DCAR_017536

Cds

>DCAR_017536cds ATGGCTCTCCACGGTCTTTTTTCCCCGTTTCTTGTCACTGCACCTTCTCG CATGGCTATTCCTTCCAGTAATGCTCCTAAACTTTGTGCTAGCAAACCAG TTCAATGCATAACAACTCCTGTCACAACGACTGACCATGATCAAGGTTCA GCCTCTCGAAGAAATGCTAACTATGTGCCAAGTTTCTGGGACTACAACGT CGTCAAGTCACTGTCCAGTAATTATGATGAAAAGAAATATGAAATGCAGG TAGAAGAGTTGAAGGAGGATGTTAAACGCCTGATTCATGCAGAAACCGAC GTACCATTGGCCAAGCTTGAGTTGCTCGACTCTGTTCATAGGCTAGGGTT GAACTATCAATTCCAGAAAGATATAAAGCAAGCAATTGATCGTATCTGTG AGGCTGATTCACAGTTGGGTAATGACCTTCATTCCACAGCTCTACTCTTT AGGATTCTTCGCGAACATGGATATACCGTGTCACAAGATGTGTTCCAAAA GTTTACAGATGAGACAGGTAAGTTCAAGGCAAATCTGGGTGAGGATGTCA AGGGGTTGTGCAGCTTGTATGAGGCATCTTTCTATGGATTCCAAGGGGAG GACATCATGGATCAGGCCAAGGCCTTTGCATCAGAACACCTCAAGAATTT ATTGCAAGGGAATTTATCACCTATCATGGCAAGAAAAGTGCATCATGCCT TAGATATGCCTTTGCACTGGAAATTACCAAGGGTGGAGGCTGTATGGTAC ATCCATACTTATGAGCAAGAACAAAACAAGATTCCGAATTTGCTAAAATT AGCCAAGCTGGACTACAATATCGTCCAATCAGTTCATCAGAAAGAAGTCA GCAAACTGGCTAGTTGGTGGGTGGACATTGGTTTGGGTAATCTACCCTTC GCGAGGGACAGATTAGTAGAACATTATTTCTGGGCCAATGGAATTGTTTC AGGTCCAGAGTATAGTGCTTTCCGAGACATGGCAACCAAGGTAATTTGCC TGATAACCACCGTCGACGACGTCTATGATGTATATGGCTCGTTGGAAGAA CTAAAGCTCTTTACAGATTATGTTGACAGATGGGATATTACTGAAATCGA CAAGCTCCCGATGCACATCAAGACTGTTCTTCTTGCCATGTTTAATACCG TAAACGAAATAGGATACTGGACGATGAGAGAGCGAGATTTTAACATTATA CCATATTTAAGAAAACAATGGGCAAATCTTTGCAAAGCTTATCTTCGAGA AGCCACCTGGTATCACTCAGGATACAAGCCCACCGTGGAGGAATATATGG AAAATGCCTCAGTTTCGATTGGGGGTCTGCTCATGTTGTTTTGTGCTTAC TTCCTAACCGCCGACAAGATAACTGTGGAGGCATTGGATTTCATAGACAA GGTTCCAAGCATCATGTGGTGCCCTTCTGTACTTATTCGGCTTACGAATG ATTTGGGAACATCATCTCACGAGTTGGCACGAGGTGATATATTAAAGGCG GTCCAGTGCTACATGAATGATACTGGTTCAAGTGAAGAAGTGTCCAGAAA GCATGTTGATGATCTGGTGCATGAGACCTGGAAGATTCTGAATAAAGATT TGCTTGGAAGCTATCCTTTTAGCGAACCGTTTCTCAGTGCGAATCCAAAT ATTGCACGAACGTCTCAGACTTTTTATCAGTACGGAGATGGACATGGAAT ACCTCAGCATTGGACGAAGGACCACTTAAAATCATTATTGGTTGAACCCT TCACTCTTAATGAGTGA

