DCAR_002067

Cds

>DCAR_002067cds ATGGGATCACTGAAGAACGAAGAAGAAGTTGAACAATCAAACGAAGCGAT CTTGTATGTTAATGGGGTTCGTAGAGTTCTCCCAGATGGGCTAGCTCACT TGACTTTACTTGAGTATCTTAGAGGTGATTATACTGTGTTTCTTGATTTA GATGAGCGTAAGGAAGTACAAGTGCCTTTAGTGGTGGACAGTTTTGAGTT AAATGTAGGTCTGACAGGAACAAAGCTAGGTTGTGGTGAAGGCGGTTGTG GGGCATGCACTGTGATGGTTTCTTATTTCAACGAAAATTTGAAGAGGTGT CGTGACAGGGATGAGAAATTTAGATGTGCTTATGTGATCTTGCTTGTGAG CCAGTCAACTTGTGGATATCTGTGGCACCATGCGGTCAATGCTTGCCTCA CTCCTCTCTATACAGTAGAAGGTATGCATGTAATTACGGTGGAAGGAGTT GGGAGTGGAAGACATGGATTGCATCCAGTTCAGGAATCATTAGCACGTTC TCACGGATCACAATGTGGATTCTGTACTCCTGGTTTTGTCATGTCCTTGT ATGCATTATTAAGATCAAGTCGAACACCTCCGACTGAAGAACAAATTGAA GAAAGTCTAGCTGGAAATTTGTGTCGATGCACAGGTTACAGACCAATTGT GGATGCATTTCGAGTCTTCTCCAAAACAGATGATTTGTTATACACCGAAG GATCTCAAGTGACTAAAGTGGGTGAATTCATATGTCCTGGAACTGGTAAG CCATGTTCCTGTGGCCCAAAAGATGCAAGCACTGAAGAAACCAGTAAACA AAGTTGTGAGGGGAACAATTATTATAAAGCTGTTTCTTACAGTGAGATTA GTGGAAGTGCATACACCAATAAAGAGCTCATATTCCCTCCCGAGTTGTTG TTGCGGAAATTGAGCTACTTAAGTATGAGAGGATTTGGAGGGCTGAAGTG GTACCGACCTTCAAGACTGTCACATGTTCTAGACTTACGATCAAGATATC CTGATGCAAAATTAGTTGTAGGTAACACTGAGGTGGGAATCGAGATGAGG CTAAAGAGAATCCATTACCCTGTTCTGATATCTGTTACACATGTACCAGA ACTTAATTTAGTAAATGTGACTGAAAATGGATTGGAGATTGGCTCTTCTG TTAGACTCTCTGAATTTCTCGAGATTCTTCAGAAGGTTACTAAAGAACGT GCTTCTCATGAAACTTCTGCTTGTAGGGCATTCATTGAACAGATAAAATG GTTTGCAGGGAAACAGATTAGAAATGTTGCTTCAGTTGGTGGAAATATCT GTACTGCAAGCCCAATATCAGACTTAAACCCTCTCTGGATGGCTGCAGGA GCAACGTTCCGAATAATTGACTGCAAAGGAAACATTAGAACAACACTGGC AGAAAAATTCTTCCTGAGCTATCGTAAGGTGGATTTGACCACTGGTGAGA TTCTACTCTCAGTATTCTTGCCTTGGACTCGGCCATTTGAACTTGTTAAA