKELLKSDSESQLD PPTANLVCKMRRVNLE*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr6:33442493..33452170+

Type

gene

Unique Name

DCAR_020189.gene

Sequence Residues

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TTAAAGTTATTTTTCAAAAAACAGACTAAGTCTTATTTATCTCTAAGAGC
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TGAGAAAATAATTCACTCCAACAGTCAGTAACTTAGTGATTTCTTAAATC
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CAATGCCTGTCAATCACGTCACCCTCAAGATCCGCTGGAGAATCATTTAG
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CTTCGATCATCCAGAAACTGAAAAAGGTGTGTTTATGAGTCAGTGTATGT
ATTCATGCTTGAATTGTCAATTAATTGATTCAATTAGTGATAATTGGCAC
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TTGAACTCGAGCGTGTGTGTGTATTCTGTATTTTTTACTTGTCGCGGTTT
TTGATATGTGAATATGAAGTTATATGTTTAGTTTGTCCTTGAATTATTAG
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ACTGTGTTCGTATCTGTATCAATGCTTGTATTGAATATATGTTTAGCGAG
CATTTTTAGTTTTGTCTGATCTGATTCTGCATTAGTTGCTTTAATACGTA
TCGGAATTTTTTGAATCGAGCAAATTTGGTGATTAGTGAGATTGGTATGT
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TTTTTTACCTGTGAGTTGAAGTTTTGTGTTAATTTAATATCAATTAATTG
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CTTTCAAAAGTCGATACAGTCAAGCGACGAATGGAAGCAGCTTTTGAAAC
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GTGATCATCCACTTAATTAGTTTTGTTATTAACTTGTAAATAGGATGCAG
CTGGGTTAACTCAGTTGAGTTCAACTGTGGAGGATGTGTTTGCCAGTGGT
GATCTTCCACGTGCTGCTGAGACATTGGCAAATATGAGGCATTGCTTATC
TGCTGTTGGGGAGGTAATGTCTGGCTTAAACTGATGGCATATTGTTTGTC
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AATATGGTCCAGCCTCTGTTGGATGACGCAATAAACAATAGAAAGGTAAC
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AGATCATTCATATCTGTACTACTGTTGATTAATTTTTTTAAGTTTAATCA
TTCTTCCCTTTGTTAATGCGTAGACGGAAGTTGCTCAAAATTATCGTGGA
ATCCTCATTCGTATAGGAAGATTTAAGTCTCTAGAGACATACTATGCCAA
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AACAAACTAATGCAATACCGAGCGAGAAAAATGAATCTATTTCACTTTTA
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CCACCTGTACACAGATATTTGAAGTCAAGTTTTTTTTTGGACGAATACAA
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TGAGGGAAAGGATTGTTACCTTCTCTAATCAATCTTTATATGAATTTCCC
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CCGGAAGATTACAAGACTCTTGTGCCAAAGCTTTTGCACGAGCTAATGGC
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TTGTCCCAGAAACAAAAGCTTTGGCTAAAGGTAAAACTTCCAGTCATTGT
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GGATTTTTCTTAAAATAAATAAGTTCGTAAACTTCCGTGGGATGGGTAGG
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GTAACATCCCGTAATTTTTAGACAATATTTATTTATTAATAATTATAAAA
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GCATTGGATCCCAAGGAGTTGAACTTAGTGAAACAGTTCGAAGAATGGAA
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CATCAACTTTACTGGTGGTTCTGAGGCAGATGAGTTGATTCTGGCTCTCG
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GAGCAATGTGTTGTCTGCTCTCTCAATGCCAATTCCTCCCATCCTTGCTA
CATACTACACATGCCTGTCTACCCCAAGAGATCAGCTCAAGGAACTGTTG
AAATCGGATTCTGAAAGCCAGCTTGATCCCCCGACAGCAAACCTTGTTTG
CAAAATGCGGCGTGTTAATTTGGAATAACATCAATTTTTAATTTTCTATT
GATTGTTACTTAAGGTTCACTGAAGGTTGGCTGGTACCAGTTCTACACTC
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Sequence Length

9677

Sequence MD5 Checksum

6ce890477506dfe58d0e389a10b123b6

Relationship

The mRNA DCAR_020189 is a part of Gene DCAR_020189
The Genetic Marker MK018650 6_33446065 is located in Gene DCAR_020189
The Genetic Marker MK011529 6_33446123 is located in Gene DCAR_020189
The Genetic Marker MK011319 6_33446127 is located in Gene DCAR_020189
The Genetic Marker MK002704 K0148 is located in Gene DCAR_020189

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False