Gene

DcTPS-like12

Locus_tag

DCAR_017536

Name

DCAR_017536

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_017536pep MALHGLFSPFLVTAPSRMAIPSSNAPKLCASKPVQCITTPVTTTDHDQGS ASRRNANYVPSFWDYNVVKSLSSNYDEKKYEMQVEELKEDVKRLIHAETD VPLAKLELLDSVHRLGLNYQFQKDIKQAIDRICEADSQLGNDLHSTALLF RILREHGYTVSQDVFQKFTDETGKFKANLGEDVKGLCSLYEASFYGFQGE DIMDQAKAFASEHLKNLLQGNLSPIMARKVHHALDMPLHWKLPRVEAVWY IHTYEQEQNKIPNLLKLAKLDYNIVQSVHQKEVSKLASWWVDIGLGNLPF ARDRLVEHYFWANGIVSGPEYSAFRDMATKVICLITTVDDVYDVYGSLEE LKLFTDYVDRWDITEIDKLPMHIKTVLLAMFNTVNEIGYWTMRERDFNII PYLRKQWANLCKAYLREATWYHSGYKPTVEEYMENASVSIGGLLMLFCAY FLTADKITVEALDFIDKVPSIMWCPSVLIRLTNDLGTSSHELARGDILKA VQCYMNDTGSSEEVSRKHVDDLVHETWKILNKDLLGSYPFSEPFLSANPN IARTSQTFYQYGDGHGIPQHWTKDHLKSLLVEPFTLNE*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr5:20668548..20672064-

Type

gene

Unique Name

DCAR_017536.gene

Sequence Residues

TTAATTTTCAATTATTTTTTTCATCTTCTAGAGAGATGCATTACCGAATA
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TGATGTATATGGCTCGTTGGAAGAACTAAAGCTCTTTACAGATTATGTTG
ACAGGTTTGCGTTTATAGACCGACATGGAAATATTCTCATCCACTACTAT
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ATTTCCATGCCTTTCTTCATTAACCAAATATGTCCTCAGATGGGATATTA
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TTTAATACCGTAAACGAAATAGGATACTGGACGATGAGAGAGCGAGATTT
TAACATTATACCATATTTAAGAAAACAAGTAAGGGATCTGTCTACTTTAC
TTTTATGTACTAAACTTCTATGTCCATATTTTTAACGGGTTAAAATGTTA
AGTAGGTGACTGAATGTGTCCAAAAAATTCAAGTAGGTTACTCCTTGCAA
ATTTGAAATGATCCAAAACTGAAAAATGTTAACATATAGGGTAGAGCTCG
TTTTGGGCTTCAATATGGTTACTAAAACTTGCTACTTGGCTCATGAAATG
ATGATAAATCTGAATTTAGTTATCCTAATTTTTGAGGTTTCGAAGAATCA
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TTATGGGTGATTTCAATTTTTGACTTTAACGGAATAATTATCAGTTTGAG
TCAAATTTGCAATTAGTGACCTACTTTAGTTTTTTGGACGCAGTTACTTA
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AATACAATCAAAAAGGCTCAGTATATAACCTATTCTATGTTTTAACAAAC
TATTGCAGTGGGCAAATCTTTGCAAAGCTTATCTTCGAGAAGCCACCTGG
TATCACTCAGGATACAAGCCCACCGTGGAGGAATATATGGAAAATGCCTC
AGTTTCGATTGGGGGTCTGCTCATGTTGTTTTGTGCTTACTTCCTAACCG
CCGACAAGATAACTGTGGAGGCATTGGATTTCATAGACAAGGTTCCAAGC
ATCATGTGGTGCCCTTCTGTACTTATTCGGCTTACGAATGATTTGGGAAC
ATCATCTGTAAGTAATTAAAGCTGAAGTTACAGAATCGTGTGTATATTTA
TAACAATCTGTTTTTAACTGTATTTTCATTCACTAATTGGTACAGCACGA
GTTGGCACGAGGTGATATATTAAAGGCGGTCCAGTGCTACATGAATGATA
CTGGTTCAAGTGAAGAAGTGTCCAGAAAGCATGTTGATGATCTGGTGCAT
GAGACCTGGAAGATTCTGAATAAAGATTTGCTTGGAAGCTATCCTTTTAG
CGAACCGTTTCTCAGTGCGAATCCAAATATTGCACGAACGTCTCAGACTT
TTTATCAGTACGGAGATGGACATGGAATACCTCAGCATTGGACGAAGGAC
CACTTAAAATCATTATTGGTTGAACCCTTCACTCTTAATGAGTGATGGAA
ATAAGTGTCTGGCTGATCTTAATCGAATTGGATGTCATATTATATGACAT
CTTCTTCTTATTTGGATAGGCCCTATTTGGTTGCTCTGTTGTCATGTTGA
ATAAAGATTATCTGCA

Sequence Length

3516

Sequence MD5 Checksum

4ba5dced5a6942273e32f8e5e8dddde3

Relationship

The mRNA DCAR_017536 is a part of Gene DCAR_017536
The Genetic Marker MK002721 K0165 is located in Gene DCAR_017536

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False