GAATTTAAGCAAGCTCATCGGAGAGATGATGATATTGCAATTGTAAATTC TGCGATGCGTGTTTTCCTCGAGGAAAAGGATCAGCAGTGGATTGTTTCAG ATGCATCAATCGTCTATGGTGGCGTTGCTGCTCTCTCTCTTTCTGCATCA AGAACTAAAGATTTCCTTATTGGAAAGAGTTGGAATAGAGAGTGTCTGCT GGGTGCTCTTAAGGTTTTGGAACAAGATATTGTAATTAAGGAAGATGCAC CTGGAGGTATGGTTGAGTTCCGAAAATCTTTGACCTCGAGCTTCTTTTTT AAATTCTTCATGTGGATCTCATATCAAATGGAAGGACAGAAATCATTCAT GGAACGCATGCCATCATCTTACTTATCCGCTGTGCAATCGTTTCATCGGC CAAGCGTCATAGGAAGTCAGAACTTCGAGATTAGAAAACACGGGAACTCT GTGGGATCTCCTGAGATTCATCTATCAGCCAGACTACAAGTGACTGGAGA GGCTGAGTACACAGATGATGCACCGATGCCGCCCAACAGTTTACATGCTG CTATGGTATTGAGTGAGAAACCTCATGCTCGTATCCTTTCTATAGATGAT TCAGAAGCCAAGAGTTCACCAGGAGTCGAAGGTATATTTTTTGCTAAGGA TATACCTGGAGATAAGATGATTGGGCCAGTTATTGCAGATGAGGAGCTTT TTGCTACAGATATTGTCACCTGTGTTGGTCAGGCAATAGGAGTTGTTGTA GCCGATACACACCAAAATGCAAGAAACGCTGCTGGAAAAGTTCGCGTTAA ATATGAAGACTTGCCAGCAATTTTATCAATAGCTGATGCTGTTAAAAATA AAAGCTTTCATCCGAACACGGAAAGAACATTGACCAAAGGGGATGTAGAA CTCTGTTTCCAATCTGGTGAATGTGACAGGGTAATTGAAGGGCAGGTCCA GATTGGCGGTCAAGAGCACTTCTACTTGGAGCCAAATAGCAGCTTGGTAT GGACAATCGATGGTGGCAATGAAGTCCACATGATCTCATCAACTCAAGCC CCTCAAAAGCACCAAAAGTATGTTTCTCATGTTCTTGGGCTTCCAATGTC CAAAGTGGTATGCAAGACCAAAAGAATTGGTGGTGGATTTGGTGGGAAGG AGACAAGGTCAGGTTTCCTTGCTGCCGTGGCAGCTGTTCCATCTTATCTG CTTAAGCGCCCTGTGAAACTCACTTTAGACAGGGACATAGATATGATGAC TACTGGGCAGCGGCATAGCTTTCTGGGAAATTACAAGGTTGGGTTTACAA ATGACGGGAAGGTGCTTGCACTGGATCTTGAAATTTTCAACAATGCCGGA AATTCACTTGACCTTTCTCTTGCTATACTCGAGCGTGCTATGTTTCATTC GGATAATGTTTATGAGATACCAAATGTCAGGGTCAAAGGAAGAGTTTGTT TTACAAATTTTCCTAGCAACACTGCCTTCCGAGGTTTTGGTGGTCCTCAA GGCATGCTAATTACCGAAAACTGGATACAAAGAATTGCAATGGAAGTTCA AAGAAGTCCAGAAGTTATAAGGGAAATTAATTTTATTAGTGAGGGATCAG TATTGCATTTTGGGCAGAAAATCGAACATTGTACTCTAGAGAGATTATGG AATGAATTGAAAACATCATCTGCCTATTCAAGTGCCAGGGAGAATGTGGA ACAGTTTAATCTGCAGAACAGGTGGAAGAAACGTGGAATCGCTATGGTTC CGACAAAGTTTGGGATCTCATTTACTACCAAGTTCATGAATCAGGCGGGC GCTCTTGTTCAGATTTACACAGATGGAACTGTTTTAGTTACCCATGGGGG TGTCGAAATGGGGCAAGGTTTGCACACAAAAGTTGCTCAAATTGCTGCCT CTTGCTTCAATATTCCTCTCAGTTCTGTATTCATATCAGAAACAAGTACC GACAAGGTTCCCAACGCCTCACCTACAGCAGCTTCAGCTAGTTCTGATAT GTACGGAGCTGCAGTGTTAGATGCATGCGAGCAACTAAAAGCAAGGATGC AACCGATTGCTTTAAAACATAATATCTGTTCTTTTCCTGAGTTGGCAAAT GTTTGTCACATGGAGAGAATAGATTTGTCAGCCCATGGATTCTACATTAC ACCTGATATTGGCTTTGATTGGAAAATTGGCAACGGGAAGCCATTCAGCT ACTTCACATATGGAGCTGCTTTTGCTGAGGTAGAAATCGACACATTGACC GGAGATTTTCACACCAGGACTGCAGATGTTTGCTTGGATCTTGGGTTCTC CATAAATCCAGCTCTCGATGTCGGACAGATTGAAGGAGCATTTATACAGG GTCTAGGATGGGTAGCTTTGGAAGAGTTAAAATGGGGGGATGCAGCTCAT AAATGGGTCTCACCTGGCCGCTTGTTCACAAGTGGGCCTGGTAGCTATAA AATCCCATCTATTAATGATCTACCTTTTAATTTCAAGGTTTCACTTTTGA AGGATGCTCCTAATGTCAAGGCCATCCACTCCTCTAAAGCAGTAGGTGAA CCTCCATTCTTTCTTGCTTCAGCTGTATTTTTCGCCATCAAAGATGCGAT TATAGCTGCAAGAGCTGACGCCGGACACACTGGGTGGTTCCCTCTTGATA ATCCTGCGACTCCAGAAAGAATACGAATGGCTTGTGCAGATGAGTTTACA AATCCATTTGCTGCCAGTGATTTTCGTCCCAAGCTAAGAGGCGGTGGTGA AACTAGTGAAGGGGGTGGTGGTGAAAATGCTGGTGGCGGTGGAGAGTATA ATGGAGGTGGTGGAGATGATAGTGGAGGAGGGGGTGGGAAAAATATTGGC GGAGGTGGAGGTGACGAAAGAGGGGGTGGTGGTGAAATTGATGGAGGGGG TGGAGACTGTGGTGTTGGAGGTGGTGGTGATGATAATGGAGGTGGGGGAG ATGATAGTGGAGGAGGTGGTGGTGAAAATGTTGGCGGTGGTGGTGGAGAT GATAGTGGAGGAGGGGGTGGTGAAAATGTTGGCGGTGGTGGTGGAGATGA TAGTGGAGGAGGGGGTGGGGAAAATGTTGGTGGAGGCGGTGATGTTAATG GAGGTGGGGGAGATGATAGAGGAGGAGGTGGCGGTGATGAGTATGATGGA GGTGGTGGAGATGATAGTGCAGGAGGGGGTGGGGAAAATGTCGGCGGGGG TGGTGAGTATAATGGAGGTGGTGGAGATAATAGTGGAGGAGGGGGTGGGG AAAATGCTGGCGGAGGTGGTGAAGTCAACGGGGGTGGAGGTGATGAAAGA GGGGGCGGTGGTGAAAATGATGGAGGGGGTGGTGACTGTGGTGTTGGAGG TGGTGGTGATGATAATGGAGGTGGGGGAGATGATAGTGGAGGGGGTGGTG GTGAGAATGTTGGCGGCGGTGGTGAGTATGATGGAGGTGGTGGATATGAT AGCGGGGGAGGGGGTGGGGAAAATATTGGTGGAGGCGGTGATGTTAATGG AGGTGGGGGAGATGATAGTGGAGGGGGTGGTGGTGAGAATGTTGGCGGCG GTGGTGAGTATGATGGAGGTGGTGGATATGATAGCGGGGGAGGGGGTGGG GAAAATATTGGTGGAGGCGGTGATGTTAATGGAGGTGGGGGAGATGATAG TGGAGGGGGTGGTGGTGAAAATGTTGGCGGTGGTGGTGAGTATGATGGAG GTGGCGGATATGATAGTGGAGGAGGGGGTGGGGAAAGTATTAGTGGAGGC GGTGATGTTAATGGAGGTGTGGGAGATGATAGAGGAGGAGGGGGTGGGGA ATATGTTGGTGGAGGCGGCGAATATGATGGAGGTGGCGGAGATAATAGTG GAGGAGGGGGTGGGGAAATTGTCGGTGGAGGTGGTGATGTTATCGGAGGT GGTGGAGATGATAGTGGAGGAGGGGGTGGGGAGAATGCTGGCGGAGGTGG TGAAGATAACGGGGGTGGAGGTGACGAAAGAGGGGGCGGTGGTGAAAATG ATGGAGGGGGAGGTGACTGTGGTGTTGGAGGTGGTGGTGATGATAAAGGA GGTGGGGGAGATGATAGTGGAGGAGGTGGTGGTGAAAATGTTGGTGGCGG CGGTGAGTATGATGGAGGTGGCGGAGATGATAGTGGAGGAGGGGGTGGGG AAATTGTTGGTGGAGGCGGGGGAGATAATAGAGGAGGGGGTGGTGAAAAT GTTGGTGGAGGCGGGAGAGATGATAGAGGAGGAGGTGGTGGTGAAAATGT TGGTGGCGGCAGTGAGTATGATGGAGGTGGCGGAGATGATAGTGGAGGAG GGGGTGGGAAAATTGTTGGTGGAGGTGGTGATGTTAGTGGAGGTGGGGGA GATGATAGAGGAGGAGGTGGTGGAAATGTTGGTGGCGGCGGTGAGTATAG TGGAGGTGGTGGAGATGATAGTGGAGGAGGGGGTGGGGAAAATGTTGGTG GAGGTGGTGAAGATAATGGAGGTGGTGGTGATGTCAATGGAGGTGGGGGA GATGATAGTGGTGGAGGTGGTGAATATACATGA

Locus_tag

DCAR_002067

Name

DCAR_002067

Organism

Daucus carota subsp. sativus

Pep

>DCAR_002067pep MGSLKNEEEVEQSNEAILYVNGVRRVLPDGLAHLTLLEYLRGDYTVFLDL DERKEVQVPLVVDSFELNVGLTGTKLGCGEGGCGACTVMVSYFNENLKRC RDRDEKFRCAYVILLVSQSTCGYLWHHAVNACLTPLYTVEGMHVITVEGV GSGRHGLHPVQESLARSHGSQCGFCTPGFVMSLYALLRSSRTPPTEEQIE ESLAGNLCRCTGYRPIVDAFRVFSKTDDLLYTEGSQVTKVGEFICPGTGK PCSCGPKDASTEETSKQSCEGNNYYKAVSYSEISGSAYTNKELIFPPELL LRKLSYLSMRGFGGLKWYRPSRLSHVLDLRSRYPDAKLVVGNTEVGIEMR LKRIHYPVLISVTHVPELNLVNVTENGLEIGSSVRLSEFLEILQKVTKER ASHETSACRAFIEQIKWFAGKQIRNVASVGGNICTASPISDLNPLWMAAG ATFRIIDCKGNIRTTLAEKFFLSYRKVDLTTGEILLSVFLPWTRPFELVK EFKQAHRRDDDIAIVNSAMRVFLEEKDQQWIVSDASIVYGGVAALSLSAS RTKDFLIGKSWNRECLLGALKVLEQDIVIKEDAPGGMVEFRKSLTSSFFF KFFMWISYQMEGQKSFMERMPSSYLSAVQSFHRPSVIGSQNFEIRKHGNS VGSPEIHLSARLQVTGEAEYTDDAPMPPNSLHAAMVLSEKPHARILSIDD SEAKSSPGVEGIFFAKDIPGDKMIGPVIADEELFATDIVTCVGQAIGVVV ADTHQNARNAAGKVRVKYEDLPAILSIADAVKNKSFHPNTERTLTKGDVE LCFQSGECDRVIEGQVQIGGQEHFYLEPNSSLVWTIDGGNEVHMISSTQA PQKHQKYVSHVLGLPMSKVVCKTKRIGGGFGGKETRSGFLAAVAAVPSYL LKRPVKLTLDRDIDMMTTGQRHSFLGNYKVGFTNDGKVLALDLEIFNNAG NSLDLSLAILERAMFHSDNVYEIPNVRVKGRVCFTNFPSNTAFRGFGGPQ GMLITENWIQRIAMEVQRSPEVIREINFISEGSVLHFGQKIEHCTLERLW NELKTSSAYSSARENVEQFNLQNRWKKRGIAMVPTKFGISFTTKFMNQAG ALVQIYTDGTVLVTHGGVEMGQGLHTKVAQIAASCFNIPLSSVFISETST DKVPNASPTAASASSDMYGAAVLDACEQLKARMQPIALKHNICSFPELAN VCHMERIDLSAHGFYITPDIGFDWKIGNGKPFSYFTYGAAFAEVEIDTLT GDFHTRTADVCLDLGFSINPALDVGQIEGAFIQGLGWVALEELKWGDAAH KWVSPGRLFTSGPGSYKIPSINDLPFNFKVSLLKDAPNVKAIHSSKAVGE PPFFLASAVFFAIKDAIIAARADAGHTGWFPLDNPATPERIRMACADEFT NPFAASDFRPKLRGGGETSEGGGGENAGGGGEYNGGGGDDSGGGGGKNIG GGGGDERGGGGEIDGGGGDCGVGGGGDDNGGGGDDSGGGGGENVGGGGGD DSGGGGGENVGGGGGDDSGGGGGENVGGGGDVNGGGGDDRGGGGGDEYDG GGGDDSAGGGGENVGGGGEYNGGGGDNSGGGGGENAGGGGEVNGGGGDER GGGGENDGGGGDCGVGGGGDDNGGGGDDSGGGGGENVGGGGEYDGGGGYD SGGGGGENIGGGGDVNGGGGDDSGGGGGENVGGGGEYDGGGGYDSGGGGG ENIGGGGDVNGGGGDDSGGGGGENVGGGGEYDGGGGYDSGGGGGESISGG GDVNGGVGDDRGGGGGEYVGGGGEYDGGGGDNSGGGGGEIVGGGGDVIGG GGDDSGGGGGENAGGGGEDNGGGGDERGGGGENDGGGGDCGVGGGGDDKG GGGDDSGGGGGENVGGGGEYDGGGGDDSGGGGGEIVGGGGGDNRGGGGEN VGGGGRDDRGGGGGENVGGGSEYDGGGGDDSGGGGGKIVGGGGDVSGGGG DDRGGGGGNVGGGGEYSGGGGDDSGGGGGENVGGGGEDNGGGGDVNGGGG DDSGGGGEYT*

Sequence Coordinates

DCARv2_Chr1:24716151..24733347-

Type

gene

Unique Name

DCAR_002067.gene

Sequence Residues

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ATTTGTAATGTGTCATTGTTGATTTTGCTTCCAAATTTTTGTTGAAGGAC
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GTACGGAGGAAGAAGGCAAATGCAGTTGTGTCCTTTGTTATGTGAATAAA
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GACCTTTAGAAACTCGAATACATGGTATCTATTATTGGGAAAAATGATGT
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GACTTAAACCCTCTCTGGATGGCTGCAGGAGCAACGTTCCGAATAATTGA
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ATCGTAAGGTGGATTTGACCACTGGTGAGATTCTACTCTCAGTATTCTTG
CCTTGGACTCGGCCATTTGAACTTGTTAAAGAATTTAAGCAAGCTCATCG
GAGAGATGATGATATTGCAATTGTAAATTCTGCGATGCGTGTTTTCCTCG
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CGAAAATCTTTGACCTCGAGCTTCTTTTTTAAATTCTTCATGTGGATCTC
ATATCAAATGGAAGGACAGAAATCATTCATGGAACGCATGCCATCATCTT
ACTTATCCGCTGTGCAATCGTTTCATCGGCCAAGCGTCATAGGAAGTCAG
AACTTCGAGATTAGAAAACACGGGAACTCTGTGGGATCTCCTGAGATTCA
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TTTTATTTTAGACAGAACAGTAGTTATGCCAATGTGTTGAATTTCTGTTT
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CATCTTGTTCATTTGGATTTATCTTCTGTCTTTTTAATTACTTAATTTAA
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TAAGGTTTCTGGTATATGAGGGATATAATTATGACCGAGTTCTTCAGGAC
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AAGTCACTATTACTCTATTTACTCAAAAAATTAAAAATAAAGCTTATTTA
ATGACAACATATGGCAGTAAAAATCACTAATTCGGGTCTGCCTTCTGCGA
AGCCCCTTCATGGTTTTATCTGAAAAGTTCTTAGTAACTTAAATTTGAAT
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AACTTTGTTGATTATTTTCAAAACATACCCTTGTGTCTAATGACCATACA
TATATATTTCCAGGTGACTGGAGAGGCTGAGTACACAGATGATGCACCGA
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GCTCGTATCCTTTCTATAGATGATTCAGAAGCCAAGAGTTCACCAGGAGT
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GTTTCCCCTACATCAACATACACTTTAGCTCATAATATTAATATATATTT
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GCTGCTGGAAAAGTTCGCGTTAAATATGAAGACTTGCCAGCAATTTTATC
AATAGCTGATGCTGTTAAAAATAAAAGCTTTCATCCGAACACGGAAAGAA
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CTCATGTTACGTCCTTAATGTTACATGTGAACTTTCTTGGCAGATCTTTT
CTGCTTCACATATTGTTAAATCATCAGTTTCTTATTCTCATTAAATTATT
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CCAAAATTAGAGTTTACATTCGAATTATTCAAGTTCTAAATTTGATGTTA
TGAGTTTGTACTTCCCCATGTGTTCATTACTCATCAAACTATGAGTATCC
TACTCTTCGTGTTCAGGCCCCTCAAAAGCACCAAAAGTATGTTTCTCATG
TTCTTGGGCTTCCAATGTCCAAAGTGGTATGCAAGACCAAAAGAATTGGT
GGTGGATTTGGTGGGAAGGAGACAAGGTCAGGTTTCCTTGCTGCCGTGGC
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GGGACATAGATATGATGACTACTGGGCAGCGGCATAGCTTTCTGGGAAAT
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GTTAACCTGATCAAAACGTCCAAAAATTCTTTATCATTTTTCTATGTAAA
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GTAGCATTGTTGCTGAAACGTGTTCTGCAAATAAGTTTTCTTTTTCTTTT
GAAAGATTCTAGGAAAGGTTTGTATGACTTTTAACCACCCAAAAAATTTA
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CCGAGGTTTTGGTGGTCCTCAAGGCATGCTAATTACCGAAAACTGGATAC
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GTTTGTGTGAGAGGATAACGATTAACGAGCACAAAAAAATGGTTGGTATG
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Sequence Length

17196

Sequence MD5 Checksum

05121f882dee3e05df02993ca8006961

Relationship

The mRNA DCAR_002067 is a part of Gene DCAR_002067
The Genetic Marker MK007965 1_24732254 is located in Gene DCAR_002067

Database Reference Annotations

GFF_source:.

Publication

Iorizzo M, Ellison S, Senalik D, Zeng P, Satapoomin P, Huang J, Bowman M, Iovene M, Sanseverino W, Cavagnaro P, Yildiz M, Macko-Podgórni A, Moranska E, Grzebelus E, Grzebelus D, Ashrafi H, Zheng Z, Cheng S, Spooner D, Van Deynze A, Simon P. A high-quality carrot genome assembly provides new insights into carotenoid accumulation and asterid genome evolution.. Nature genetics. 2016 06; 48(6):657-66.

Analysis

Is Analysis

False

Is Obsolete

False